2001 年度実績報告書

AFLP法によるウシ・ゲノム解析とその応用

研究課題

研究課題/領域番号	13460126
研究機関	神戸大学
研究代表者	辻荘一神戸大学, 農学部, 教授 (10031220)
研究分担者	万年英之神戸大学, 農学部, 助手 (20263395) 向井文雄神戸大学, 農学部, 教授 (50093323)
キーワード	黒毛和種 / ホルスタイン種 / AFLP法 / SNP s / 品種鑑定 / DNA多型 / 育種価 / RDA法
研究概要	AFLP法は2種類の制限酵素の組み合わせで、ゲノムDNAを切断し、PCR法によって、その断片を増幅する方法で、制限酵素で切断される個所に塩基置換があると、断片の長さが異なり、多型として検出される。 1)AFLP法を用いたホルスタイン種と黒毛和種の品種鑑定 PCRの組み合わせは約4000通りある。これまでに、800通りのプライマーセットの組み合わせを調査し、ホルスタイン種と黒毛和種の両者で比較した。その結果、ホルスタイン種に絶対的に特異なDNA断片は得られておらず、現在のところ、両品種を識別することの出来る1塩基置換(SNP s)は見出されていないが、ひたすら、AFLP分析を続けることによって、理想的なAFLP断片が得られると考えられる。 2)AFLPによるDNA断片のRDA法による特異断片の選択的分離 4000通りのAFLP分析は、余りにも労力がかかりすぎる。そこで、ホルスタイン種と黒毛和種から得られたAFLP断片を用い、お互いに引き算をして、品種特異的なAFLP断片の検出を試みている。現在のところ、引き算によって、特異的な断片を得るまでには至っていないが、今後の試行に期待出来る。 3)黒毛和種の経済形質に関わる遺伝子の特定黒毛和種を肉質のような形質に目をつけて、その上位10%と下位10%にグループ分けする。その個体のDNAを入手し、AFLP法によるDNA断片の比較を行う。1)、2)の成果待ちであるが、宮崎県の繁殖雌牛集団から、育種価により、グループ分けした牛、各20頭を選定し、血液の採取を済ませており、分析に入る準備は整っている。1,2)の成果、特に2)の成果が得られ次第、研究に着手する。

研究成果
(7件)

すべてその他

すべて文献書誌 (7件)

[文献書誌] Lee E.J.et al.: "Localization of the muscular dystrophy AMlocus using a chicken linkage map constructed with the Kobe University resource family"Animal Genetics. 33 No.1. 42-48 (2002)
[文献書誌] Mannen, H. et al.: "Mitochondrial DNA reveal that domestic goat (Capra hircus) are genetically affected by two subspecies of bezoar (Capra aegagurus)"Biochemical Genetics. 39. 145-154 (2001)
[文献書誌] Honda, T. et al.: "Genetic diversity of a closed population of Japanese Black cattle in Hyogo Prefecture"Anim. Sci. J.. 72. 378-385 (2001)
[文献書誌] 笹崎晋史: "AFLPマーカーを用いた肉用牛5品種の系統分析"日本畜産学会報. 72. J1-J5 (2001)
[文献書誌] Nomura, T. et al.: "Inbreeding and effective population size of Japanese Black cattle"J. Anim. Sci.. 79. 366-370 (2001)
[文献書誌] Oyama, K. et al.: "Optimization of mating design via a simple genetic algorithm with constrained inbreeing and mating frequency in a long-term selection"Anim. Sci. J.. 72. 279-284 (2001)
[文献書誌] 辻荘一他: "動物遺伝育種学事典"動物遺伝育種シンポジウム組織委員会編. 636 (2001)

2001 年度 実績報告書

AFLP法によるウシ・ゲノム解析とその応用

研究代表者

辻 荘一 神戸大学, 農学部, 教授 (10031220)

研究成果

[文献書誌] Lee E.J.et al.: "Localization of the muscular dystrophy AMlocus using a chicken linkage map constructed with the Kobe University resource family"Animal Genetics. 33 No.1. 42-48 (2002)

[文献書誌] Mannen, H. et al.: "Mitochondrial DNA reveal that domestic goat (Capra hircus) are genetically affected by two subspecies of bezoar (Capra aegagurus)"Biochemical Genetics. 39. 145-154 (2001)

[文献書誌] Honda, T. et al.: "Genetic diversity of a closed population of Japanese Black cattle in Hyogo Prefecture"Anim. Sci. J.. 72. 378-385 (2001)

[文献書誌] 笹崎晋史: "AFLPマーカーを用いた肉用牛5品種の系統分析"日本畜産学会報. 72. J1-J5 (2001)

[文献書誌] Nomura, T. et al.: "Inbreeding and effective population size of Japanese Black cattle"J. Anim. Sci.. 79. 366-370 (2001)

[文献書誌] Oyama, K. et al.: "Optimization of mating design via a simple genetic algorithm with constrained inbreeing and mating frequency in a long-term selection"Anim. Sci. J.. 72. 279-284 (2001)

[文献書誌] 辻 荘一他: "動物遺伝育種学事典"動物遺伝育種シンポジウム組織委員会編. 636 (2001)

2001 年度実績報告書

辻荘一神戸大学, 農学部, 教授 (10031220)

[文献書誌] 辻荘一他: "動物遺伝育種学事典"動物遺伝育種シンポジウム組織委員会編. 636 (2001)