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2018 年度 実施状況報告書

ゲノム医療実装のためのヒト遺伝子関連検査の妥当性・有用性・倫理社会的問題の検討

研究課題

研究課題/領域番号 18K07411
研究機関京都大学

研究代表者

小杉 眞司  京都大学, 医学研究科, 教授 (50252432)

研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
キーワード遺伝学的検査 / がん遺伝子パネル検査 / 次世代シークエンサー / 医療法改正 / 二次的所見 / 全エクソーム解析 / 精度管理 / ACCE
研究実績の概要

ゲノム医療の実装のために重要な臨床検査としてのヒト遺伝子関連検査を確立するために、次世代シーケンサによる解析を含むヒト遺伝子関連検査の分析的妥当性、臨床的妥当性、臨床的有用性、倫理社会的問題について、下記の4つの領域に関する総合的検討を開始した。①単一遺伝性疾患(希少難病等)などを対象に、単一あるいは少数の遺伝子をサンガー法など従来型解析法で調べるもの。②多因子疾患(Common Diseases)などの易罹患性をゲノムワイド相関解析などのデータ等に基づいて調べる遺伝学的検査。③次世代シーケンサ(NGS)を用い、多数の遺伝子を一度に調べるパネル検査、全エクソーム解析、全ゲノム解析など。④がん細胞における遺伝子の変化を調べ、がんの正確な診断や治療に役立てるがん遺伝子パネル検査。さらに、③④に関しては、検査の当初の目的外に見いだされるいわゆる二次的所見の問題も重要であるので、その取扱について検討を実施した。具体的には、
(1)2018年の医療法改正に伴う臨床検査としての遺伝学的検査における精度管理のあり方及び研究として実施される生殖細胞系列遺伝子解析のありかたについて整理を実施し、関連領域に発生しかねなかった混乱を回避することができた。
(2)次世代シークエンサーを用いるがん遺伝子パネル検査および、遺伝性難病の網羅的生殖細胞系列遺伝学的検査を実施する際の種々の問題点(二次的所見の取り扱いなど)を整理することができた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

申請書に記載した目的が順調に達成されつつあるため。

今後の研究の推進方策

(1)がん遺伝子パネル検査を含めた次世代シークエンサーを用いた網羅的解析の際の二次的所見の取り扱いについて、遺伝医療専門家を対象とした質問紙調査を実施し、2014年に実施した際の状況との違いを明らかにする。
(2)二次的所見としてのACMG59遺伝子の我が国におけるactionabilityについて、多面的な評価を実施する。具体的にはClinGenで採用している4つの評価指標,すなわちSeverity, Likelihood, Effectiveness, Nature of interventionの4項目に加え,わが国の医療体制の現状を鑑みてaccessibilityも評価する方針とし,遺伝性腫瘍及び循環器疾患など、二次的所見が重要とされるものを中心に実施する。
(3)2018年度の診療報酬改定に伴って点数改定が実施された背景より遺伝性難病に対する遺伝学的検査実施の拡大されている。また、がんゲノム医療の本格実施に伴って遺伝性腫瘍原因遺伝子の遺伝学的検査が不可欠となっている状況の中で、これらの遺伝学的検査のACCEの状況について実地調査する。

次年度使用額が生じた理由

(理由)2018年度は、論文調査やインターネット上の調査、電子メールでの情報交換など、経費がかからない方法で、研究のスタートをきることができたため。
(使用計画)本研究では、情報収集と整理が重要となるため、各種学会等での情報収集のための旅費・参加費および、学内での作業を依頼する研究協力者に対する謝金等が主体となる、そのほか、収集データの保存・活用のための電子媒体の購入費用、特定のデータべースの使用量などにも研究費を使用する。

  • 研究成果

    (10件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] Advanced Glycation End Product Accumulation Is Associated With Low Skeletal Muscle Mass, Weak Muscle Strength, and Reduced Bone Density: The Nagahama Study2019

    • 著者名/発表者名
      Tabara Yasuharu、Ikezoe Tome、Yamanaka Mikihiro、Setoh Kazuya、Segawa Hiroaki、Kawaguchi Takahisa、Kosugi Shinji、Nakayama Takeo、Ichihashi Noriaki、Tsuboyama Tadao、Matsuda Fumihiko、The Nagahama Study Group
    • 雑誌名

      The Journals of Gerontology: Series A

      巻: 74 ページ: 1446~1453

    • DOI

      doi:10.1093/gerona/gly233

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Factors affecting longitudinal changes in cardio?ankle vascular index in a large general population2018

    • 著者名/発表者名
      Tabara Yasuharu、Setoh Kazuya、Kawaguchi Takahisa、Takahashi Yoshimitsu、Kosugi Shinji、Nakayama Takeo、Matsuda Fumihiko
    • 雑誌名

      Journal of Hypertension

      巻: 36 ページ: 1147~1153

    • DOI

      10.1097/HJH.0000000000001672

    • 査読あり
  • [雑誌論文] CCDC102B confers risk of low vision and blindness in high myopia2018

    • 著者名/発表者名
      Hosoda Yoshikatsu、Nagahama Study group、Yoshikawa Munemitsu、Miyake Masahiro、Tabara Yasuharu、Shimada Noriaki、Zhao Wanting、Oishi Akio、Nakanishi Hideo、Hata Masayuki、Akagi Tadamichi、Ooto Sotaro、Nagaoka Natsuko、Fang Yuxin、Ohno-Matsui Kyoko、Cheng Ching-Yu、Saw Seang Mei、Yamada Ryo、Matsuda Fumihiko、
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 9 ページ: 1782

    • DOI

      10.1038/s41467-018-03649-3

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dietary habits associated with reduced insulin resistance: The Nagahama study2018

    • 著者名/発表者名
      Ikeda Kaori、Sato Tosiya、Nakayama Takeo、Tanaka Daisuke、Nagashima Kazuaki、Mano Fumika、Joo Erina、Fujimoto Shimpei、Takahashi Yoshimitsu、Kosugi Shinji、Sekine Akihiro、Tabara Yasuharu、Matsuda Fumihiko、Inagaki Nobuya
    • 雑誌名

      Diabetes Research and Clinical Practice

      巻: 141 ページ: 26~34

    • DOI

      10.1016/j.diabres.2018.04.006

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reduction in Gastroesophageal Reflux Disease Symptoms Is Associated with <i>Miso</i> Soup Intake in a Population-Based Cross-Sectional Study: The Nagahama Study2018

    • 著者名/発表者名
      MANO Fumika、IKEDA Kaori、SATO Tosiya、NAKAYAMA Takeo、TANAKA Daisuke、JOO Erina、TAKAHASHI Yoshimitsu、KOSUGI Shinji、SEKINE Akihiro、TABARA Yasuharu、MATSUDA Fumihiko、INAGAKI Nobuya、Nagahama Study Group
    • 雑誌名

      Journal of Nutritional Science and Vitaminology

      巻: 64 ページ: 367~373

    • DOI

      10.3177/jnsv.64.367

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nocturia and increase in nocturnal blood pressure2018

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Takeshi、Tabara Yasuharu、Murase Kimihiko、Setoh Kazuya、Kawaguchi Takahisa、Nagashima Shunsuke、Kosugi Shinji、Nakayama Takeo、Wakamura Tomoko、Hirai Toyohiro、Matsuda Fumihiko、Chin Kazuo
    • 雑誌名

      Journal of Hypertension

      巻: 36 ページ: 2185~2192

    • DOI

      10.1097/HJH.0000000000001802

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Day-to-Day Home Blood Pressure Variability and Orthostatic Hypotension: The Nagahama Study2018

    • 著者名/発表者名
      Tabara Yasuharu、Matsumoto Takeshi、Murase Kimihiko、Setoh Kazuya、Kawaguchi Takahisa、Nagashima Shunsuke、Kosugi Shinji、Nakayama Takeo、Wakamura Tomoko、Hirai Toyohiro、Chin Kazuo、Matsuda Fumihiko、Nagahama study group
    • 雑誌名

      American Journal of Hypertension

      巻: 31 ページ: 1278~1285

    • DOI

      10.1093/ajh/hpy131

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association between socioeconomic factors and urinary sodium-to-potassium ratio: the Nagahama Study2018

    • 著者名/発表者名
      Yamashita Makoto、the Nagahama Study group、Tabara Yasuharu、Higo Yukiko、Setoh Kazuya、Kawaguchi Takahisa、Takahashi Yoshimitsu、Kosugi Shinji、Nakayama Takeo、Matsuda Fumihiko、Wakamura Tomoko
    • 雑誌名

      Hypertension Research

      巻: 41 ページ: 973~980

    • DOI

      10.1038/s41440-018-0101-x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic analysis of a case of Helicobacter pylori-uninfected intramucosal gastric cancer in a family with hereditary diffuse gastric cancer2018

    • 著者名/発表者名
      Funakoshi Taro、Miyamoto Shin’ichi、Kakiuchi Nobuyuki、Nikaido Mitsuhiro、Setoyama Takeshi、Yokoyama Akira、Horimatsu Takahiro、Yamada Atsushi、Torishima Masako、Kosugi Shinji、Yamada Hidetaka、Sugimura Haruhiko、Haga Hironori、Sakai Yoshiharu、Ogawa Seishi、Seno Hiroshi、Muto Manabu、Chiba Tsutomu
    • 雑誌名

      Gastric Cancer

      巻: 1 ページ: 1

    • DOI

      10.1007/s10120-018-00912-w

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Small Degree of Lumbar Lordosis as an Overlooked Determinant for Orthostatic Increases in Blood Pressure in the Elderly: The Nagahama Study2018

    • 著者名/発表者名
      Tabara Yasuharu、Masaki Mitsuhiro、Ikezoe Tome、Setoh Kazuya、Kato Takehiro、Kawaguchi Takahisa、Kosugi Shinji、Nakayama Takeo、Ichihashi Noriaki、Tsuboyama Tadao、Matsuda Fumihiko、Nagahama Study Group
    • 雑誌名

      American Journal of Hypertension

      巻: 32 ページ: 61~69

    • DOI

      10.1093/ajh/hpy137

    • 査読あり

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公開日: 2019-12-27  

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