次世代シークエンサーを用いた遺伝子統合解析による食道癌化学放射線療法耐性の解明

• 研究課題/領域番号: 26861003
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 放射線科学
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 平田 秀成 九州大学, 大学病院, その他 (90721267)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2015年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2014年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
• キーワード: 化学放射線感受性 / 遺伝子異常 / 食道癌 / エキソームシークエンス / RNAシークエンス / メチル化シークエンス / 化学放射線治療 / CRT / 食道扁平上皮癌

研究成果の概要

食道扁平上皮癌に対する化学放射線療法(CRT)耐性獲得機構の解明および感受性予測バイオマーカーの同定は、喫緊の課題である。根治的CRT後遺残・再発の原因遺伝子を明らかにするために、未治療食道扁平上皮癌の生検検体(6症例)ならびにCRT後局所再発病変（2症例）に対して全エキソン解析・メチル化シークエンス、RNAシークエンスを行い、CRT感受性群と耐性群で遺伝子異常の特徴を比較した。従来重要とされてきたTP53変異の有無のみでは、実際のCRT感受性を規定できないことが明かとなった。今後、ゲノム・エピゲノム・トランスクリプト異常とCRT感受性についてより詳細な解析を実施する予定である。

研究成果

• [雑誌論文] Decreased Expression of Fructose-1,6-bisphosphatase Associates with Glucose Metabolism and Tumor Progression in Hepatocellular Carcinoma (2016)
  • 著者名/発表者名: Hirata H, Sugimachi K, Komatsu H, Ueda M, Masuda T, Uchi R, Sakimura S, Nambara S, Saito T, Shinden Y, Iguchi T, Eguchi H, Ito S, Terashima K, Sakamoto K, Hirakawa M, Honda H, Mimori K.
  • 雑誌名: Cancer Res. 巻: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic Landscape of Esophageal Squamous Cell Carcinoma in a Japanese Population. (2016)
  • 著者名/発表者名: G. Sawada (他43名, 山本21番目)
  • 雑誌名: Gastroenterology 巻: 150 号: 5 ページ: 1171-1182
  • DOI: 10.1053/j.gastro.2016.01.035
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Integrated Multiregional Analysis Proposing a New Model of Colorectal Cancer Evolution. (2016)
  • 著者名/発表者名: R. Uchi (他40名, 山本36番目)
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: 12 号: 2 ページ: 1-24
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1005778
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] An Integrative Analysis to Identify Driver Genes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma (2015)
  • 著者名/発表者名: Sawada G, Niida A, Hirata H, Komatsu H, Uchi R, Shimamura T, Takahashi Y, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Takano Y, Ueda M, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Yamasaki M, Tanaka F, Tachimori Y, Kajiyama Y, Natsugoe S, Fujita H, Tanaka Y, Calin G, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10(10) 号: 10 ページ: e0139808-e0139808
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0139808
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Clinical characteristics and outcome of pneumothorax after stereotactic body radiotherapy for lung tumors. (2015)
  • 著者名/発表者名: Asai K, Nakamura K, Shioyama Y, Sasaki T, Matsuo Y, Ohga S, Yoshitake T, Terashima K, Shinoto M, Matsumoto K, Hirata H, Honda H.
  • 雑誌名: Int J Clin Oncol 巻: epub 号: 6 ページ: 1117-21
  • DOI: 10.1007/s10147-015-0833-4
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Downregulation of PRRX1 Confers Cancer Stem Cell-Like Properties and Predicts Poor Prognosis in Hepatocellular Carcinoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirata H, Sugimachi K, Takahashi Y, Ueda M, Sakimura S, Uchi R, Kurashige J, Takano Y, Nanbara S, Komatsu H, Saito T, Shinden Y, Iguchi T, Eguchi H, Atsumi K, Sakamoto K, Doi T, Hirakawa M, Honda H, Mimori K.
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol. 巻: epub 号: S3 ページ: 1402-9
  • DOI: 10.1245/s10434-014-4242-0
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Loss of CDCP1 expression promotes invasiveness and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Sawada G, Takahashi Y, Niida A, Shimamura T, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Uchi R, Takano Y, Ueda M, Hirata H, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K.
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol. 巻: 4 号: S4 ページ: 640-647
  • DOI: 10.1245/s10434-014-3740-4
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Fructose-1,6-biphosphatase発現異常は肝癌の腫瘍進展・糖代謝異常に寄与する (2016)
  • 著者名/発表者名: 平田 秀成、杉町 圭史、増田 隆明、林 直樹、井口 友宏、江口 英利、伊藤修平、寺嶋 広太郎、坂本 勝美、平川 雅和、本田 浩、三森 功士
  • 学会等名: 第18回癌治療増感研究シンポジウム
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 2016-02-05
• [学会発表] 食道発癌・癌進展の宿主側・腫瘍側・疫学環境要因からの三位一体の解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 平田秀成、三森功士
  • 学会等名: がんゲノム・エピゲノムセミナー
  • 発表場所: 花巻
  • 年月日: 2015-10-27
• [学会発表] FBP1 suppresses tumor progression and retrieves altered glucose metabolism in Hepatocellular carcinoma (2015)
  • 著者名/発表者名: Hirata H, Sugimachi K, Komatsu H, Ueda M, Uchi R, Sakimura S, Masuda T, Iguchi T, Eguchi H, Ito S, Hirakawa M, Honda H, Mimori K.
  • 学会等名: 第74回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2015-10-08
• [学会発表] Comprehensive Mutation Analysis of Response to Chemoradiothrapy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma. (2015)
  • 著者名/発表者名: H Hirata, R Uchi, M Ueda, S Sakimura, Y Shinden, T Iguchi, K Atsumi, D Tsurumaru, K Sakamoto, K Sugimachi, M Hirakawa, T Sasaki, K Nakamura, H Honda, K Mimori.
  • 学会等名: 15th International Congress of Radiation Research
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2015-05-25
  • 国際学会
• [学会発表] エキソームシークエンスによる食道癌化学放射線感受性の多様性を規定する網羅的変異解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 平田秀成、内龍太郎、上田正射、﨑村正太郎、小松久晃、南原翔、齋藤衆子、新田吉陽、井口友宏、江口英利、杉町圭史、渥美和重、坂本一美、平川雅和、本田浩、三森功士
  • 学会等名: 第17回癌治療増感研究シンポジウム
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 2015-02-02 – 2015-02-06
• [学会発表] Mutational Analysis of Peritoneal Disseminated Model in Gastric Adenocarcinoma (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirata H, Kurashige J, Sugimachi K, Uchi R, Ueda M, Sakimura S, Takano Y, Shinden Y, Iguchi T, Eguchi H, Hirakawa H, Honda H, Mimori M.
  • 学会等名: 第73回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] 放射線腫瘍医として知っておきたい分子標的治療 －放射線治療との併用を中心に－ (2014)
  • 著者名/発表者名: 平田秀成
  • 学会等名: 第26回九州放射線治療セミナー
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2014-08-09 – 2014-08-10
• [学会発表] Down-regulation of PRRX1 confers cancer stem cell-like properties and poor prognosis in hepatocellular carcinoma (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirata H, Sugimachi K, Uchi R, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Takano Y, Ueda M, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Hirakawa M, Honda H, Mimori M.
  • 学会等名: The 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research
  • 発表場所: San Diego, USA
  • 年月日: 2014-04-05 – 2014-04-09