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人為的RNA Editingを利用した遺伝コード修復法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 26670167
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 人類遺伝学
研究機関北陸先端科学技術大学院大学

研究代表者

塚原 俊文  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 教授 (60207339)

連携研究者 舘野 賢  兵庫県立大学, 院・生命理学研究科, 教授 (40291926)
鈴木 仁  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 特任助教 (00447690)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2014年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードDeaminase / RNA editing / MS2 / 活性ドメイン / guide RNA / 遺伝子修復 / デアミナーゼ / 活性部位 / ガイドRNA
研究成果の概要

RNA editing機構を模倣して細胞内で人為的かつ部位特異的な塩基の脱アミノ化を誘導するため、ADAR1の活性中心部位とguide RNAをMS2システムを介して結合させた。レポーター遺伝子として、EGFPのNonsense変異体を使用した。これら3つの遺伝子をHEK293細胞に導入し、酵素-RNA複合体を作成させたところ、変異EGFP mRNAが細胞内で修復され、緑色蛍光を発する細胞が観察された。RNAの変異修復は、RT-PCR後にRFLPとsequencingによって確認した。また、ADAR ファミリーのアイソフォームで脱アミノ化による修復効率の相違も調べた。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 5件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Chemical RNA Editing for Genetic Restoration: The Relationship between the Structure and Deamination Efficiency of Carboxyvinyldeoxyuridine Oligodeoxynucleotides2016

    • 著者名/発表者名
      Vu Thi Luyen, Nguyen Thi Kim Thanh, Md Thoufic Anam Azad, Hitoshi Suzuki, and Toshifumi Tsukahara
    • 雑誌名

      Chemical Biology & Drug Design

      巻: 87 号: 4 ページ: 583-593

    • DOI

      10.1111/cbdd.12693

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Changing Blue Fluorescent Protein to Green Fluorescent Protein Using Chemical RNA Editing as a Novel Strategy in Genetic Restoration2015

    • 著者名/発表者名
      Luyen T. Vu, Thanh T. K. Nguyen, Shafiul Alam, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto, Hitoshi Suzuki and Toshifumi Tsukahara
    • 雑誌名

      Chemical Biology & Drug Design

      巻: 86 号: 5 ページ: 1242-1252

    • DOI

      10.1111/cbdd.12592

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Computational extraction of a neural molecular network through alternative splicing2014

    • 著者名/発表者名
      Alam S, Phan HT, Okazaki M, Takagi M, Kawahara K, Tsukahara T, Suzuki H
    • 雑誌名

      BMC Res. Notes

      巻: 7 号: 1 ページ: 934-934

    • DOI

      10.1186/1756-0500-7-934

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Alternative splicing regulation of APP exon 7 by RBFox proteins2014

    • 著者名/発表者名
      Alam S, Suzuki H, Tsukahara T
    • 雑誌名

      Neurochem. Int.

      巻: 78 ページ: 7-17

    • DOI

      10.1016/j.neuint.2014.08.001

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A View of Pre-mRNA Splicing from RNase R Resistant RNAs2014

    • 著者名/発表者名
      Suzuki H, Tsukahara T
    • 雑誌名

      Int. J. Mol. Sci.

      巻: 15 号: 6 ページ: 9331-9342

    • DOI

      10.3390/ijms15069331

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [産業財産権] 塩基置換手段をスクリーニングする方法2015

    • 発明者名
      塚原俊文、藤本健造
    • 権利者名
      北陸先端科学技術大学院大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2015-085414
    • 出願年月日
      2015-04-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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