ゲノムアダプテーションのシステム的理解

2015 年度 実績報告書

• 研究領域: ゲノムアダプテーションのシステム的理解
• 研究課題/領域番号: 22125001
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 篠原 彰 大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (00252578)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: 染色体 / 染色体適応 / ゲノムアダプテーション / 減数分裂 / 生殖細胞

研究実績の概要

減数分裂では組換えにより、父親、母親由来のゲノム情報の混ぜ合せが起こるだけでなく、”新規のゲノム変動”が配偶子に生じ、それが次世代の表現型に影響を与えること（ゲノムアダプテーション）が近年知られつつある。このようなゲノムアダプテーションを介して、ゲノムの多様性が生物集団の中に生じ、長期的には新しいゲノムを生み出す言動力になっていると考えられている。本新学術領域はゲノムアダプテーションの分子レベルでの仕組みを明らかにすること、様々な生物で見られる特異的ゲノムアダプテーション現象を解析する、ゲノムアダプテーションを解析するツールを開発すること、を目的としていた。平成22年度に開始した本領域研究は２６年度が最終年度にあたる。本新学術領域の研究の進展を図ると共に、研究成果をまとめることが大切になる。特に、異分野の研究者が十分な連携の元で研究を推進した成果をまとめため、総括班が非常に重要な役割を担っている。過去５年間のまとめは、２６年度末に行った。さらに新学術のまとめを行うため、評価のための資料を作成し、ヒアリウングを受け、A-の評価を得た。また、最終国際シンポジウムとして、平成２８年３月１日から３日まで、淡路島夢舞台国際会議場で、新しくできた新学術領域“染色体OS”(代表、東大白髭克彦)と合同で開催した。外国人招待講演者に加え、若手の１０名の発表を行った。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [国際共同研究] New York University(米国)
  • 国名: 米国
  • 外国機関名: New York University
• [国際共同研究] Chung-Ang University(韓国)
  • 国名: 韓国
  • 外国機関名: Chung-Ang University
• [国際共同研究] IISER, Thiruvananthapuram(India)
  • 国名: インド
  • 外国機関名: IISER, Thiruvananthapuram
• [国際共同研究] FMI for Biomedical Research(Switzerland)
  • 国名: スイス
  • 外国機関名: FMI for Biomedical Research
• [雑誌論文] The Paf1 Complex Shapes the Landscape of Double-strand Breaks along Meiotic Chromosomes in Saccharomyces cerevisiae (2016)
  • 著者名/発表者名: Santosh, G. K., Patel, K.J., Colletti M.M., Sasanuma, H., Shinohara, M., Hochwagen, A., and A. Shinohara
  • 雑誌名: Genetics 巻: 202 ページ: 497-512
  • DOI: 10.1534/genetics. 115.177287
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Chromosome synapsis alleviates Mek1-dependent suppression of meiotic DNA repair. (2016)
  • 著者名/発表者名: Subramanian, V.V., MacQueen, A. J., Vader, G., Shinohara, M., Borde, V., Shinohara, A. and A. Hochwagen
  • 雑誌名: Current Biology 巻: 14 ページ: e1002369.
  • DOI: 10.1371/journal.pbio.1002369.
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Rad61/Wpl1(Wapl), a cohesin regulator, controls chromosome compaction during meiosis. (2016)
  • 著者名/発表者名: Challa, KK., Lee, MS., Shinohara, M., Kim, K.m and A. Shinohara.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: in press ページ: gkw034
  • DOI: 0.1093/nar/gkw034
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] DNA damage response clamp contributes to chromosomal assembly of ZMM-SIC pro-crossover factors during meiosis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Shinohara, M, Hayashihara, K., Grubb, J.T., Bishop, D.K., and A. Shinohara.
  • 雑誌名: J. Cell Sci. 巻: 128 ページ: 1494-1506
  • DOI: 10.1242/jcs.161554
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] ATM and SIRT6/SNF2H mediate transient H2AX stabilization when DSBs form by blocking HUWE1 to allow efficient γH2AX foci formation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Atsumi, Y., Minakawa, Y., Ono, M., Dobashi, S., Snohe, K., Shinohara, A., Takeda, S., Takagi, M., Takamatsu, N., Nakagama, H., Teraoka, H., and K.-I. Yoshioka
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 13 ページ: 2728-2740
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2015.11.054.
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] Prophase pathway for cleavage-independent removal of cohesin from chromosome arms during late prophase-I in meiosis. EMBO workshop on Meiosis (2016)
  • 著者名/発表者名: Challa, K., Shinohara, M. A. Shinohara.
  • 学会等名: International symposium on Chromosome OS
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場（兵庫県・淡路市）
  • 年月日: 2016-03-01 – 2016-03-03
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Prophase pathway for cleavage-independent removal of cohesin from chromosome arms during late prophase-I in meiosis. EMBO workshop on Meiosis (2015)
  • 著者名/発表者名: Challa, K., Shinohara, M. A. Shinohara.
  • 学会等名: FAOBMB meeting
  • 発表場所: Hyderabad, India
  • 年月日: 2015-11-26 – 2015-11-30
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Prophase pathway for cleavage-independent removal of cohesin from chromosome arms during late prophase-I in meiosis. EMBO workshop on Meiosis (2015)
  • 著者名/発表者名: Challa, K., Shinohara, M. A. Shinohara.
  • 学会等名: International RecA and chromosome dynamics meeting
  • 発表場所: Taipei, Taiwan
  • 年月日: 2015-09-16 – 2015-09-17
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Prophase pathway for cleavage-independent removal of cohesin from chromosome arms during late prophase-I in meiosis. EMBO workshop on Meiosis (2015)
  • 著者名/発表者名: Challa, K., Shinohara, M. A. Shinohara.
  • 学会等名: EMBO workshop on meiosis
  • 発表場所: Oxford, UK
  • 年月日: 2015-09-01 – 2015-09-03
  • 国際学会
• [学会発表] Prophase pathway for cleavage-independent removal of cohesin from chromosome arms during late prophase-I in meiosis. EMBO workshop on Meiosis (2015)
  • 著者名/発表者名: A. Shinohara.
  • 学会等名: Meiosis meeting in Spain
  • 発表場所: Salamanca, Spain
  • 年月日: 2015-06-04 – 2015-06-06
  • 国際学会
• [備考] 大阪大学蛋白質研究所ゲノム～染色体機能研究室ホームページ
  • URL: http://www.protein.osaka-u.ac.jp/genome/Shinohara-HP-index.html
• [学会・シンポジウム開催] International Symposium on Chromosome OS (2016)
  • 発表場所: 淡路島夢舞台国際会議場、兵庫県淡路市
  • 年月日: 2016-03-01 – 2016-03-03