ケミカルバイオロジーによる細胞内物流システムの理解と制御

2012 年度 研究成果報告書

• 研究領域: 細胞内ロジスティクス：病態の理解に向けた細胞内物流システムの融合研究
• 研究課題/領域番号: 20113008
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 慶應義塾大学 (2010-2012); 独立行政法人理化学研究所 (2008-2009)
• 研究代表者: 清水 史郎 慶應義塾大学, 理工学部, 准教授 (30312268)
• 研究分担者: 近藤 恭光 独立行政法人理化学研究所, 専任研究員 (80333342)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• キーワード: ケミカルバイオロジー / 化合物アレイ / 細胞内ロジスティクス / がん細胞の浸潤・転移

研究概要

計画班員および公募班員からのリクエストに応じ、化合物アレイと化合物溶液を使用して、興味深い化合物群の取得に成功した。さらに、世界初のPirin阻害剤であるTPh Aを化合物アレイで同定し、そしてTPh Aを使用することでPirinがメラノーマ細胞の遊走に重要であることを明らかにすることができた。

研究成果

• [雑誌論文] Boronic acid inhibitors of acyl protein thioesterase 1 and 2 (2013)
  • 著者名/発表者名: Zimmermann, T.J., Burger, M., Tashiro, E., Kondoh, Y., Martinez, N.E., Gormer, K., Rosin-steiner, S., Shimizu, T. Ozaki, S., Mikoshiba, K., Watanabe, N., Hall, D., Vetter, I.R., Osada, H., Hedberg, C., & Waldmann, H
  • 雑誌名: ChemBioChem 巻: 14 ページ: 115-122
  • DOI: doi:10.1002/cbic.201200571
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-throughput screening identifies small molecule inhibitors of molecular chaperones (2013)
  • 著者名/発表者名: Kondoh, Y. & Osada, H
  • 雑誌名: Current Pharmaceutical Design 巻: 19 ページ: 473-492
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22920900
  • 査読あり
• [雑誌論文] Determination of cathepsin V activity and intracellular trafficking by N-glycosylation (2012)
  • 著者名/発表者名: Niwa, Y., Suzuki, T., Dohmae, N., Umezawa, K. & Simizu, S
  • 雑誌名: FEBS Letters 巻: 586 ページ: 3601-3607
  • DOI: doi:10.1016/j.febslet.2012.08.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of lysenin-induced hemolysis by all-E-lutein derived from the plant Dalbergia latifolia (2012)
  • 著者名/発表者名: Niwa, Y., Matsui, C., Sukumwang, N., Iinuma, H., Ikeda, Y., Koyano, T., Kovitayakorn, T., Simizu, S. & Umezawa, K
  • 雑誌名: Planta Medica 巻: 78 ページ: 957-961
  • DOI: doi:10.1055/s-0031-1298538
  • 査読あり
• [雑誌論文] Suppression of cellular invasion by glybenclamide through inhibited secretion of platelet-derived growth factor in ovarian clear cell carcinoma ES-2 cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasukagawa, T., Niwa, Y., Simizu, S. & Umezawa, K
  • 雑誌名: FEBS Letters 巻: 586 ページ: 1504-1509
  • DOI: doi:10.1016/j.febslet.2012.04.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of NF-κB-mediated expression of galectin-3-binding protein in tumor necrosis factor-α-induced brest cancer cell adhesion (2012)
  • 著者名/発表者名: Noma, N., Simizu, S., Kambayashi, Y., Kabe, Y., Suematsu, M. & Umezawa, K
  • 雑誌名: Oncology Reports 巻: 27 ページ: 2080-2084
  • DOI: doi:10.3892/or.2012.1733
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein disulfide isomerase-mediated disulfide bonds regulate the gelatinolytic activity and secretion of matrix metalloproteinase-9 (2012)
  • 著者名/発表者名: Khan, M. G. M., Simizu, S., Suzuki, T., Masuda, A., Muroi, M., Kawatani, M., Dohmae, N. & Osada, H
  • 雑誌名: Experimental Cell Research 巻: 318 ページ: 904-914
  • DOI: doi:10.1016/j.yexcr.2012.02.021
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of DNA binding domain in the cellular stability and importin affinity of NF-κB component RelB (2012)
  • 著者名/発表者名: Takeiri, M., Horie, K., Takahashi, D., Watanabe, M., Horie, R., Simizu, S. & Umezawa, K
  • 雑誌名: Organic & Biomolecular Chemistry 巻: 10 ページ: 3053-3059
  • DOI: doi:10.1039/c2ob07104e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the predicted phospholipase LYPLAL1 reveals unexpected functional plasticity despite close relationship to acyl protein thioesterases (2012)
  • 著者名/発表者名: Burger, M., Zimmermann, T. J., Kondoh, Y., Stege, P., Watanabe, N., Osada, H., Waldmann, H. & Vetter, I. R
  • 雑誌名: Journal of Lipid Research 巻: 53 ページ: 43-50
  • DOI: doi:10.1194/jlr.M019851
  • 査読あり
• [雑誌論文] Xanthohumol impairs autophagosome maturation through direct inhibition of valosin-containing protein (2012)
  • 著者名/発表者名: Sasazawa, Y., Kanagaki, S., Tashiro, E., Nogawa, T., Muroi, M., Kondoh, Y., Osada, H. & Imoto, M
  • 雑誌名: ACS Chemical Biology 巻: 18 ページ: 892-900
  • DOI: doi:10.1021/cb200492h
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cyclic lipopeptide antibiotics bind to the N-terminal domain of the prokaryotic Hsp90 to inhibit the chaperone activity (2011)
  • 著者名/発表者名: Minagawa, S., Kondoh, Y., Sueoka, K., Osada, H. & Nakamoto, H
  • 雑誌名: Biochemical Journal 巻: 435 ページ: 237-246
  • DOI: doi:10.1042/BJ20100743
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of a vaccinia H1-related (VHR) phosphatase inhibitor with a nonacidic phosphate-mimicking core structure (2011)
  • 著者名/発表者名: Hirai, G., Tsuchiya, A., Koyama, Y., Otani, Y., Oonuma, K., Dodo, K., Simizu, S., Osada, H. & Sodeoka, M
  • 雑誌名: ChemMedChem 巻: 6 ページ: 617-622
  • DOI: doi:10.1002/cmdc.201100107
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discovery of a small molecule PDI inhibitor that inhibits reduction of HIV-1 envelope glycoprotein gp120 (2011)
  • 著者名/発表者名: Khan, M. G. M., Simizu, S., Lai, N. S., Kawatani, M., Shimizu, T. & Osada, H
  • 雑誌名: ACS Chemical Biology 巻: 6 ページ: 245-251
  • DOI: doi:10.1021/cb100387r
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discovery of novel antiviral agents directed against the influenza A virus nucleoprotein using photo-cross-linked chemical arrays (2010)
  • 著者名/発表者名: Hagiwara, K., Kondoh, Y., Ueda, A., Yamada, K., Goto, H., Watanabe, T., Nakata, T., Osada, H. & Aida, Y
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 394 ページ: 721-727
  • DOI: doi:10.1016/j.bbrc.2010.03.058
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of a novel Vpr-binding compound that inhibits HIV-1 multiplication in macrophages by chemical array (2010)
  • 著者名/発表者名: Hagiwara, K., Murakami, T., Xue, G., Shimizu, Y., Takeda, E., Hashimoto, Y., Honda, K., Kondoh, Y., Osada, H., Tsunetsugu-Yokota, Y. & Aida, Y
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 403 ページ: 40-45
  • DOI: doi:10.1016/j.bbrc.2010.10.107
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of autocrine CXCL12/CXCR4 system in the regulation of ovarian carcinoma cell invasion (2010)
  • 著者名/発表者名: Miyanishi, N., Suzuki, Y., Simizu, S., Kuwabara, Y., Banno, K. & Umezawa, K
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 403 ページ: 154-159
  • DOI: doi:10.1016/j.bbrc.2010.11.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] A small-molecule inhibitor shows that pirin regulates migration of melanoma cells (2010)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki, I., Simizu, S., Okumura, H., Takagi, S. & Osada, H
  • 雑誌名: Nature Chemical Biology 巻: 6 ページ: 667-673
  • DOI: doi:10.1038/nchembio.423
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cleavable linker for photo-cross-linked small-molecule affinity matrix (2010)
  • 著者名/発表者名: Kanoh, N., Takayama, H., Honda, K., Moriya, T., Teruya, T., Simizu, S., Osada, H. & Iwabuchi, Y
  • 雑誌名: Bioconjugate Chemistry 巻: 21 ページ: 182-186
  • DOI: doi:10.1021/bc900316q
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deamino-hydroxy-phoslactomycin B, a biosynthetic precursor of phoslactomycin, induces myeloid differentiation in HL-60 cells (2009)
  • 著者名/発表者名: Simizu, S., Teruya, T., Nogawa, T., Aono, H., Ueki, M., Uramoto, M., Kobayashi, Y. & Osada, H
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 383 ページ: 406-410
  • DOI: doi:10.1016/j.bbrc.2009.04.014
  • 査読あり
• [雑誌論文] On-chip fragment-based approach for discovery of high-affinity bivalent inhibitors (2009)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki, I., Simizu, S., Ishida, K. & Osada, H
  • 雑誌名: ChemBioChem 巻: 10 ページ: 838-843
  • DOI: doi:10.1002/cbic.200800704
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure-affinity relationship study of bleomycins and Shble protein by use of a chemical array (2009)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki, I., Okumura, H., Simizu, S., Takahashi, Y., Kanoh, N., Muraoka, Y., Nonomura, Y. & Osada, H
  • 雑誌名: ChemBioChem 巻: 10 ページ: 845-852
  • DOI: doi:10.1002/cbic.200800728
  • 査読あり
• [雑誌論文] RECK negatively regulates matrix metalloproteinase-9 transcription (2009)
  • 著者名/発表者名: Takagi, S., Simizu, S. & Osada, H
  • 雑誌名: Cancer Research 巻: 69 ページ: 1502-1508
  • DOI: doi:10.1158/0008-5472.CAN-08-2635
  • 査読あり
• [雑誌論文] A cell-based screening to detect inhibitors of BRAF signaling pathway (2009)
  • 著者名/発表者名: Asami, Y., Mori, M., Koshino, H., Sekiyama, Y., Teruya, T., Simizu, S., Usui, T. & Osada, H
  • 雑誌名: Journal of Antibiotics 巻: 62 ページ: 105-107
  • DOI: doi:10.1038/ja.2008.17
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polo-like kinase 1 phosphorylates and regulates Bcl-xL during pironetin-induced apoptosis (2009)
  • 著者名/発表者名: Tamura, Y., Simizu, S., Muroi, M., Takagi, S., Kawatani, M., Watanabe, N. & Osada, H
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 28 ページ: 107-116
  • DOI: doi:10.1038/onc.2008.368
  • 査読あり
• [雑誌論文] Robust and systematic drug screening method using chemical arrays and the protein library: identification of novel inhibitors of carbonic anhydrase II (2008)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki, I., Simizu, S., Ichimiya, H., Kawatani, M. & Osada, H
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 巻: 72 ページ: 2739-2749
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18838795
  • 査読あり
• [雑誌論文] Requirement of the conserved, hydrophobic C-terminus region for the activation of heparanase (2008)
  • 著者名/発表者名: Lai, N. S., Simizu, S., Morisaki, D., Muroi, M. & Osada, H
  • 雑誌名: Experimental Cell Research 巻: 314 ページ: 2834-2845
  • DOI: doi: 10.1016/j.yexcr.2008.07.004
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of NO-induced β-cell death by novel NF-κB inhibitor (-)-DHMEQ via activation of Nrf2-ARE pathway
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, A., Simizu, S., Ito, A., Kawai, T., Saisho, Y., Takei, I. & Umezawa, K
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: (掲載決定)
  • DOI: doi:10.1016/j.bbrc.2013.02.062
  • 査読あり
• [雑誌論文] Migracins A and B, new inhibitors of cancer cell migration, produced by Streptomyces sp
  • 著者名/発表者名: Arai, Y., Iinuma, H., Ikeda, Y., Igarashi, M., Hatano, M., Kinoshita, N., Ukaji, T., Simizu, S. & Umezawa, K
  • 雑誌名: The Journal of Antibiotics 巻: (掲載決定)
  • DOI: doi:10.1038/ja.2012.112
  • 査読あり
• [学会発表] 低分子マイクロアレイを用いたMDM2/MDMX-p53阻害剤の探索法の開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 野口 太朗、他
  • 学会等名: 日本薬学会第133年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、神奈川県
  • 年月日: 2013-03-29
• [学会発表] 化合物アレイによるヘッジホッグ伝達経路の阻害剤の探索 (2013)
  • 著者名/発表者名: 近藤 恭光、他
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度大会
  • 発表場所: 東北大学川内北キャンパス、宮城県
  • 年月日: 2013-03-26
• [学会発表] がん細胞にアポトーシスを誘導するアセトアミド誘導体の活性評価と作用機序解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 河村 達郎、他
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度大会
  • 発表場所: 東北大学川内北キャンパス、宮城県
  • 年月日: 2013-03-26
• [学会発表] Pyrrocidine Aによるミトコンドリアを介したアポトーシス誘導機構 (2013)
  • 著者名/発表者名: 上杉 祥太、他
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度大会
  • 発表場所: 東北大学川内北キャンパス、宮城県
  • 年月日: 2013-03-26
• [学会発表] 植物ホルモン・アブシジン酸の新規アゴニスト・アンタゴニスト探索 (2013)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 卓也、他
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度大会
  • 発表場所: 東北大学川内北キャンパス、宮城県
  • 年月日: 2013-03-25
• [学会発表] Hyaluronidase1 activity and secretion are regulated by C-mannosylation (2013)
  • 著者名/発表者名: Simizu, S., et al.
  • 学会等名: 9th AACR-JCA Joint Conference
  • 発表場所: Hyatt Regency Maui、アメリカ
  • 年月日: 2013-02-24
• [学会発表] 化合物アレイによるアミノ酸置換変異体特異的阻害剤の探索手法の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 近藤 恭光、他
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場他、福岡県
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] LAP結合TGF-β活性化反応阻害物質の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山本 由佳、他
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場他、福岡県
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] p38のゲートキーパーの多様性を標的とした特異的阻害剤探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 須藤 龍彦、他
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場他、福岡県
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] オートファジーを制御する低分子化合物の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 三好 良幣、他
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場他、福岡県
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] LAP結合TGF-β活性化反応阻害物質の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山本 由佳、他
  • 学会等名: 第26回肝類洞壁細胞研究会学術集会
  • 発表場所: ANAクラウンプラザホテル宇部、山口県
  • 年月日: 2012-11-17
• [学会発表] Regulation of hyaluronidase1 enzymatic activity by C-mannosylation (2012)
  • 著者名/発表者名: Goto, Y., et al.
  • 学会等名: EORTC-NCI-AACR Symposium on Molecular Targets and Cancer Therapeutics
  • 発表場所: Convention Centre Dublin、アイルランド
  • 年月日: 2012-11-09
• [学会発表] 血漿カリクレイン依存的TGF-β活性化反応阻害剤の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 坂田 幸大郎、他
  • 学会等名: 第23回日本レチノイド研究会
  • 発表場所: 米子コンベンションセンター、鳥取県
  • 年月日: 2012-10-19
• [学会発表] Induction of RelB degradation and apoptosis in adult T-cell leukemia cells by DTCM-glutarimide (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤あゆみ、他
  • 学会等名: 第71回 日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ロイトン札幌他、北海道
  • 年月日: 2012-09-21
• [学会発表] Role of C-mannosylation on hyaluronidase1 functions (2012)
  • 著者名/発表者名: 後藤祐貴、他
  • 学会等名: 第71回 日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ロイトン札幌他、北海道
  • 年月日: 2012-09-19
• [学会発表] N-glycosylation regulates cathepsin L2 functions (2012)
  • 著者名/発表者名: Niwa, Y., et al.
  • 学会等名: The 14th International Biennial Congress of the Metastasis Research Society
  • 発表場所: Brisbane Convention Centre & Exhibition Centre、オーストラリア
  • 年月日: 2012-09-04
• [学会発表] カテプシンL2の機能に与えるN-glycosylationの役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 丹羽祐貴、他
  • 学会等名: 第21回 日本がん転移学会学術集会・総会
  • 発表場所: オリエンタルホテル広島、広島県
  • 年月日: 2012-07-13
• [学会発表] がん分子標的研究の今昔 (2012)
  • 著者名/発表者名: 清水史郎
  • 学会等名: 理研セミナー
  • 発表場所: 理化学研究所、埼玉県
  • 年月日: 2012-07-13
• [学会発表] 植物性アルカロイドconophyllineによる癌細胞薬剤耐性の軽減と標的タンパク質の結合解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 舟崎慎太郎、他
  • 学会等名: 日本がん分子標的治療学会 第16回学術集会
  • 発表場所: 西日本総合展示場、福岡県
  • 年月日: 2012-06-28
• [学会発表] 免疫抑制剤デオキシスパーガリンの標的分子の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 村橋将崇、他
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会 第7回年会
  • 発表場所: 京都大学、京都府
  • 年月日: 2012-06-07
• [学会発表] Spectomycin B1 suppresses Estrogen Receptor α-Dependent Breast Cancer Cell Growth by inhibiting a SUMO E2 Activity (2012)
  • 著者名/発表者名: Ito Akihiro、他
  • 学会等名: 2nd SNU-RIKEN Joint Symposium on Chemical Biology
  • 発表場所: Naminara Hotel、大韓民国
  • 年月日: 2012-05-18
• [学会発表] Screening of Chemical Regulators for TGF-β Activation Reaction (2012)
  • 著者名/発表者名: Sakata Kotaro、他
  • 学会等名: 2nd SNU-RIKEN Joint Symposium on Chemical Biology
  • 発表場所: Naminara Hotel、大韓民国
  • 年月日: 2012-05-18
• [備考]
  • URL: http://www.applc.keio.ac.jp/~simizu/