• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2010 年度 実績報告書

ゲノムアダプテーションのシステム的理解

総括班

研究領域ゲノムアダプテーションのシステム的理解
研究課題/領域番号 22125001
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

研究機関大阪大学

研究代表者

篠原 彰  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (00252578)

研究分担者 岩崎 博史  東京工業大学, 生命理工, 教授 (60232659)
伊藤 武彦  東京工業大学, 生命理工, 教授 (90501106)
白髭 克彦  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (90273854)
石井 俊輔  独立行政法人理化学研究所, 石井分子遺伝学研究室, 主任研究員 (00124785)
石井 浩二郎  大阪大学, 生命機能研究科, 特任准教授 (40360276)
キーワード染色体 / 相同組換え / 減数分裂 / シナプトネマ複合体
研究概要

本領域研究において、異分野の研究者が十分な連携の元で研究を推進するために、総括班の役割は非常に重要となる。総括班は、定期的に会議を開催することで、各計画研究と公募研究の統括、評価を行うばかりでなく、本研究領域の効率的かつ効果的推進に必要な環境整備、情報収集、広報活動を積極的に行なった。本領域研究の基盤技術となるのが、ChIP-Seq、生物個体の高速DNA塩基配列、SNP配列決定法である。このため、最新の性能を持つ次世代DNAシークエンサ、Solid HQ(ABI社)を総括班で購入した。すでに東工大で伊藤が運用しているシークエンサを含め,複数の次世代DNAシークエンサを平行運用することにより、それぞれの長所を生かし、迅速、かつ効率良く本領域の班員が必要とする解析、測定基盤が整備できた。さらに、次世代DNAシークエンサが生み出す大量の情報を効率良く,演算処理する必要がある。そのために高速、かつ高容量をもつ高性能コンピュータを初期に投入し、データの大量処理を可能とした。広報活動の一環として、国際シンポジウムを、班会議を2回開催した、領域の研究の方向性の確認とそれぞれの研究の進捗状況について議論した。また、新学術領域の広報のためのHP(ホームページ)の作成した。大型予算の社会還元を目指し、関連分野を含めライフサイエンスの普及を行うため、高等学校への出前講義を行う形態を模索し、4回の出前講義を行った。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The cyclin-dependent kinase (CDK) promote formation of the synaptonemal complex in yeast meiosis2010

    • 著者名/発表者名
      Zhu, Z., Mori, S., Oshiumi, H, Matsuzaki, K., Shinohara, M, Shinohara, A
    • 雑誌名

      Genes Cells

      巻: 15 ページ: 1036-1050

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic Analysis of Baker's Yeast Msh4-Msh5 Reveals a Threshold Crossover Level for Meiotic Viability2010

    • 著者名/発表者名
      Nishant, K.T., C.Chen, M.Shinohara, A.Shinohara, E.Alani
    • 雑誌名

      PLoS Genet

      巻: 6 ページ: e1001083

    • 査読あり
  • [学会発表] The PCSS (Psy3-Csm2-Shu1-Shu2) complex, a new Rad51 mediator in homologous recombination2011

    • 著者名/発表者名
      篠原彰
    • 学会等名
      Keystone Symposia on DNA replication and recombination
    • 発表場所
      Keystone, CO, USA(招待講演)
    • 年月日
      20110227-20110304
  • [学会発表] CDK (cyclin-dependent kinase)- and DDK (Dbf4-dependent kinase)-dependent regulation of chromosome movements in meiosis2010

    • 著者名/発表者名
      篠原彰
    • 学会等名
      GRC meeting on Meiosis
    • 発表場所
      New London, NH, USA(招待講演)
    • 年月日
      20100613-20100617
  • [学会発表] The PCSS (Psy3-Csm2-Shu1-Shu2) complex plays a role in Rad51-assembly in homologous recombination2010

    • 著者名/発表者名
      篠原彰
    • 学会等名
      EMBO workshop on recombination and connection to sumo and ubiqutin module
    • 発表場所
      Il Cicco, Italy(招待講演)
    • 年月日
      20100518-20100521
  • [備考]

    • URL

      http://www.protein.osaka-u.ac.jp/genome/Shinohara-HP-index.html

URL: 

公開日: 2013-06-26  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi