時空間的な多因子間相互作用の理解による転写ユニティー機構の解明の総括

2022 年度 実績報告書

• 研究領域: 時空間的な多因子間相互作用の理解による転写ユニティー機構の解明
• 研究課題/領域番号: 21H05158
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 二村 圭祐 大阪大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (00462713)
• 研究分担者: 高橋 秀尚 横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (30423544) ; 仙石 徹 横浜市立大学, 医学部, 准教授 (60576312)
• 研究期間 (年度): 2021-08-23 – 2024-03-31
• キーワード: 転写ユニティー / 多因子間相互作用

研究実績の概要

「時空間的な多因子間相互作用の理解による転写ユニティー機構の解明」領域を発展させるためには、領域内で共同研究を推進すること、技術交流を積極的に進めることが重要である。また外部に向けて、領域の活動を積極的に広報することも必要である。現在までに、二村と高橋は共同研究を行い、スプライシング制御因子が転写を直接制御することを見出し、その成果を論文として発表した。また、二村は開発中の新規タンパク質を構造学的視点から深めるために仙石とディスカッションを行っている。また、高橋は仙石と転写ユニティーを構築する因子に関して共同研究を行っている。新たな技術を開発するために、領域内で積極的に議論を行い、現在の技術でアプローチできない課題や、その課題を解決するために開発するべき技術の方向性などに関するブレインストーミングを行っている。その中から、転写ユニティー機構をさらに詳細に解析する新技術を考案し、現在その開発に向けて準備を行っている。また、構造生物学においてAlpha fold2のような構造を予測・解析する新規手法についても積極的に取り入れ、領域内の研究の進捗を加速するために利用している。
広報のために転写ユニティー領域のホームページを公開している。今後、研究業績など、領域の活動を広く国民に対して公開していく予定である。また、領域内での研究交流セミナーを行うことで、さらに共同研究を増やし、迅速に研究成果を論文化できるように進めていく。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

現在までに、領域として複数の論文が受理されている。また、領域内の共同研究も進み、その成果の1つを論文として発表できた。そのため、当初の予定通り進捗していると考える。

今後の研究の推進方策

これまでの1年半の研究期間において積極的に共同研究を進めることが出来た。今年度においては、これまでに行った共同研究の成果を論文として発表することを目指す。また、各研究グループの研究の進捗をさらに加速するため、領域内の研究交流セミナーを開催することを考えている。

研究成果

• [雑誌論文] Brain monoamine vesicular transport disease caused by homozygous SLC18A2 variants: A study in 42 affected individuals (2023)
  • 著者名/発表者名: Saida Ken、Maroofian Reza、Sengoku Toru、et al.
  • 雑誌名: Genetics in Medicine 巻: 25 ページ: 90～102
  • DOI: 10.1016/j.gim.2022.09.010
  • 査読あり
• [雑誌論文] MED26‐containing Mediator may orchestrate multiple transcription processes through organization of nuclear bodies (2023)
  • 著者名/発表者名: Suzuki Hidefumi、Furugori Kazuki、Abe Ryota、Ogawa Shintaro、Ito Sayaka、Akiyama Tomohiko、Horiuchi Keiko、Takahashi Hidehisa
  • 雑誌名: BioEssays 巻: 45 ページ: -
  • DOI: 10.1002/bies.202200178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Design and synthesis of ether derivatives of spliceostatin A and their biological evaluation towards prostate cancer treatment (2023)
  • 著者名/発表者名: Hirabayashi Satoru、Li Yue、Ohta Noriko、Ishibashi Airi、Yoshikawa Yusuke、Lin Bangzhong、Fumimoto Megumi、Takehara Tsunayoshi、Nunomura Kazuto、Suzuki Takeyuki、Haruta Junichi、Nimura Keisuke、Arisawa Mitsuhiro
  • 雑誌名: Tetrahedron Letters 巻: 114 ページ: 154288～154288
  • DOI: 10.1016/j.tetlet.2022.154288
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Pilot study for the treatment of cutaneous neurofibromas in neurofibromatosis type 1 patients using topical sirolimus gel (2023)
  • 著者名/発表者名: Wataya-Kaneda Mari、Watanabe Yoshiyuki、Nakamura Ayumi、Yamamoto Kouji、Okada Kiyoshi、Maeda Shinichiro、Nimura Keisuke、Saga Kotaro、Katayama Ichiro
  • 雑誌名: Journal of the American Academy of Dermatology 巻: 88 ページ: 877～880
  • DOI: 10.1016/j.jaad.2022.08.066
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA barcoding and gene expression recording reveal the presence of cancer cells with unique properties during tumor progression (2022)
  • 著者名/発表者名: Umeki Yuka、Ogawa Noriaki、Uegaki Yuko、Saga Kotaro、Kaneda Yasufumi、Nimura Keisuke
  • 雑誌名: Cellular and Molecular Life Sciences 巻: 80 ページ: 17
  • DOI: 10.1007/s00018-022-04640-4
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of Malignant Cell Populations Associated with Poor Prognosis in High-Grade Serous Ovarian Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing (2022)
  • 著者名/発表者名: Sumitani Naoki、Ishida Kyoso、Sawada Kenjiro、Kimura Tadashi、Kaneda Yasufumi、Nimura Keisuke
  • 雑誌名: Cancers 巻: 14 ページ: 3580～3580
  • DOI: 10.3390/cancers14153580
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Dual function of SF3B2 on chromatin and RNA to regulate transcription in head and neck squamous cell carcinoma (2022)
  • 著者名/発表者名: Kitamura Koji、Suzuki Hidefumi、Abe Ryota、Inohara Hidenori、Kaneda Yasufumi、Takahashi Hidehisa、Nimura Keisuke
  • 雑誌名: Cell & Bioscience 巻: 12 ページ: 92
  • DOI: 10.1186/s13578-022-00812-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Peroxisomal Membrane Protein PMP34 Is Involved in the Human Papillomavirus Infection Pathway (2022)
  • 著者名/発表者名: Ito Rie、Kitamura Koji、Inohara Hidenori、Yusa Kosuke、Kaneda Yasufumi、Nimura Keisuke
  • 雑誌名: Frontiers in Virology 巻: 2 ページ: 870922
  • DOI: 10.3389/fviro.2022.870922
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] LimF is a versatile prenyltransferase for histidine-C-geranylation on diverse non-natural substrates (2022)
  • 著者名/発表者名: Zhang, Yuchen; Hamada, Keisuke; Nguyen, Dinh Thanh; Inoue, Sumika; Satake, Masayuki; Kobayashi, Shunsuke; Okada, Chikako; Ogata, Kazuhiro; Okada, Masahiro; Sengoku, Toru; Goto, Yuki; Suga, Hiroaki
  • 雑誌名: Nature Catalysis 巻: 5 ページ: 682-693
  • DOI: 10.1038/s41929-022-00822-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] De Novo Discovery of Thiopeptide Pseudo-natural Products Acting as Potent and Selective TNIK Kinase Inhibitors (2022)
  • 著者名/発表者名: Vinogradov Alexander A.、Zhang Yue、Hamada Keisuke、Chang Jun Shi、Okada Chikako、Nishimura Hirotaka、Terasaka Naohiro、Goto Yuki、Ogata Kazuhiro、Sengoku Toru、Onaka Hiroyasu、Suga Hiroaki
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 巻: 144 ページ: 20332～20341
  • DOI: 10.1021/jacs.2c07937
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] De novo ARF3 variants cause neurodevelopmental disorder with brain abnormality (2022)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto Masamune、Sasaki Kazunori、Sugie Atsushi、et al.
  • 雑誌名: Human Molecular Genetics 巻: 31 ページ: 69～81
  • DOI: 10.1093/hmg/ddab224
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural basis of transcription regulation by CNC family transcription factor, Nrf2 (2022)
  • 著者名/発表者名: Sengoku Toru、Shiina Masaaki、Suzuki Kae、Hamada Keisuke、Sato Ko、Uchiyama Akiko、Kobayashi Shunsuke、Oguni Asako、Itaya Hayato、Kasahara Kota、Moriwaki Hirotomo、Watanabe Chiduru、Honma Teruki、Okada Chikako、Baba Shiho、Ohta Tsutomu、Motohashi Hozumi、Yamamoto Masayuki、Ogata Kazuhiro
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 50 ページ: 12543～12557
  • DOI: 10.1093/nar/gkac1102
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Generation and Utilization of a Monoclonal Antibody against Hepatitis B Virus Core Protein for a Comprehensive Interactome Analysis (2022)
  • 著者名/発表者名: Nakai Yusuke、Miyakawa Kei、Yamaoka Yutaro、Hatayama Yasuyoshi、Nishi Mayuko、Suzuki Hidefumi、Kimura Hirokazu、Takahashi Hidehisa、Kimura Yayoi、Ryo Akihide
  • 雑誌名: Microorganisms 巻: 10 ページ: 2381～2381
  • DOI: 10.3390/microorganisms10122381
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Author Correction: Angiotensin II type-1 receptor-associated protein interacts with transferrin receptor-1 and promotes its internalization (2022)
  • 著者名/発表者名: Abe Eriko、Yamashita Akio、Hirota Keigo、Yamaji Takahiro、Azushima Kengo、Urate Shingo、Suzuki Toru、Tanaka Shohei、Taguchi Shinya、Tsukamoto Shunichiro、Uehara Tatsuki、Wakui Hiromichi、Tamura Kouichi、Takahashi Hidehisa
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 12 ページ: 17376
  • DOI: 10.1038/s41598-022-25880-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] PAR3 restricts the expansion of neural precursor cells by regulating hedgehog signaling (2022)
  • 著者名/発表者名: Hirose Tomonori、Sugitani Yoshinobu、Kurihara Hidetake、Kazama Hiromi、Kusaka Chiho、Noda Tetsuo、Takahashi Hidehisa、Ohno Shigeo
  • 雑誌名: Development 巻: 149 ページ: dev199931
  • DOI: 10.1242/dev.199931
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The 3′ Pol II pausing at replication-dependent histone genes is regulated by Mediator through Cajal bodies’ association with histone locus bodies (2022)
  • 著者名/発表者名: Suzuki Hidefumi、Abe Ryota、Shimada Miho、Hirose Tomonori、Hirose Hiroko、Noguchi Keisuke、Ike Yoko、Yasui Nanami、Furugori Kazuki、Yamaguchi Yuki、Toyoda Atsushi、Suzuki Yutaka、Yamamoto Tatsuro、Saitoh Noriko、Sato Shigeo、Tomomori-Sato Chieri、Conaway Ronald C.、Conaway Joan W.、Takahashi Hidehisa
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 13 ページ: 2905
  • DOI: 10.1038/s41467-022-30632-w
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Pol Ⅱ動態の新常識―ポージングによる新たな転写制御機構 (2022)
  • 著者名/発表者名: 高橋秀尚
  • 雑誌名: 実験医学増刊 巻: 40 ページ: 1910-1917
• [学会発表] 生体内における非増殖性センダイウイルスHVJ-Eによる抗腫瘍効果誘導メカニズムの解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: 日本遺伝子細胞治療学会若手研究セミナー
• [学会発表] 多因子間相互作用による遺伝子発現制御機構の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 招待講演
• [学会発表] 生体内における非増殖性ウイルスHVJ-Eによる抗腫瘍効果誘導メカニズムの解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: 日本遺伝子細胞治療学会
  • 招待講演
• [学会発表] NSD2によるヌクレオソーム上H3 Lys36メチル化の構造基盤 (2022)
  • 著者名/発表者名: 仙石 徹
  • 学会等名: 日本エピジェネティクス研究会
• [学会発表] NSD2/MMSETによるヌクレオソーム上H3K36メチル化とその制御の構造基盤 (2022)
  • 著者名/発表者名: 仙石 徹
  • 学会等名: 日本生化学会
  • 招待講演
• [学会発表] ヌクレオソーム上H2Bモノユビキチン化の構造基盤 (2022)
  • 著者名/発表者名: 大西 修平、内山 琴音、佐藤 光、岡田 千佳子、小林 俊介、西澤 知宏、濡木 理、緒方 一博、仙石 徹
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 招待講演
• [学会発表] Poll Ⅱの一時停止および核体凝集体の制御におけるメディエーター複合体の役割 (2022)
  • 著者名/発表者名: 鈴木秀文, 阿部竜太, 嶋田美穂, 廣瀬智威, 廣瀬博子, 野口慶介, 池 陽子, 安井七海, 古郡華月, 山口雄輝, 豊田 敦, 鈴木 穣, 山本達郎, 斉藤典子, Shigeo Sato, Chieri Tomomori-Sato, Ronald C. Conaway, Joan W. Conaway, 高橋秀尚
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] メディエーター複合体による新規の転写スピード調節機構の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 鈴木秀文, 阿部竜太, 嶋田美穂, 廣瀬智威, 廣瀬博子, 野口慶介, 古郡華月, 池 陽子, 安井七海, 山口雄輝, 豊田 敦, 鈴木 穣, 山本達郎, 斉藤典子, Ronald C. Conaway, Joan W. Conaway, 高橋 秀尚
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] 新規のin situビオチン標識法を用いたCajal body構成因子のマルチオミクス解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 野口慶介, 鈴木秀文, 阿部竜太, 堀内恵子, 秋山智彦, 池 陽子, 井野陽子, 木村弥生, 梁 明秀,山口雄輝, 高橋秀尚
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2022年大会
  • 招待講演
• [学会発表] 新規ビオチン標識法を用いたマルチオミックス解析によるCajal body構成因子の網羅的解析とCajal body形成メカニズムの解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 野口慶介, 鈴木秀文, 阿部竜太, 池 陽子, 井野洋子, 木村弥生, 梁 明秀, 土井 宏, 田中章景, 山口雄輝, 高橋秀尚
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] 大脳発生過程においてPAR3はヘッジホッグ・シグナリングの制御を介して神経前駆細胞の増殖に制限をかける (2022)
  • 著者名/発表者名: 廣瀬智威, 杉谷善信, 栗原秀剛, 風間宏美, 日下智保, 野田哲生, 髙橋秀尚, 大野茂男
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Interaction of major and minor spliceosomes in regulating splicing of U12-type introns (2022)
  • 著者名/発表者名: 堀内恵子, 高橋秀尚, Juan Valcrcel
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] LECのコンポーネントZC3H8による転写終結制御機構の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 鬼澤理紗, 野口慶介, 仙石 徹, 緒方一博, 鈴木秀文, 高橋秀尚
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] メディエーター複合体の核内凝集体における転写制御機構の解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 馬目博志, 鈴木秀文, 高橋秀尚
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] ７SK snRNAによるp-TEFb局在化阻害によるsnRNA遺伝子の転写終結制御 (2022)
  • 著者名/発表者名: 小川真太郎, 鈴木秀文, 高橋秀尚
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 転写バーストにおけるTFIIDのサブユニットTAF７の機能解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 古郡華月, 鈴木秀文, 阿部竜太, 高橋秀尚
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] LECのコンポーネントICE2による転写終結制御機構の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 寺内佑希, 仙石 徹, 緒方一博, 鈴木秀文, 小川真太郎, 高橋秀尚
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [備考] 転写ユニティー領域のホームページ
  • URL: https://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/gts/TranscriptionUnity/
• [産業財産権] 生体試料中の多因子間相互作用を同定する方法およびキット (2022)
  • 発明者名: 二村圭祐
  • 権利者名: 二村圭祐
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 特願2022-068519
  • 外国