NMRを用いたソフトなタンパク質相互作用解析法の開拓

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 15083202
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 嶋田 一夫 東京大学, 大学院・薬学系研究科, 教授 (70196476)
• 研究分担者: 寺沢 宏明 東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助手 (10300956)
• 研究期間 (年度): 2003 – 2008
• キーワード: 膜タンパク質 / 相互作用 / 核磁気共鳴法

研究概要

本研究では生体機能の発現に重要かつ創薬開発における標的タンパク質である膜タンパク質を研究対象とし、その機能解明を行うことが可能な核磁気共鳴法の測定法開発を行い、複数の系において機能解明を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Cross-saturation and transferred cross-saturation experiments (2009)
  • 著者名/発表者名: Ichio Shimada, Takumi Ueda, Masahiko Matsumoto, Masayoshi Sakakura, Masanori Osawa, Koh Takeuchi, Noritaka Nishida, Hideo Takahashi
  • 雑誌名: Prog. Nuc. Magn. Reson. Spect. 54 ページ: 123-140
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Basis of the Collagen-binding Mode of Discoidin Domain Receptor 2 (2007)
  • 著者名/発表者名: Osamu Ichikawa, Masanori Osawa, Noritaka Nishida, Naoki Goshima, Nobuo Nomura, and Ichio Shimada
  • 雑誌名: EMBO J. 26 ページ: 4168-4176
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ligand-induced structural change of the CD44 hyaluronan-binding domain revealed by NMR (2006)
  • 著者名/発表者名: Mitsuhiro Takeda, Shinji Ogino, Ryo Umemoto, Masayoshi Sakakura, Masahiro Kajiwara, Kazuki Sugahara, Hiroto Kawashima, Masayuki Miyasaka, Hiroaki Terasawa, and Ichio Shimada
  • 雑誌名: J Biol Chem. 281 ページ: 40089-40095
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bead-linked proteoliposomes : a reconstitution method for NMR analyses of membrane protein-ligand interactions (2005)
  • 著者名/発表者名: Mariko Yokogawa, Koh Takeuchi, and Ichio Shimada
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc. 127 ページ: 12021-12027
  • 査読あり
• [雑誌論文] NMR techniques for identifying the interface of a larger protein-protein complex : cross-salutation and transferred cross-saturation experiments. (2004)
  • 著者名/発表者名: Ichio Shimada
  • 雑誌名: Method. Enzymol. 394 ページ: 483-506
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel Collagen-Binding Mode of the VWA Domain Determined by a Transferred Cross-Saturation Experiment (2003)
  • 著者名/発表者名: Noritaka Nishida, Hiromi Sumikawa, Masayoshi Sakakura, Nobuhisa Shimba, Hideo Takahashi, Hiroaki Terasawa, Ei-ichiro Suzuki, Ichio Shimada
  • 雑誌名: Nature Struct. Biol. 10 ページ: 53-58
  • 査読あり
• [学会発表] NMR Study on Membrane proteins-ligands (2007)
  • 著者名/発表者名: 嶋田一夫
  • 学会等名: Interactions-Application of Transferred Cross Saturation- AIMECS 07, the 6th International Medicinal Chemistry Symposium
  • 発表場所: Istanbul, Turkey
  • 年月日: 20070708-11
• [学会発表] NMR study on protein-protein interactions using paramagnetic probe (2007)
  • 著者名/発表者名: 嶋田一夫
  • 学会等名: International Workshop on Perspectives on Stable Isotope Aided NMR Methods for Protein Structural Analysis
  • 発表場所: Osaka, Japan
  • 年月日: 20070330-31