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2017 年度 実績報告書

ヒストン修飾新規リーダータンパク質による転写機構解析(国際共同研究強化)

研究課題

研究課題/領域番号 15KK0251
研究機関東京大学

研究代表者

神吉 康晴  東京大学, アイソトープ総合センター, 助教 (00534869)

研究期間 (年度) 2016 – 2017
キーワードクライオ電子顕微鏡 / 構造生物学 / 酵素
研究実績の概要

本国際共同研究の目的は、申請者がこれまでに見出したエピゲノム修飾因子の立体構造を解析することで、そのメカニズムを原子レベルで明らかにし、将来の創薬に向けた足がかりを作ることである。その際に、従来構造生物学分野で主流であったX線結晶構造解析ではなく、近年爆発的な勢いで普及しつつあるクライオ電子顕微鏡を用いて行うものである。
研究期間前半(平成28年度)は、クライオ電子顕微鏡を用いた単粒子解析の手法習得を行った。この解析では、タンパク質の精製、グリッドの作成、写真を撮る、画像データからのimage processing、といった過程でタンパク質の3次元構造モデルを作成する。平成28年度は主に、image processingの手法習得に時間を費やした。
最終年度にあたる平成29年度は、実際に標的となるタンパク質、及び、その変異体を用いて、単粒子解析を行った。標的となるタンパク質はテトラマーで240kDaと、現在のクライオ電子顕微鏡で見るには小さいが、野生型も変異型もどちらも3オングストローム前後の解像度で立体構造を決定することが出来た。
更に、作成された立体構造モデルから、変異が入ることで酵素のテトラマーの安定性が変化すること、アロステリック制御が変化することなどを見出した。
本国際共同研究は、日本では普及の遅れている、クライオ電子顕微鏡を用いた単粒子解析の手法を習得することが主要な目的であったことを考えると、大きな成果を生み出したと言える。

  • 研究成果

    (10件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] National Institute of Health(米国)2016

    • 年月日
      2016-09-01 – 2017-08-31
    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      National Institute of Health
    • 主な海外共同研究者名
      Sriram Subramaniam
    • 部局
      National Cancer Institute
    • 職名
      Senior Investigator
  • [雑誌論文] Genome-wide analysis revealed that DZNep reduces tubulointerstitial fibrosis via down-regulation of pro-fibrotic genes2018

    • 著者名/発表者名
      Mimura Imari、Hirakawa Yosuke、Kanki Yasuharu、Nakaki Ryo、Suzuki Yutaka、Tanaka Tetsuhiro、Aburatani Hiroyuki、Nangaku Masaomi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 ページ: 3779

    • DOI

      10.1038/s41598-018-22180-5

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of Cardiomyocyte-Fated Progenitors from Human-Induced Pluripotent Stem Cells Marked with CD822018

    • 著者名/発表者名
      Takeda Masafumi、Kanki Yasuharu、Masumoto Hidetoshi、Funakoshi Shunsuke、Hatani Takeshi、Fukushima Hiroyuki、Izumi-Taguchi Akashi、Matsui Yusuke、Shimamura Teppei、Yoshida Yoshinori、Yamashita Jun K.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 22 ページ: 546~556

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2017.12.057

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Novel lnc RNA regulated by HIF-1 inhibits apoptotic cell death in the renal tubular epithelial cells under hypoxia2017

    • 著者名/発表者名
      Mimura Imari、Hirakawa Yosuke、Kanki Yasuharu、Kushida Natsuki、Nakaki Ryo、Suzuki Yutaka、Tanaka Tetsuhiro、Aburatani Hiroyuki、Nangaku Masaomi
    • 雑誌名

      Physiological Reports

      巻: 5 ページ: e13203~e13203

    • DOI

      10.14814/phy2.13203

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamically and epigenetically coordinated GATA/ETS/SOX transcription factor expression is indispensable for endothelial cell differentiation2017

    • 著者名/発表者名
      Kanki Yasuharu、Nakaki Ryo、Shimamura Teppei、Matsunaga Taichi、Yamamizu Kohei、Katayama Shiori、Suehiro Jun-ichi、Osawa Tsuyoshi、Aburatani Hiroyuki、Kodama Tatsuhiko、Wada Youichiro、Yamashita Jun K.、Minami Takashi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 45 ページ: 4344~4358

    • DOI

      10.1093/nar/gkx159

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ヒストン修飾酵素による動脈硬化関連遺伝子発現制御解析2018

    • 著者名/発表者名
      神吉康晴
    • 学会等名
      第4回血管生物若手研究会
  • [学会発表] Single particle analysis by cryo-electron microscopy2017

    • 著者名/発表者名
      Yasuharu Kanki, Sagar Chittori, Doreen Matthies, Prashant Rao, Alan A. Merk, Sriram Subramaniam
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 招待講演
  • [学会発表] microRNA-histone modification network in TNFa-stimulated inflammatory endothelium2017

    • 著者名/発表者名
      東島佳毅、神吉康晴、井上剛、南学正臣、古川哲史、和田洋一郎
    • 学会等名
      ConBio2017
  • [学会発表] Lysine Demethylase 6A and 7A REgulated by MicroRNA-3679-5p Mediates TNFa-induced Inflammatory Signaling in Vascular Endotehlium2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki HIGASHIJIMA, Tsuyoshi INOUE, Masaomi NANGAKU, Youichiro WADA, Tetsushi FURUKAWA, Yasuharu KANKI
    • 学会等名
      American Heart Association 2017
    • 国際学会
  • [図書] 実験医学2017年8月号2017

    • 著者名/発表者名
      神吉康晴
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      羊土社

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公開日: 2018-12-17  

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