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ATP駆動サイボーグ回転分子モーターの創生

公募研究

研究領域生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
研究課題/領域番号 26102507
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設)

研究代表者

飯野 亮太  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (70403003)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
2015年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2014年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
キーワード分子モーター / タンパク質工学 / 1分子計測
研究実績の概要

回転分子モーターF1-ATPaseにおけるATP加水分解反応の触媒に重要な役割を果たすαサブユニット上のアミノ酸残基、アルギニンフィンガーの役割を調べるため、アルギニン残基を非天然アミノ酸である2,7-diaminoheptanoic acid(Lyk)に置換した非天然型F1-ATPaseを創生した。具体的には、アンバーコドンを利用して非天然アミノ酸を導入したαサブユニットを無細胞タンパク質発現系で合成し、β、γサブユニットを発現させた大腸菌の破砕液と混合することで再構成させる手法を確立した。
さらに、創生した非天然型F1-ATPaseの1分子回転観察で機能解析を行った。ATP存在下で、非天然型F1-ATPaseは野生型と同様、回転子から見て反時計回りの回転運動を示した。しかしながら、最高回転速度は0.2rpsと野生型の1/500程度に大きく低下しており、高濃度[ATP]においても120度間隔の3か所の停止が観察された。また、ATPの結合速度定数は6.5x10E6 M-1s-1と野生型の1/3程度であった。低濃度[ATP]と高濃度[ATP]の溶液交換実験の結果、長くなっているのは40度サブステップ前の停止であることが明らかとなった。また、ATPγSを基質に用いた1分子回転実験では停止の長さが30倍長くなった。さらに、溶液中に過剰の無機リン酸を加えた際の回転運動への影響は野生型と変わらなかった。これらの結果から、非天然型F1-ATPaseは野生型に比べ、ATPのリン酸結合の開裂が非常に遅くなっていることが明らかとなった。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 2件、 招待講演 7件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] A microfluidic channel method for rapid drug-susceptibility testing of Pseudomonas aeruginosa2016

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Y, Sakakihara S, Grushnikov A, Kikuchi K, Noji H, Yamaguchi A, Iino R, Yagi Y, Nishino K
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 11 号: 2 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0148797

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Single-cell detection and collection of persister bacteria in a directly accessible femtoliter droplet array2016

    • 著者名/発表者名
      Iino R, Sakakihara S, Matsumoto Y, Nishino K
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 1333 ページ: 101-109

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-2854-5_9

    • ISBN
      9781493928538, 9781493928545
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Key Chemical Factors of Arginine Finger Catalysis of F1-ATPase Clarified by an Unnatural Amino Acid Mutation2014

    • 著者名/発表者名
      Yukawa A, Iino R, Watanabe R, Hayashi S and Noji H
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 54 号: 2 ページ: 472-480

    • DOI

      10.1021/bi501138b

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Direct observation of intermediate states during the stepping motion of kinesin-12016

    • 著者名/発表者名
      Ryota Iino
    • 学会等名
      8th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science: Experiments and Simulation
    • 発表場所
      愛知県岡崎市(岡崎コンファレンスセンター)
    • 年月日
      2016-02-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Single-molecule analysis of new molecular motors hydrolyzing crystalline polysaccharides2016

    • 著者名/発表者名
      Ryota Iino
    • 学会等名
      PACCON2016
    • 発表場所
      Bangkok, Thailand (BITEC)
    • 年月日
      2016-02-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Single-molecule high-speed imaging analysis of ATP-driven molecular motors2015

    • 著者名/発表者名
      Ryota Iino
    • 学会等名
      第53回生物物理学会年会シンポジウム「Formation of spatiotemporal dynamic ordering mediated by ATP hydrolysis」
    • 発表場所
      石川県金沢市(金沢大学)
    • 年月日
      2015-09-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生体分子モーターを測る、壊す、創る2014

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      シンポジウム「細胞のメゾスケール構造機能」
    • 発表場所
      京都府京都市(京都大学)
    • 年月日
      2014-12-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Single-molecule imaging analysis of molecular motors2014

    • 著者名/発表者名
      Ryota Iino
    • 学会等名
      The 7th Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences
    • 発表場所
      Seoul, Korea (KAIST)
    • 年月日
      2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生体分子モーターダイナミクスの1分子計測:構造解析と理論予測との協奏を目指して2014

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      TCCI第5回研究会
    • 発表場所
      愛知県岡崎市(岡崎コンファレンスセンター)
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNAを巻き取る分子リール2014

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      第66回日本細胞生物学会大会
    • 発表場所
      奈良県奈良市(奈良県新公会堂)
    • 年月日
      2014-06-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 自然科学研究機構 岡崎統合バイオサイエンスセンター 飯野グループホームページ

    • URL

      https://groups.ims.ac.jp/organization/iino_g/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-28  

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