ゲノム医療実装のためのヒト遺伝子関連検査の妥当性・有用性・倫理社会的問題の検討

2020 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 18K07411
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 小杉 眞司 京都大学, 医学研究科, 教授 (50252432)
• 研究期間 (年度): 2018-04-01 – 2021-03-31
• キーワード: 遺伝学的検査 / がん遺伝子パネル検査 / 次世代シークエンサー / 二次的所見 / 全エクソーム解析 / 精度管理 / ACCE

研究実績の概要

ゲノム医療の実装のために重要な臨床検査としてのヒト遺伝子関連検査を確立するために、次世代シーケンサーによる解析を含むヒト遺伝子関連検査の分析的妥当性、臨床的妥当性、臨床的有用性、倫理社会的問題について、下記の4つの領域に関する総合的検討を継続して実施した。①単一遺伝性疾患（希少難病等）などを対象に、単一あるいは少数の遺伝子をサンガー法など従来型解析法で調べるもの。②多因子疾患(Common Diseases)などの易罹患性をゲノムワイド相関解析などのデータ等に基づいて調べる遺伝学的検査。③次世代シークエンサー（NGS）を用い、多数の遺伝子を一度に調べるパネル検査、全エクソーム解析、全ゲノム解析など。④がん細胞における遺伝子の変化を調べ、がんの正確な診断や治療に役立てるがん遺伝子パネル検査。さらに、③④に関しては、検査の当初の目的外に見いだされるいわゆる二次的所見の題も重要であるので、その取扱について検討を実施した。具体的には、
（１）次世代シークエンサーを用いるがん遺伝子パネル検査および、遺伝性難病の網羅的
生殖細胞系列遺伝学的検査を実施する際の種々の問題点（二次的所見の取り扱いなど）をより詳細に整理することができた。
（２）治療・予防に結びつく具体的な二次的所見の取扱いについて、遺伝子名を示して明らかとすることができた。開示推奨度の改定を検討した。
（３）がん遺伝子パネル検査を含めた次世代シークエンサーを用いた網羅的解析の際の二次的所見の取り扱いについて、遺伝医療専門家を対象とした質問紙調査を実施し、2014年に実施した際の状況との違いを明らかにできた。

研究成果

• [雑誌論文] Prenatal diagnosis of severe mitochondrial diseases caused by nuclear gene defects: a study in Japan (2021)
  • 著者名/発表者名: Akiyama Nana、Shimura Masaru、Yamazaki Taro、Harashima Hiroko、Fushimi Takuya、Tsuruoka Tomoko、Ebihara Tomohiro、Ichimoto Keiko、Matsunaga Ayako、Saito-Tsuruoka Megumi、Yatsuka Yukiko、Kishita Yoshihito、Kohda Masakazu、Namba Akira、Kamei Yoshimasa、Okazaki Yasushi、Kosugi Shinji、Ohtake Akira、Murayama Kei
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 ページ: 3531-3531
  • DOI: 10.1038/s41598-021-81015-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Night-time frequency of urination as a manifestation of sleep-disordered breathing: the Nagahama study (2021)
  • 著者名/発表者名: Hamada S, Tabara Y, Murase K, Matsumoto T, Setoh K, Wakamura T, Kawaguchi T, Kosugi S, Nakayama T, Hirai T, Matsuda F, Chin K, Tabara Y, Kawaguchi T, Setoh K, Takahashi Y, Kosugi S, Nakayama T, Matsuda F, Minami T, Takahashi N, Takeyama H, Morita S, Handa T, Komenami N,
  • 雑誌名: Sleep Medicine 巻: 77 ページ: 288～294
  • DOI: 10.1016/j.sleep.2020.09.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Myopia Prevalence and Ocular Biometry Features in a General Japanese Population (2021)
  • 著者名/発表者名: Nakao Shin-ya、Miyake Masahiro、Hosoda Yoshikatsu、Nakano Eri、Mori Yuki、Takahashi Ayako、Ooto Sotaro、Tamura Hiroshi、Tabara Yasuharu、Yamashiro Kenji、Matsuda Fumihiko、Tsujikawa Akitaka、Nakayama Takeo、Sekine Akihiro、Kosugi Shinji
  • 雑誌名: Ophthalmology 巻: 128 ページ: 522～531
  • DOI: 10.1016/j.ophtha.2020.08.023
  • 査読あり
• [雑誌論文] Advanced Glycation End Product Accumulation is Associated with Lower Cognitive Performance in an Older General Population: The Nagahama Study (2020)
  • 著者名/発表者名: Tabara Yasuharu、Yamanaka Mikihiro、Setoh Kazuya、Segawa Hiroaki、Kawaguchi Takahisa、Kosugi Shinji、Nakayama Takeo、Matsuda Fumihiko、the Nagahama Study Group
  • 雑誌名: Journal of Alzheimer's Disease 巻: 74 ページ: 741～746
  • DOI: 10.3233/JAD-190878
  • 査読あり
• [雑誌論文] Current status and legal/ethical problems in the research use of the tissues of aborted human fetuses in Japan (2020)
  • 著者名/発表者名: Kawasaki Hidenori、Yamada Takahiro、Wada Takahito、Kosugi Shinji
  • 雑誌名: Congenital Anomalies 巻: 60 ページ: 166～174
  • DOI: 10.1111/cga.12381
  • 査読あり
• [雑誌論文] Descriptive epidemiology of high frequency component based on heart rate variability from 10-second ECG data and daily physical activity among community adult residents: the Nagahama Study (2020)
  • 著者名/発表者名: Takahashi Naomi、Takahashi Yoshimitsu、Tabara Yasuharu、Kawaguchi Takahisa、Kuriyama Akira、Ueshima Kenji、Kosugi Shinji、Sekine Akihiro、Yamada Ryo、Matsuda Fumihiko、Nakayama Takeo、Nagahama Study Group
  • 雑誌名: BioScience Trends 巻: 14 ページ: 241～247
  • DOI: 10.5582/bst.2020.03146
  • 査読あり
• [雑誌論文] Attitudes toward and current status of disclosure of secondary findings from next-generation sequencing: a nation-wide survey of clinical genetics professionals in Japan (2020)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya M, Yamada T, Akaishi R, Hamanoue H, Hirasawa A, Hyodo M, Imoto I,Kosho T,Kurosawa K, Murakami H, Nakatani K, Nomura F, Sasaki A, Shimizu K, Tamai M, Umemura H, Watanabe A, Yoshida A, Yoshihashi H, Yotsumoto J, Kosugi S
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 65 ページ: 1045～1053
  • DOI: 10.1038/s10038-020-0802-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Home device-monitored sleep blood pressure reflects large artery stiffness: the Nagahama study (2020)
  • 著者名/発表者名: Tabara Yasuharu、Matsumoto Takeshi、Murase Kimihiko、Setoh Kazuya、Kawaguchi Takahisa、Kosugi Shinji、Nakayama Takeo、Hirai Toyohiro、Wakamura Tomoko、Chin Kazuo、Matsuda Fumihiko
  • 雑誌名: Journal of Hypertension 巻: 38 ページ: 2459～2464
  • DOI: 10.1097/HJH.0000000000002576
  • 査読あり
• [雑誌論文] Keratoconus-susceptibility gene identification by corneal thickness genome-wide association study and artificial intelligence IBM Watson (2020)
  • 著者名/発表者名: Hosoda Yoshikatsu、The Nagahama Study Group、Miyake Masahiro、Meguro Akira、Tabara Yasuharu、Iwai Sachiko、Ueda-Arakawa Naoko、Nakano Eri、Mori Yuki、Yoshikawa Munemitsu、Nakanishi Hideo、Khor Chiea-Chuen、Saw Seang-Mei、Yamada Ryo、Matsuda Fumihiko、Cheng Ching-Yu、Mizuki Nobuhisa、Tsujikawa Akitaka、Yamashiro Kenji
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 3 ページ: 410-410
  • DOI: 10.1038/s42003-020-01137-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Association of Education and Depressive Symptoms with Tooth Loss (2020)
  • 著者名/発表者名: Fukuhara S.、Asai K.、Kakeno A.、Umebachi C.、Yamanaka S.、Watanabe T.、Yamazaki T.、Nakao K.、Setoh K.、Kawaguchi T.、Morita S.、Nakayama T.、Matsuda F.、Bessho K.、Tabara Yasuharu、Kawaguchi Takahisa、Setoh Kazuya、Takahashi Yoshimitsu、Kosugi Shinji、Nakayama Takeo、Matsuda Fumihiko
  • 雑誌名: Journal of Dental Research 巻: 100 ページ: 361～368
  • DOI: 10.1177/0022034520969129
  • 査読あり
• [雑誌論文] Truncating Variants Contribute to Hearing Loss and Severe Retinopathy in USH2A-Associated Retinitis Pigmentosa in Japanese Patients (2020)
  • 著者名/発表者名: Inaba Akira、Maeda Akiko、Yoshida Akiko、Kawai Kanako、Hirami Yasuhiko、Kurimoto Yasuo、Kosugi Shinji、Takahashi Masayo
  • 雑誌名: International Journal of Molecular Sciences 巻: 21 ページ: 7817～7817
  • DOI: 10.3390/ijms21217817
  • 査読あり