| 研究課題/領域番号 |
16K18562
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
植物分子・生理科学
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
朽名 夏麿 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任准教授 (70578559)
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| 研究協力者 |
馳澤 盛一郎
桧垣 匠
秋田 佳恵
湖城 恵
島原 佑基
三浦 岳
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| 研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| キーワード | 植物細胞 / オルガネラ / 細胞骨格 / 顕微鏡画像 / 画像解析 |
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| 研究成果の概要 |
植物細胞の持つ多種のオルガネラ・細胞骨格系について、顕微鏡画像からフェノーム解析を行う上で必須な画像解析手法の統合化を実現する実験系と画像処理ソフトウェアの開発に取り組んだ。また、顕微鏡画像から得られたオルガネラ・細胞骨格系のデータを規範として、細胞骨格系の動態をシミュレートするソフトウェアを開発した。材料には主としてタバコ培養細胞BY-2ならびにその形質転換体を用いた。また、国内の複数の研究機関と協力してオルガネラ・フェノーム研究で得られた顕微鏡画像を収集し分析に供した。
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| 自由記述の分野 |
生物画像解析
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
研究の結果、光学的特性等が自ずと異なる複数の顕微鏡撮影系に対して、オルガネラ等を認識し個数や面積を測定する、といった細胞レベルのフェノーム解析を高精度高効率に実施するソフトウェアを開発することができた。その基礎を形づくる画像解析ソフトウェア群については国内企業によるユーザインタフェイス等の改良等を受け、アップデートと提供を続けていけるような体制を整えている。
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