• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2020 年度 実績報告書

走化性シグナル伝達系における濃度勾配認識メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 19H00982
研究機関大阪大学

研究代表者

上田 昌宏  大阪大学, 生命機能研究科, 教授 (40444517)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2024-03-31
キーワード走化性 / 三量体Gタンパク質 / GPCR / 適応 / 細胞性粘菌
研究実績の概要

本研究では,三量体G蛋白質の細胞質-細胞膜間局在制御の仕組みを解明し,「G蛋白質局在制御によるGPCRシグナリングの調節」という新しいコンセプトの確立を目指した研究を実施している.これまでの研究から,G蛋白質局在制御はGPCRの応答濃度レンジの拡張に働いていること,および,三量体G蛋白質と結合する細胞質因子のGip1がG蛋白質局在制御を担う中心的な分子であることを明らかにしてきた.そこで本研究では主に次の3つの研究項目を実施してきた.
[研究項目1] 細胞質におけるGip1とG蛋白質の複合体形成の分子メカニズム
[研究項目2] リガンド刺激によるGip1-G蛋白質複合体の調節メカニズム
[研究項目3] G蛋白質局在調節メカニズムの普遍性
本年度は,[研究項目1]としてGip1の構造解析を進めた.これまでにGip1のC末ドメインがcavityを有しており,ここがG蛋白質の脂質修飾(ゲラニルゲラニル基)と相互作用することで,複合体が形成されることが示唆されてきた.しかしながら,これまでの立体構造解析からは,ゲラニルゲラニル基との相互作用について明らかになっていなかった.本年度は,Gip1のC末ドメインとゲラニルゲラニル基が結合した立体構造の解析に成功し,cavity内にゲラニルゲラニル基が挿入されている構造が明らかになった.[研究項目2]として昨年度までにGip1のN末ドメインを構成するPHドメインが複合体形成の調節に重要であることを明らかにしてきた.本年度はこのPHドメインに作用するシグナル伝達分子の探索を行った.候補となる分子の代謝に関わる遺伝子の変異株を解析したところ,Gip1とG蛋白質の複合体形成の量に影響する変異株を見つけることができた.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

昨年度に引き続きGip1-G蛋白質複合体の構造解析([研究項目1] )を進めた結果,上述したように,G蛋白質との相互作用に関わるGip1 C末ドメインがG蛋白質のゲラニルゲラニル基と相互作用することが立体構造解析から明らかになった.また,リガンド刺激によるGip1-G蛋白質複合体の調節メカニズム([研究項目2] )については,昨年度までにGip1のPHドメインの重要性が明らかとなっていた.PHドメインは細胞膜のイノシトールリン脂質と結合することが知られているが,Gip1は細胞質に局在することから,PHドメインが受け取るシグナルは細胞質に遊離した状態で存在するイノシトールリン脂質かその分解産物が候補となる.本年度は,そうした候補分子としてイノシトールポリリン酸に注目し,その代謝に関わるいくつかの酵素分子の遺伝子破壊株を作成した.それを用いてGip1-G蛋白質複合体の形成量などについて解析をすすめた結果,ある遺伝子破壊株においてGip1-G蛋白質複合体の量に異常が見つかってきた.[研究項目3] については,Gip1のヒト細胞ホモログであるTNFAIP8ファミリーのTIPE2, TIPE3に注目し,相互作用分子の同定を進めてきた.これらの研究はおおむね計画通りに進めることができている.
これらの研究に加え,本研究に関連してGPCR依存的な走化性応答の濃度レンジを定量的に計測するための手法を開発した.微小流路を利用することにより,走化性を誘導する誘引物質の濃度勾配を再現性よく形成することが可能になり,様々な誘引物質濃度レンジにおける応答性を定量することが可能になった.その結果,細胞集団の一部に非常に高い応答性を有するサブ集団が存在することが明らかとなった.そのサブ集団が走化性応答を示す際に必要な最小の誘引物質結合数は,細胞あたり平均で6個であることがわかった.

今後の研究の推進方策

当初に計画した3つの研究項目を軸にして研究を進めていく.特に,Gip1の立体構造解析についてさらに進め,複合体形成の分子メカニズムの解明に取り組む.複合体形成の調節メカニズムを解明するために,Gip1のN末のPHドメインの構造解析とGip1の全体構造の解析を進める.また,Gip1-G蛋白質複合体の調節に関わることが示唆されたイノシトールポリリン酸について,その代謝に関連する遺伝子群の解析をすすめ,遺伝子ノックアウト株の表現型を解析する.細胞質のPHドメインに作用するシグナル分子は他の細胞系においても全く知られていない.同定できれば新規性は高いので,この未知のシグナルの同定を進める.また,微小流路を用いた走化性応答レンジ計測系を確立することができたので,これを利用して様々な遺伝子変異体のGPCR依存的な走化性の応答性を評価する.これにより,応答レンジ調節の仕組みに関与する可能性のある遺伝子群のスクリーニングを行い,Gip1との関係について検討する予定である.誘引物質が6個程度の少数分子による入力信号がGPCR-G蛋白質のダイナミクスによって大きく増幅される仕組みと,誘引物質が数万個以上入力する高濃度領域での応答が両立する仕組みの関係について,Gip1に着目した研究を行う予定である.

  • 研究成果

    (19件)

すべて 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 2件) 備考 (4件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [国際共同研究] Johns Hopkins University/NIH(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Johns Hopkins University/NIH
  • [雑誌論文] GPCR signaling regulation in Dictyostelium chemotaxis2021

    • 著者名/発表者名
      Kamimura,Y. and Ueda, M
    • 雑誌名

      Method in Molecular Biology

      巻: in press ページ: in press

  • [雑誌論文] A sub-population of Dictyostelium discoideum cells shows extremely high sensitivity to cAMP for directional migration2021

    • 著者名/発表者名
      Ohtsuka, D., Ota, N., Amaya, S., Matsuoka, S., Tanaka, Y., and Ueda, M.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      巻: 554 ページ: 131-137

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.03.095.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 自己組織化による細胞極性形成の1分子粒度シミュレーション2020

    • 著者名/発表者名
      松岡 里実, 上田 昌宏
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞内 1 分子イメージングの自動化と細胞内シグナル伝達への適用2020

    • 著者名/発表者名
      廣島 通夫, 上田 昌宏
    • 学会等名
      CBI学会2020大会
    • 招待講演
  • [学会発表] 走化性濃度勾配センシングにおける三量体Gタンパク質制御2020

    • 著者名/発表者名
      上村 陽一郎,上田 昌宏
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議
  • [学会発表] 細胞内自己組織化現象の1分子計測に基づく1分子粒度シミュレーション2020

    • 著者名/発表者名
      松岡 里実, 上田 昌宏
    • 学会等名
      日本化学会第100春季年会
  • [学会発表] 自己組織化による細胞極性形成の1分子粒度シミュレーション2020

    • 著者名/発表者名
      松岡 里実, 上田 昌宏
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会
  • [学会発表] 自己組織化による細胞極性形成の1分子粒度シミュレーション2020

    • 著者名/発表者名
      松岡 里実, 上田 昌宏
    • 学会等名
      第10回日本細胞性粘菌学会例会
  • [学会発表] 走化性勾配認識における三量体Gタンパク質制御2020

    • 著者名/発表者名
      上村 陽一郎,上田 昌宏
    • 学会等名
      第10回日本細胞性粘菌学会例会
  • [学会発表] Identification of GEFs regulating the excitability of Ras in motile cells2020

    • 著者名/発表者名
      Koji Iwamoto, Satomi Matsuoka,Masahiro Ueda
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会
  • [学会発表] Investigation of automatic single-molecule tracking method for large-scale single-molecule imaging analysis2020

    • 著者名/発表者名
      Sotaro Mori, Masato Yasui, Satomi Matsuoka, Masahiro Ueda
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会
  • [学会発表] 走化性細胞の濃度勾配認識におけるRGSの役割2020

    • 著者名/発表者名
      黒岩 麟平, 上村 陽一郎, 上田 昌宏
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
  • [学会発表] Roles of Gip1 and Ric8 in activation of heterotrimeric G proteins for eukaryotic chemotaxis2020

    • 著者名/発表者名
      上村 陽一郎,上田 昌宏
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
  • [備考] 理化学研究所生命機能科学研究センター細胞シグナル動態研究チーム

    • URL

      http://www.qbic.riken.jp/csd/ja/index.html

  • [備考] 大阪大学大学院生命機能研究科1分子生物学研究室

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/ueda/

  • [備考] Laboratory for Cell Signaling Dynamics, RIKEN BDR

    • URL

      http://www.qbic.riken.jp/csd/en/index.html

  • [備考] 真核細胞の運動方向を決める分子基盤となる脂質-タンパク質相互作用を解明

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/events/achievement/ueda-20200228/

  • [産業財産権] Autofocus device, and optical apparatus and microscope2021

    • 発明者名
      安井 真人,廣島 通夫,上田 昌宏
    • 権利者名
      安井 真人,廣島 通夫,上田 昌宏
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      16/967,814
    • 外国

URL: 

公開日: 2021-12-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi