研究課題/領域番号 |
17K15701
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研究種目 |
若手研究(B)
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配分区分 | 基金 |
研究分野 |
ウイルス学
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研究機関 | 大阪大学 |
研究代表者 |
齊藤 暁 大阪大学, 微生物病研究所, 特任助教(常勤) (30621792)
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研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2019-03-31
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キーワード | 宿主因子 / エイズウイルス / インターフェロン |
研究成果の概要 |
本研究課題では、新規のインターフェロン(IFN)誘導性抗エイズウイルス宿主因子を同定することを目的とした。RNA-Seq解析によりIFN処理細胞でのみ特異的に発現レベルが上昇する遺伝子を複数見出し、CRISPR-Cas9法を用いた候補遺伝子のノックアウト細胞作製に取り組んだ。様々な条件検討により、効率よくノックアウト細胞を作製する手法の確立に成功し、既知のIFN誘導性宿主因子ノックアウト細胞ではIFN処理の効果が一部減弱することを明らかにできている。現在、限られた数の候補遺伝子について詳細な評価を進めており、なるべく早い時期に同定に繋がるデータを出したいと考えている。
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自由記述の分野 |
ウイルス学
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
これまで、我々を含む国内外の研究グループにより、未同定のIFN誘導性のエイズウイルス感染阻害因子が存在することが示唆されている。近年のオミックス研究の飛躍的な進歩により、遺伝子発現レベルの網羅的解析が比較的容易になってきてはいるが、適切なコントロールがない場合、莫大な量のデータから目的遺伝子を特定するのは容易ではない。我々が今回行ったRNA-Seq実験では、IFN処理によりHIV感染を阻害する細胞でのみ発現レベルが上昇する遺伝子を効率よく抽出できた。現在限られた数の候補遺伝子の評価を進めており、長年解明が求められていたエイズウイルス抑制因子の解明に貢献していきたい。
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