ゲノムを支える非コードＤＮＡ領域の機能

2015 年度 実績報告書

• 研究領域: ゲノムを支える非コードＤＮＡ領域の機能
• 研究課題/領域番号: 23114001
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 小林 武彦 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (40270475)
• 研究分担者: 中山 潤一 名古屋市立大学, 大学院システム自然科学研究科, 教授 (60373338) ; 太田 邦史 東京大学, 総合文化研究科, 教授 (90211789)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: 非コードDNA領域 / 染色体 / ゲノムの安定性 / クロマチン構造 / インターメア / セントロメア / テロメア

研究実績の概要

真核細胞ゲノムの大半はタンパク質をコードしていない非コードDNA領域である。この領域は染色体を制御、維持する作用を担っていると考えられるが、その実体は不明な点がほとんどである。本研究領域では研究者間の強力な連携体制を築き、非コードDNA領域による染色体制御機構の全貌解明を目的とする。本総括班では、各研究者間の共同研究・情報交換の促進や、対外的な成果発表・情報発信、我が国の関連領域への波及効果促進などを目指す。
本年度も当初の計画通り領域ホームページの更新、ニュースレター刊行を行った。８月には全班員参加で領域会議を葉山で開催した。続けて同月、海外から５名の研究者を招聘し外部評価を兼ねた国際シンポジウム「Non-coding DNA and Chromosome Integrity」を開催した。概ね高評価をいただけた。また3月には、過去の公募班員やこれまでに領域の研究計画に参画した学生、ポスドクなどの若手にも参加してもらい「終了シンポジウム」を東京大学で行った。シンポジウムでは、５年間の総括に加え、さらなる本分野の発展を目指し、柳田充弘評価委員による講演「染色体研究の展望」、最後に評価委員の５名先生をパネラーに迎え、「ゲノム研究の未来」について全員で議論した。学術調査官の先生にはすべての会議にはご参加いただき適切なアドバイスを頂戴した。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] More than 10% of yeast genes are related to genome stability and influence cellular senescence via rDNA maintenance (2016)
  • 著者名/発表者名: Saka K, Takahashi A, Sasaki M, Kobayashi T
  • 雑誌名: Nuclei Acid Res 巻: on line ページ: on line
  • DOI: 10.1093/nar/gkw110
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Extended string-like binding of the phosphorylated HP1α N-terminal tail to the lysine 9-methylated histone H3 tail. (2016)
  • 著者名/発表者名: Shimojo H, Kawaguchi A, Oda T, Hashiguchi N, Omori S, Moritsugu K, Kidera A, Hiragami-Hamada K, Nakayama J, Sato M, Nishimura Y.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 6 ページ: on line
  • DOI: 10.1038/srep22527.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Gic1 is a novel heterochromatin boundary protein in vivo. (2016)
  • 著者名/発表者名: Mitsumori R, Shinmyozu K, Nakayama J, Uchida H, Oki M.
  • 雑誌名: Genes Genet Syst. 巻: in press ページ: in press
  • DOI: in press
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The Human PolI Transcription Terminator Complex Acts as a Replication Fork Barrier that Coordinates the Progress of Replication with rRNA Transcription Activity. (2015)
  • 著者名/発表者名: Akamatsu Y, Kobayashi T.
  • 雑誌名: Mol Cell Biol 巻: 35 ページ: 1871-1881
  • DOI: 10.1128/MCB.01521-14
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Glycerophospholipid regulation of modality-specific sensory axon guidance in the spinal cord. (2015)
  • 著者名/発表者名: Guy AT, Nagatsuka Y, Ooashi N, Inoue M, Nakata A, Greimel P, Inoue A, Nabetani T, Murayama A, Ohta K, Ito Y, Aoki J, Hirabayashi Y, Kamiguchi H.
  • 雑誌名: Science 巻: 349 ページ: 974-977
  • DOI: 10.1126/science.aab3516
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Dynamic transition of transcription and chromatin landscape during fission yeast adaptation to glucose starvation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Oda A, Takemata N, Hirata Y, Miyoshi T, Suzuki Y, Sugano S, Ohta K.
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 20 ページ: 392-407
  • DOI: 10.1111/gtc.12229
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Environmental Factors Affecting Pupation Decision in the Horned Flour Beetle Gnatocerus cornutus. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ozawa T, Ohta K, Shimada M, Okada K, Okada Y.
  • 雑誌名: Zoolog Sci 巻: 32 ページ: 183-187
  • DOI: http://dx.doi.org/10.2108/zs140203
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] ヘテロクロマチン構造形成におけるCLRC複合体の役割 (2016)
  • 著者名/発表者名: 中山潤一
  • 学会等名: 第33回染色体ワークショップ・第14回核ダイナミクス研究会 合同大会
  • 発表場所: 松島一の坊（宮城県宮城郡松島町）
  • 年月日: 2016-01-13 – 2016-01-13
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス時のセンス・アンチセンス長鎖非コードＲＮＡを介した遺伝子発現制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙 太田邦史
  • 学会等名: BMB2015
  • 発表場所: ポートピアホテル（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-02 – 2015-12-02
• [学会発表] rDNA stability determines the faye of cell (2015)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T
  • 学会等名: 国際シンポジウムMolecular Biology of Ageing
  • 発表場所: オランダ、フローリンゲン
  • 年月日: 2015-10-25 – 2015-10-28
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] More than 10 % of yeast genes are related to genome stability and influence cellular senescence via rDNA maintenance. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T
  • 学会等名: 国際シンポジウムNon-coding DNA and Chromosomal Integrity
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場（兵庫県淡路市）
  • 年月日: 2015-08-07 – 2015-08-08
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Crosstalk between histone modifications during heterochromatin assembly. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakayama J.
  • 学会等名: 第8回分裂酵母国際学会
  • 発表場所: 生田神社会館（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-06-22 – 2015-06-22
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Long noncoding RNAs stimulate promoter binding of the transcription factor Atf1 by antagonizing the Grougho/Tup1-like corepressors Tup11 and Tup12 (2015)
  • 著者名/発表者名: Takemata N, Ohta K
  • 学会等名: Pombe2015
  • 発表場所: 生田神社会館（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-06-21 – 2015-06-26
  • 国際学会
• [図書] 岩波ジュニア新書「寿命はなぜ決まっているのかー長生き遺伝子のヒミツー」 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小林武彦
  • 総ページ数: 240
  • 出版者: 岩波書店
• [図書] 岩波ジュニア新書「生命デザイン学入門」 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小川（西秋）葉子、太田邦史
  • 総ページ数: 224
  • 出版者: 岩波書店
• [図書] ゲノムを司るインターメア：非コードDNAの新たな展開 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小林武彦 編
  • 総ページ数: 248
  • 出版者: 化学同人
• [図書] エピジェネティクス革命 (2015)
  • 著者名/発表者名: ネッサ・キャリー著 中山潤一訳
  • 総ページ数: 428
  • 出版者: 丸善出版
• [備考] ゲノムを支える非コードDNA領域の機能
  • URL: http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/~jnakayam/ncDNA.html
• [備考] 小林研究室
  • URL: http://lafula-com.info/kobayashiken/CytoGen/index.html
• [備考] 中山研究室
  • URL: http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/~jnakayam/ncDNA.html
• [備考] 太田研究室
  • URL: http://www.ohta-lab.c.u-tokyo.ac.jp
• [産業財産権] 空間的な近さの概念を用いた生体分子データの３次元構造の再構 (2016)
  • 発明者名: 平田祥人、小田有沙、太田邦史、合原一幸
  • 権利者名: 平田祥人、小田有沙、太田邦史、合原一幸
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 特願2016-023214
  • 出願年月日: 2016-02-10
• [学会・シンポジウム開催] Non-coding DNA and Chromosomal Integrity (2015)
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場（兵庫県淡路市）
  • 年月日: 2015-08-07 – 2015-08-08