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陸水域環境指標生物種のDNA タクソノミー情報基盤の確立を目的とし、実物標本の収集と種判別DNAマーカー 配列情報の蓄積を進めた。日本産水生昆虫類4目（カゲロウ、トンボ、カワゲラ、トビケラ）を主たる対象とするとともに、環境DNA解析やメタゲノム解析に出現する水生生物類を含めて解析を行った。
生物種ごとに、可能な限り複数の標本を得てそれぞれの遺伝子解析を行った。それぞれの標本を形態に基づき同定し、分類上の特徴をよく表す画像データを取得するとともに、標的遺伝子の部分配列の解析を進めている。得られた結果（画像データおよびDNA配列）は、採集情報と合わせてインターネット上のウェブサイトで公開している。
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