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2009 年度 研究成果報告書

陸上・海底堆積物における細胞外DNAの分布とその重要性の解明

研究課題

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研究課題/領域番号 19740315
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 地質学
研究機関独立行政法人産業技術総合研究所

研究代表者

竹内 美緒  独立行政法人産業技術総合研究所, 地圏資源環境研究部門, 主任研究員 (20357403)

研究期間 (年度) 2007 – 2009
キーワード細胞外DNA / 地下圏微生物 / RNA / 古細菌 / 微生物相
研究概要

陸域の地下圏堆積物中における細胞外DNAの定量評価を行った結果,2.9-28.3ng/g dry weight sedimentで存在しており,深度と共に減少する傾向が見られた。これらは,細胞内DNA量の24-117倍と推定され,高濃度に存在することが明らかになったものの,そこから得られる微生物の情報は極めて少なく,細胞外DNAは多くが断片化や損傷した状態で存在している可能性が示唆された。そこで生きている微生物についての情報を得るための方法として,RNを堆積物から抽出する手法を確立し,微生物相の解析に用いた。その結果,Proteobacteria,Chloroflexi,Acidobacteria Miscellaneous Crenarchaeotic Group(MCG),ANMEなどが検出され,これらが地下圏においてアクティブであることが示された。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Bacterial and Archaeal 16S rRNA Genes in Late Pleistocene to Holocene Muddy Sediments from the Kanto Plain of Japan2009

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi, M., Komai, T., Hanada, S., Tamaki, H., Tanabe, S., Miyachi, Y., Uchiyama, M., Nakazawa, T., Kimura, K., Kamagata, Y.
    • 雑誌名

      Geomicrobiology Journal 26:2

      ページ: 104-118

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 地下圏微生物活動に対する難透水層の役割2007

    • 著者名/発表者名
      竹内美緒
    • 雑誌名

      地学雑誌 vol.116,no.6

      ページ: 915-921

    • 査読あり
  • [学会発表] Microbial world in the subsurface of Tokyo2009

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi M.
    • 学会等名
      1st Korea-Japan symposium
    • 発表場所
      Cheju island, Korea
    • 年月日
      20090000
  • [学会発表] 関東平野の沖積粘土層中におけるメタン生成2008

    • 著者名/発表者名
      竹内美緒, 玉木秀幸, 田邉晋, 内山美 恵子, 高橋学, 吉岡秀佳
    • 学会等名
      アーキア研究会
    • 発表場所
      那覇, 沖縄
    • 年月日
      20080000
  • [学会発表] Living microbial community (methanogens) in ancient marine sediments of Holocene in the Kanto Plain2008

    • 著者名/発表者名
      M. Takeuchi, H. Tamaki, S. Tanabe, M. Uchiyama, M. Sugihara, M. Takahashi, H. Yoshioka
    • 学会等名
      Japan, ISSM
    • 発表場所
      Shizuoka
    • 年月日
      20080000
  • [学会発表] Living methanogens in the Holocene mud2007

    • 著者名/発表者名
      M. Takeuchi, H, Tamaki, S, Tanabe, M, Uchiyama, M, Takahashi, H, Yoshioka
    • 学会等名
      ISME-Asia. Matsuyama
    • 発表場所
      Ehime
    • 年月日
      20070000

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公開日: 2011-06-18   更新日: 2016-04-21  

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