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2019 年度 実績報告書

酵素基質複合体の構造ダイナミクス解析に基づく反応方向制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K07304
研究機関金沢大学

研究代表者

瀬尾 悌介  金沢大学, 物質化学系, 助教 (10339616)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワードフェレドキシン / フラボ酵素 / NADPH / ヒドリド転移 / 枯草菌 / 緑色硫黄細菌 / 紅色非硫黄細菌 / 光合成
研究実績の概要

本研究では,FNRとNADP+/H及びferredoxin(Fd)との複合体形成に伴う構造ダイナミクスの変化により,可逆であるFNRの触媒反応を一方向に進行させる方向制御を実現する機構の詳細を,変異体を用いた速度論的解析及び酵素基質複合体の構造情報に基づき解明することを目指した.
紅色非硫黄細菌FNRのNADPH酸化反応では,枯草菌及び緑色硫黄細菌FNRと同様にヒドリド転移が律速でその速度は約500 s-1と速かった.一方,還元型紅色非硫黄細菌FNRによるNADP+還元反応は,枯草菌FNR同様にヒドリド転移が律速で,NADPH酸化反応時の速度と同等で可逆であり,複合体形成が律速で速度が大幅に低下する緑色硫黄細菌FNRと対照的な結果が得られた.前2者と後者では還元型FADのS0→S1遷移に伴う吸収強度が大きく異なり,還元型FADとアミノ酸残基との相互作用が速度に影響すると推察された.そこでFADのイソアロキサジン環re面に近接するC末端部に変異導入し影響を調べた.C末端部の削除・相互置換は,CT複合体を極度に不安定化し,ヒドリド転移速度の低下とFNRの相対的酸化還元電位の上昇をもたらした.Re面の芳香族残基の置換は,ヒドリド転移速度や酸化還元特性に大きな影響を及ぼさなかったが,NADP+/Hの解離・再結合速度の低下を生じたことから,同残基がCT複合体を適度に不安定化し,NADP+/Hの解離を促進していると結論された.同残基の置換はS0→S1遷移の吸収極大波長をシフトさせたが,強度の変化は小さかった.本研究で,紅色非硫黄細菌FNRの結晶構造を新たに報告できたが,酵素基質複合体の結晶構造解析は実現しなかった.高磁場NMR測定用の部分同位体ラベル試料の作成は,約300アミノ酸残基のN末端断片をFADを含むホロ体として精製を完了し,C末端部断片の発現・精製条件を検討している.

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] Ecole Polytechnique(フランス)

    • 国名
      フランス
    • 外国機関名
      Ecole Polytechnique
  • [雑誌論文] Kinetic and structural insight into a role of the re-face Tyr328 residue of the homodimer type ferredoxin-NADP+ oxidoreductase from Rhodopseudomonas palustris in the reaction with NADP+/NADPH2020

    • 著者名/発表者名
      Seo Daisuke、Muraki Norifumi、Kurisu Genji
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1861 ページ: 148140

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2019.148140

    • 査読あり
  • [学会発表] Fdの共存がferredoxin-NADP+還元酵素のNADP+還元速度に与える影響の速度論解析2020

    • 著者名/発表者名
      瀬尾悌介、北島正治、井上和仁
    • 学会等名
      第61回 植物生理学会年会
  • [学会発表] Kinetic analysis of the reaction between NADP+/H and ferredoxin-NAD(P)+ reductase from green sulfur bacterium in the presence of ferredoxin2019

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Seo, Masaharu Kitashima, Kazuhito Inoue
    • 学会等名
      10th International Conference on Photosynthesis and Hydrogen Energy Research for Sustainability
    • 国際学会
  • [学会発表] 緑色硫黄細菌ferredoxin-NADP+酸化還元酵素と基質間の酸化還元反応の特異性2019

    • 著者名/発表者名
      瀬尾悌介、北島正治、井上和仁
    • 学会等名
      第57回 日本生物物理学会年会
  • [学会発表] Role of the re-face Tyr328 residue in ferredoxin-NADP+ oxidoreductase from Rhodopseudomonas palustris during catalysis with NADP+/H2019

    • 著者名/発表者名
      瀬尾悌介、村木則文、栗栖源嗣
    • 学会等名
      第92回 日本生化学会大会
  • [学会発表] Cooperative role of ferredoxin in Chlorobaculum tepidum ferredoxin-NADP+ reductase-catalyzed reaction with NADP+/H2019

    • 著者名/発表者名
      林壱星、瀬尾悌介
    • 学会等名
      第92回 日本生化学会大会
  • [学会発表] 紅色非硫黄細菌ferredoxin-NADP+酸化還元酵素のTyr328の機能2019

    • 著者名/発表者名
      瀬尾悌介
    • 学会等名
      第10回 日本光合成学会年会
  • [学会発表] 枯草菌ferredoxin-NADP+酸化還元酵素ホモログの生理的機能の推察2019

    • 著者名/発表者名
      瀬尾悌介
    • 学会等名
      グラム陽性菌ゲノム機能会議

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公開日: 2021-01-27  

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