GPUグリッドによる京速計算のための計算資源管理

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19700061
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 計算機システム・ネットワーク
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 伊野 文彦 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 准教授 (90346172)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• キーワード: GPU / グリッドコンピューティング

研究概要

本研究の目的は,GPU(Graphics Processing Unit)を装備する多数のパソコンを一つの仮想的な高性能計算機GPU グリッドとして動作させるための資源管理手法を開発することである.開発した手法を用いた結果,日常業務に用いる計算機にGPUを1つ追加すれば,単体CPUを2台ほど専用し続ける場合と同等の性能を引き出せることが分かった.

研究成果

• [雑誌論文] Harnessing the Power of Idle GPUs for Acceleration of Biological Sequence Alignment (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumihiko Ino, Yuki Kotani, Kenichi Hagihara
  • 雑誌名: Proceedings of the 2nd Workshop on Large-Scale Parallel Processing CD-ROM
  • 査読あり
• [雑誌論文] RGBA Packing for Fast Cone Beam Reconstruction on the GPU (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumihiko Ino, Seiji Yoshida, Kenichi Hagihara
  • 雑誌名: Proceedings of the SPIE Medical Imaging CD-ROM
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fast Cone Beam Reconstruction Using the CUDA-enabled GPU (2008)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Okitsu, Fumihiko Ino, Kenichi Hagihara
  • 雑誌名: Proceedings of 15th International Conference on High Performance Computing ページ: 108-119
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Task Parallel Algorithm for Computing the Costs of All-Pairs Shortest Paths on the CUDA-compatible GPU (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomohiro Okuyama, Fumihiko Ino, Kenichi Hagihara
  • 雑誌名: Proceedings of the 6th International Symposium on Parallel and Distributed Processing and Applications ページ: 284-291
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Resource Selection System for Cycle Stealing in GPU Grids (2008)
  • 著者名/発表者名: Yuki Kotani, Fumihiko Ino, Kenichi Hagihara
  • 雑誌名: Journal of Grid Computing 6 ページ: 399-416
  • 査読あり
• [雑誌論文] Design and Implementation of the Smith-Waterman Algorithm on the CUDA-Compatible GPU (2008)
  • 著者名/発表者名: Yuma Munekawa, Fumihiko Ino, Kenichi Hagihara
  • 雑誌名: Proceedings of the 8th IEEE International Conference on Bioinformatics and Bioengineering CD-ROM
  • 査読あり
• [雑誌論文] GPU による高速なコーンビーム再構成 : 円軌道装置のためのRGBA データへの詰め込み (2008)
  • 著者名/発表者名: 吉田征司, 伊野文彦, 西野和義. 萩原兼一
  • 雑誌名: 情報処理学会論文誌 : コンピューティングシステム 1 ページ: 41-53
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Decompression Pipeline for Accelerating Out-of-Core Volume Rendering of Time-Varying Data (2008)
  • 著者名/発表者名: Daisuke Nagayasu, Fumihiko Ino, Kenichi Hagihara
  • 雑誌名: Computers and Graphics 32 ページ: 350-362
  • 査読あり
• [雑誌論文] スケール不変な格子を生成する適応格子細分化法アプリケーションための計算量予測手法 (2007)
  • 著者名/発表者名: 川崎康博, 伊野文彦, 萩原兼一
  • 雑誌名: 電子情報通信学会論文誌 J90-D ページ: 2691-2703
  • 査読あり
• [雑誌論文] GPGPUアプリケーションの開発を支援するための性能モデル (2007)
  • 著者名/発表者名: 伊藤信悟, 伊野文彦, 萩原兼一
  • 雑誌名: 情報処理学会論文誌 : コンピューティングシステム 48 ページ: 235-246
  • 査読あり
• [学会発表] GPUグリッドにおいて描画および科学計算を並行処理するための制御手法 (2009)
  • 著者名/発表者名: 荻田章博, 伊野文彦, 萩原兼一
  • 学会等名: 情報処理学会第110回システムソフトウェアとオペレーティング・システム研究発表会
  • 発表場所: 蒲郡情報ネットワークセンター
  • 年月日: 2009-01-28
• [学会発表] GPUグリッドによる高速な塩基配列アライメント (2008)
  • 著者名/発表者名: 伊野文彦, 小谷裕基, 萩原兼一
  • 学会等名: 情報処理学会第111回ハイパフォーマンスコンピューティング研究発表会
  • 発表場所: 旭川国際会議場
  • 年月日: 2008-07-01
• [学会発表] GPU-accelerated volume reconstruction (2007)
  • 著者名/発表者名: Fumihiko Ino
  • 学会等名: Joint JSPS-SNSF Seminar on Computer Aided Surgery
  • 発表場所: 大阪大学
  • 年月日: 2007-09-24
• [学会発表] 汎用アクセラレータとしてGPUを駆使する試みGPGPUについて (2007)
  • 著者名/発表者名: 伊野文彦
  • 学会等名: サイエンティフィック・システム研究会HPCフォーラム2007
  • 発表場所: 汐留シティセンター
  • 年月日: 2007-08-28
• [備考]
  • URL: http://www-hagi.ist.osaka-u.ac.jp/~ino/