Mechanistic link between DNA methylation and H3K9 trimethylation in mammalian cells mediated by two novel SRA proteins- Np95 and Np97

• 研究課題/領域番号: 26870847
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: システムゲノム科学; ゲノム生物学
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: SHARIF JAFAR 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 研究員 (00577968)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2015年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2014年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
• キーワード: NP95 / Hemimethylated DNA / SETDB1 / H3K9me3 / Endogenous retroviruses / IAP / Placenta / Development / hemi-methylated DNA / LTR-derived sequences / NP95/UHRF1 / NP97/UHRF2 / DNA methylation / H3K9 trimethylation / Conditional KO / ES cells / ChIP

研究成果の概要

本研究は、NP95と呼ばれるタンパク質が、転写を抑制するメチル化DNAと転写を活性化する非メチル化DNAの中間状態である「ヘミメチルDNA」に結合することにより、抑制型のH3K9ヒストン修飾を解除し、内在性レトロウイルス（ERV） 配列の転写を誘導することを解明した。へミメチルDNAによる転写制御モデルの発見により、メチル化DNAと非メチル化DNAを中心とした転写制御の従来モデルが大きく見直された。

研究成果

• [国際共同研究] University of British Columbia(Canada)
• [国際共同研究] Virginia Tech(米国)
• [雑誌論文] Activation of Endogenous Retroviruses in Dnmt1-/- ESCs Involves Disruption of SETDB1-Mediated Repression by NP95 Binding to Hemimethylated DNA. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sharif J, Endo TA, Nakayama M, Karimi MM, Shimada M, Katsuyama K, Goyal P, Brind'Amour J, Sun MA, Sun Z, Ishikura T, Mizutani-Koseki Y, Ohara O, Shinkai Y, Nakanishi M, Xie H, Lorincz MC, Koseki H.
  • 雑誌名: Cell Stem Cell 巻: Epub ahead of print 号: 1 ページ: 999-999
  • DOI: 10.1016/j.stem.2016.03.013
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [学会発表] Protracted binding of NP95 to hemimethylated DNA disrupts SETDB1-mediated proviral silencing (2015)
  • 著者名/発表者名: Jafar Sharif
  • 学会等名: Keystone Symposia (Epigenetics Z3, 2015)
  • 発表場所: Keystone, Colorado, USA
  • 年月日: 2015-03-30 – 2015-04-03