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ルートフェノミクス :ビッグデータを活用した新しい根系解析手法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 26660012
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 作物生産科学
研究機関東北大学

研究代表者

田島 亮介  東北大学, (連合)農学研究科(研究院), 助教 (60530144)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2014年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード根系 / イネ / 画像解析 / 作物 / フェノタイピング / モニタリング / モデル
研究成果の概要

「緑の革命」から取り残された地域では低肥沃度であり,そこで肥料等低投入なまま収量をあげられる品種が求められている.それには作物根系が重要であり,根系の情報全般を解析して捉え直すこと,すなわちルートフェノミクスの確立が重要となる.そこで,本研究では栽培期間中に作物根系の画像を効率良く取得して解析するシステムを開発し,それを用いてイネ,ササニシキ/ハバタキの染色体断片置換系統群の根系を解析した.その結果,伸長角度と冠根長に関係する量的遺伝子の候補が第5,第10染色体にそれぞれ存在することが予想された.本研究で開発したシステムはルートフェノミクスの確立に大きく貢献すると考えられる.

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うちオープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] ImageJ を用いた画像解析による根長の評価2014

    • 著者名/発表者名
      田島亮介
    • 雑誌名

      根の研究

      巻: 23 ページ: 75-81

    • NAID

      130005099320

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] The evaluation of root system architecture in rice plant using the data of root distribution2015

    • 著者名/発表者名
      Tajima, R., T. Ito, M. Saito.
    • 学会等名
      Rhizoshere 4
    • 発表場所
      Maastricht Netherlands
    • 年月日
      2015-06-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] イネ根系形成のシミュレーションモデル化の試み2014

    • 著者名/発表者名
      田島亮介,Lionel Dupuy
    • 学会等名
      根研究集会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2014-09-06
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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