メリステムにおける遺伝子産物の発現と細胞内動態の高感度解析

2012 年度 研究成果報告書

• 研究領域: 植物メリステムと器官の発生を支える情報統御系
• 研究課題/領域番号: 19060016
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 荒木 崇 京都大学, 大学院・生命科学研究科, 教授 (00273433)
• 研究分担者: 福田 裕穂 東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (10165293) ; 町田 泰則 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80175596) ; 深城 英弘 神戸大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (80324979) ; 島本 功 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (10263427) ; 山本 興太朗 北海道大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80142008)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2012
• キーワード: 植物 / 生体分子 / 網羅的遺伝子解析 / 分子間相互作用 / イメージング / マイクロアレイ / タイリングアレイ / ジーンチップ

研究概要

班員からの依頼を受け、網羅的な遺伝子発現解析を行い、そのデータを提供することによる支援をおこなった(のべ39研究室・計143件)。これらの解析から、ペプチドと植物ホルモンとのシグナル伝達のクロストークの発見をはじめとする、植物メリステム研究に寄与する数多くの成果が挙がった。また、BiFCベクターの配布と共焦点レーザー顕微鏡によるイメージング解析支援(15研究室・計15件)により、メリステム機能に関わる重要な制御蛋白質間の植物細胞内における相互作用が明らかになり、植物メリステム研究に寄与する成果に結びついた。

研究成果

• [雑誌論文] Phloem long-distance delivery of FLOWERING LOCUS T (FT) to the apex (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoo, S.-C., Chen, C., Rojas, M., Daimon, Y., Ham, B.-K., Araki, T., and Lucas, W
  • 雑誌名: Plant Journal 巻: Vol.74(印刷中)
  • DOI: DOI:10.1111/tpj.12213
  • 査読あり
• [雑誌論文] BRANCHED1 interacts with FLOWERING LOCUS T to repress the floral transition of the axillary meristems in Arabidopsis (2013)
  • 著者名/発表者名: Niwa, M., Daimon, Y., Kurotani, K., Higo, A., Pruneda-Paz, J.L., Breton, G., Mitsuda, N., Kay, S.A., Ohme-Takagi, M., Endo, M., and Araki, T
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: Vol.25、No.4 ページ: 1228-1242
  • DOI: DOI:10.1105/tpc.112.109090
  • 査読あり
• [雑誌論文] An atypical bHLH transcription factor regulate early xylem development downstream of auxin (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohashi-Ito, K., Matsukawa, M., and Fukuda, H
  • 雑誌名: Plant & Cell Physiology 巻: Vol.54、No.3 ページ: 398-405
  • 査読あり
• [雑誌論文] The florigen genes FT and TSF modulate lateral shoot outgrowth in Arabidopsis thaliana (2013)
  • 著者名/発表者名: Hiraoka, K., Yamaguchi, A., Abe, M., and Araki, T
  • 雑誌名: Plant & Cell Physiology 巻: Vol.54、No.3 ページ: 352-368
  • DOI: DOI:10.1093/pcp/pcs168
  • 査読あり
• [雑誌論文] Plant meristems and organogenesis: the new era of plant developmental research. (Editorial) (2013)
  • 著者名/発表者名: Machida, Y., Fukaki, H., and Araki, T
  • 雑誌名: Plant & Cell Physiology 巻: Vol.54、No.3 ページ: 295-301
  • DOI: DOI:10.1093/pcp/pct034
• [雑誌論文] Auxin-associated initiation of vascular cell differentiation by LONESOME HIGHWAY (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohashi-Ito, K., Obuchi, M., Kojima, M., Sakakibara, H., and Fukuda, H
  • 雑誌名: Development 巻: Vol.140、No.4 ページ: 765-769
  • DOI: DOI:10.1242/dev.087924
  • 査読あり
• [雑誌論文] The proteasome is responsible for caspase-3-like activity during xylem development (2012)
  • 著者名/発表者名: Han, J., Lin, W., Oda, Y., Cui, K. M., Fukuda, H., He, X. Q
  • 雑誌名: Plant Journal 巻: Vol.72、No.1 ページ: 129-141
  • DOI: DOI:10.1111/j.1365-313X.2012.05070.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Initiation of cell wall pattern by a Rho- and microtubule-driven symmetry breaking (2012)
  • 著者名/発表者名: Oda, Y., Fukuda, H
  • 雑誌名: Science 巻: Vol.337、No.6100 ページ: 1333-1336
  • DOI: DOI:10.1126/science.1222597
  • 査読あり
• [雑誌論文] CRYPTIC PRECOCIOUS/MED12 is a novel flowering regulator with multiple target steps in Arabidopsis (2012)
  • 著者名/発表者名: Imura, Y., Kobayashi, Y., Yamamoto, S., Furutani, M., Tasaka, M., Abe, M., and Araki, T
  • 雑誌名: Plant & Cell Physiology 巻: Vol.53、No.2 ページ: 287-303
  • DOI: DOI:10.1093/pcp/pcs002
  • 査読あり
• [雑誌論文] The TFL1 homologue KSN is a regulator of continuous flowering in rose and strawberry (2012)
  • 著者名/発表者名: Iwata, H., Gaston, A., Remay, A., Thouroude, T., Jeauffre, J., Kawamura, K., Oyant, L.H., Araki, T., Denoyes, B., and Foucher, F
  • 雑誌名: Plant Journal 巻: Vol.69、No.1 ページ: 116-125
  • DOI: DOI:10.1111/j.1365-313X.2011.04776.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamics of Arabidopsis SUN proteins during mitosis and involvement in nuclear shaping (2011)
  • 著者名/発表者名: Oda, Y. and Fukuda, H
  • 雑誌名: Plant Journal 巻: Vol.66、No.4 ページ: 629-641
  • DOI: DOI:10.1111/j.1365-313X.2011.04523.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Wood cell-wall structure requires local 2D-microtubule disassembly by a novel plasma membrane-anchored microtubule-associated protein (2010)
  • 著者名/発表者名: Oda, Y., Iida, Y., Kondo, Y. and Fukuda, H
  • 雑誌名: Current Biology 巻: Vol.20、No.13 ページ: 1197-1202
  • DOI: DOI:10.1016/j.cub.2010.05.038
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcriptional changes in CiFT-introduced transgenic trifoliate orange (Poncirus trifoliata L. Raf.) (2010)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa, F., Endo, T., Shimada, H., Fujii, H., Shimizu, T., Kobayashi, Y., Araki, T., and Omura, M
  • 雑誌名: Tree Physiology 巻: Vol.30、No.3 ページ: 431-439
  • DOI: DOI:10.1093/treephys/tpp122
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of phytosulfokine in the attenuation of stress response during the transdifferentiation of Zinnia mesophyll cells into tracheary elements (2009)
  • 著者名/発表者名: Motose, H., Iwamoto, K., Endo, S., Demura, T., Sakagami, Y., Matsubayashi, Y., Moore, K. L. and Fukuda, H
  • 雑誌名: Plant Physiology 巻: Vol.150、No.1 ページ: 437-447
  • DOI: DOI:10.1104/pp.109.135954
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identifying new components participating in the secondary cell wall formation of vessel elements in Zinnia and Arabidopsis (2009)
  • 著者名/発表者名: Endo, S., Pesquet, E., Yamaguchi, M., Tashiro, G., Sato, M., Toyooka, K., Nishikubo, N., Motose-U., M., Kubo, M., Fukuda, H., and Demura, T
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: Vol.21、No.4 ページ: 3152-3169
  • DOI: DOI:10.1105/tpc108.059154
  • 査読あり
• [雑誌論文] Adaptation of a seedling micro-grafting technique to the study of long-distance signaling in flowering of Arabidopsis thaliana (2009)
  • 著者名/発表者名: Notaguchi, M., Daimon, Y., Abe, M., and Araki, T
  • 雑誌名: Journal of Plant Research 巻: Vol.122、No.2 ページ: 201-214
  • DOI: DOI:10.1007/s10265-008-0209-1
  • 査読あり
• [雑誌論文] Non-cell-autonomous control of vascular stem cell fates by a CLE peptide/receptor system (2008)
  • 著者名/発表者名: Hirakawa, Y., Shinohara, H., Kondo, Y., Inoue, A., Nakanomyo, I., Ogawa, M., Sawa, S., Ohashi-Ito, K., Matsubayashi, Y., Fukuda, H
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 巻: Vol.105、No.39 ページ: 15208-15213
  • DOI: DOI:10.1073/pnas.0808444105
  • 査読あり
• [雑誌論文] Long-distance, graft-transmissible action of Arabidopsis FLOWERING LOCUS T protein to promote flowering (2008)
  • 著者名/発表者名: Notaguchi, M., Abe, M., Kimura, T., Daimon, Y., Kobayashi, T., Yamaguchi, A., Tomita, Y., Dohi, K., Mori, M., and Araki, T
  • 雑誌名: Plant & Cell Physiology 巻: Vol.49、No.11 ページ: 1645-1658
  • DOI: DOI:10.1093/pcp/pcn154
  • 査読あり
• [雑誌論文] TERE; a novel cis-element responsible for a coordinated expression of genes related to programmed cell death and secondary wall formation during tracheary element differentiation (2007)
  • 著者名/発表者名: Pyo, H., Demura, T., and Fukuda, H
  • 雑誌名: Plant Journal 巻: Vol.51、No.6 ページ: 955-965
  • DOI: DOI:10.1111/j.1365-313X.2007.03180.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] 生命現象はどこまで視覚化できるか(4)BiFC (Bimolecular Fluorescence Complementation)法 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大門靖史, 荒木 崇
  • 雑誌名: 化学と生物 巻: Vol.45、No.10 ページ: 718-725
  • DOI: DOI:10.1271/kagakutoseibutsu1962.45.718
• [学会発表] 花成研究の動向と今後の展望 -モデル植物を中心に- (2012)
  • 著者名/発表者名: 荒木 崇
  • 学会等名: 第85回日本生化学会年会 シンポジウム「フロリゲン研究の新展開:その分子構造と新規な機能」
  • 発表場所: 福岡市・福岡国際会議場, マリンメッセ福岡
  • 年月日: 20121214-16
• [学会発表] Role of LEAFY in gametophyte development and function (2012)
  • 著者名/発表者名: 酒井友希・宮下結衣・宇山和樹・辻井由香・山口礼子・荒木 崇
  • 学会等名: International Marchantia Workshop 2012
  • 発表場所: 熊本県阿蘇郡・ホテルグリーンピア南阿蘇
  • 年月日: 20121115-17
• [学会発表] 超解像イメージングで挑む木部細胞分化の分子ダイナミクス (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田祥久・福田裕穂
  • 学会等名: 日本植物学会 第76回大会
  • 発表場所: 姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス
  • 年月日: 20120915-17
• [学会発表] 二次細胞壁パターンの数理解析にむけて (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田祥久・福田裕穂
  • 学会等名: 日本植物学会 第76回大会
  • 発表場所: 姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス
  • 年月日: 20120915-17
• [学会発表] 開始から完了まで-維管束分化の統合的理解に向けて- (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤(大橋)恭子・福田裕穂
  • 学会等名: 日本植物学会 第76回大会
  • 発表場所: 姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス
  • 年月日: 20120915-17
• [学会発表] Regulation of microtubule organization directing spatial patterning of wall assembly during xylem cell formation in Arabidopsis (2012)
  • 著者名/発表者名: 福田裕穂・小田祥久
  • 学会等名: Gordon Conference "Plant & Microbial Cytoskeleton"
  • 発表場所: Proctor Academy, Andover, New Hampshire, USA
  • 年月日: 20120812-17
• [学会発表] Arabidopsis FT florigen in floral transition and beyond (2012)
  • 著者名/発表者名: 荒木 崇
  • 学会等名: 日本植物生理学会 2012年度年会 シンポジウム「Open Questions on Rhythmic Response Systems in Plants」
  • 発表場所: 京都市・京都産業大学
  • 年月日: 20120316-18
• [学会発表] 植物の成長相転換における制御因子の祖先的機能の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 酒井友希・荒木 崇
  • 学会等名: 日本植物生理学会 2012年度年会 シンポジウム「モデル植物ゼニゴケで探る陸上植物の普遍原理と多様性」
  • 発表場所: 京都市・京都産業大学
  • 年月日: 20120316-18
• [学会発表] Vascular stem cell fates are controlled by a CLE peptide secreted from the stem cell niche (2012)
  • 著者名/発表者名: 福田裕穂
  • 学会等名: 10th TLL Life Sciences symposium "Chemical Communication"
  • 発表場所: Singapore
  • 年月日: 20120130-31
• [学会発表] Vascular stem cell fates controlled by small peptides (2012)
  • 著者名/発表者名: 福田裕穂・近藤侑貴・平川有宇樹
  • 学会等名: The Croucher Advanced Study Institute Symposium "Frontier in Cell Biology Research", The Chinese University of Hong Kong
  • 発表場所: Hong Kong, China
  • 年月日: 20120104-06
• [学会発表] 花成研究の動向と今後の展望 -モデル植物を中心に- (2011)
  • 著者名/発表者名: 荒木 崇
  • 学会等名: 園芸学会平成23年度秋季年会 シンポジウム「植物の花成制御機構に関する最新の研究動向と園芸作物への活用方策」
  • 発表場所: 岡山市・岡山大学津島キャンパス
  • 年月日: 20110924-26
• [学会発表] MIDD1 a novel membrane-associated MAP regulating secondary wall patterns (2011)
  • 著者名/発表者名: 福田裕穂
  • 学会等名: 18th International Botanical Congress (IBC2011)
  • 発表場所: Melbourne, Australia
  • 年月日: 20110723-30
• [学会発表] Maintenance of vascular stem cells by a peptide (2011)
  • 著者名/発表者名: 福田裕穂
  • 学会等名: A symposium "Recent Advances in Plant and Microbial Biology" Institute of Plant and Microbial Biology
  • 発表場所: Academia Sinica, Taipei, Taiwan
  • 年月日: 2011-06-06
• [学会発表] Regulation of flowering by the FT florigen (2010)
  • 著者名/発表者名: 荒木 崇
  • 学会等名: The Eighth International Conference on "Plant Biology Frontiers: Cells and Signals"
  • 発表場所: Wuyishan, Fujian, China
  • 年月日: 20100923-27
• [学会発表] CLE peptides govern vascular stem cell fate (2010)
  • 著者名/発表者名: 福田裕穂
  • 学会等名: The Eighth International Conference on "Plant Biology Frontiers: Cells and Signals"
  • 発表場所: Wuyishan, Fujian, China
  • 年月日: 20100923-27
• [学会発表] BiFC法を用いた植物細胞内における蛋白質間相互作用の可視化と細胞内局在の数値化への試み (2009)
  • 著者名/発表者名: 大門靖史・荒木 崇
  • 学会等名: 第一回「光塾」(光イメージング若手の会)
  • 発表場所: 神戸市・情報通信研究機構 神戸研究所 未来ICT研究センター
  • 年月日: 20090815-16
• [学会発表] Long-distance and local signaling in the regulation of flowering in Arabidopsis (2009)
  • 著者名/発表者名: 荒木 崇
  • 学会等名: Keystone Symposia on Molecular and Cellular Biology "Plant Sensing, Response and Adaptation to the Environment"
  • 発表場所: Big Sky, Montana, USA
  • 年月日: 20090111-16
• [学会発表] 管状要素分化転換過程における遺伝子発現に対するDNAメチル化・ヒストン脱アセチル化阻害の影響 (2008)
  • 著者名/発表者名: 貴舩永津子・岩本訓知・十時 泰・豊田 敦・持田恵一・出村 拓・福田裕穂
  • 学会等名: 日本植物生理学会2008年度年会
  • 発表場所: 札幌市・札幌コンベンションセンター
  • 年月日: 20080320-22
• [学会発表] Long-distance and local signaling in the regulation of flowering in Arabidopsis (2008)
  • 著者名/発表者名: 荒木 崇
  • 学会等名: SigNet International Symposium 2008
  • 発表場所: Korea University, Seoul, Korea
  • 年月日: 20080220-21
• [学会発表] Long-distance signals of flowering in Arabidopsis (2007)
  • 著者名/発表者名: 荒木 崇
  • 学会等名: Plant Vascular Biology 2007
  • 発表場所: Academia Sinica, Taipei, Taiwan
  • 年月日: 20070507-11
• [図書] Handbook of Biologically Active Peptides, 2nd Edition (2013)
  • 著者名/発表者名: A. J. Kastin (ed.)
  • 総ページ数: 71-75
  • 出版者: Elsevier
• [図書] Methods in Molecular Biology Vol.715: The Plant Cell Wall (2011)
  • 著者名/発表者名: Z. A. Popper (ed.)
  • 総ページ数: 1-20
  • 出版者: Springer
• [図書] 2010、植物のシグナル伝達 - 分子と応答 (2011)
  • 著者名/発表者名: 柿本 辰男、高山 誠司、福田裕穂、松岡 信(編)
  • 総ページ数: 172-177
  • 出版者: 共立出版
• [図書] Plant Signaling Peptides (2010)
  • 著者名/発表者名: R. Irving and C. Gehring (eds.)
  • 総ページ数: 59-76
  • 出版者: Springer
• [図書] 新しい植物ホルモンの科学 第2版 (2010)
  • 著者名/発表者名: 神谷勇治・小柴共一 (編)
  • 総ページ数: 169-182
  • 出版者: 講談社サイエンティフィク
• [図書] Encyclopedia of Life Sciences (ELS) (2010)
  • 著者名/発表者名: A. M. Hetherington (ed.)
  • 出版者: Wiley
  • URL: DOI:10.1002/9780470015902.a0001814.pub2, Wiley Online Library
• [図書] 植物の科学 (2009)
  • 著者名/発表者名: 塚谷裕一・荒木 崇(編)
  • 総ページ数: 270
  • 出版者: 放送大学教育振興会
• [図書] 光周性の分子生物学 (2009)
  • 著者名/発表者名: 海老原史樹文・井澤 毅 (編)
  • 総ページ数: 53-63
  • 出版者: シュプリンガー・フェアラーク東京
• [図書] 花はなぜ咲くの?(植物まるかじり叢書3) (2008)
  • 著者名/発表者名: 日本植物生理学会(監修)、荒木 崇(責任編集)、西村尚子(著)
  • 総ページ数: 25-26, 60-61, 137-138, 143-149
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 植物の生存戦略 -「じっとしているという知恵」に学ぶ - (2007)
  • 著者名/発表者名: 「植物の軸と情報」特定領域研究班(編)
  • 総ページ数: 3-10, 51-72, 161-183
  • 出版者: 朝日新聞社