研究課題/領域番号 |
19K06202
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分40030:水圏生産科学関連
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研究機関 | 東北大学 |
研究代表者 |
池田 実 東北大学, 農学研究科, 教授 (70232204)
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研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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キーワード | マコガレイ / マガレイ / 卵形質 / 粘着沈性卵 / 分離浮性卵 / ミトコンドリアDNA / RAD-Seq / 集団ゲノミクス |
研究成果の概要 |
マコガレイとマガレイは同属だが、前者は粘着沈性卵、後者は分離浮性卵という対照的な卵形質を示す。この卵形質の差異は種内の集団構造に反映されているはずである。全国各地の標本集団についてミトゲノムの分析を行った結果、マコガレイでは15.8%もの遺伝的分化が認められ、7グループに分かれた。マガレイでは0.04%でほぼ均質であった。核ゲノム中の2万から3万個のSNPsを用いて集団構造を調べた結果、マコガレイはミトゲノムの分析結果と一致した。一方、マガレイにおいても海域ごとに有意な分化が検出されたが、程度は小さかった。以上の結果から、2種の卵形質の差異は集団構造によく反映されていると結論できた。
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自由記述の分野 |
水産遺伝学
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究は、同属ではあるが、粘着沈性卵を産むマコガレイと分離浮性卵を産むマガレイについて集団ゲノミクス解析(核DNAにおける大量のSNPs分析とミトコンドリアDNA分析)を行なった。その結果、マコガレイでは海域ごとに著しい遺伝的分化が認められ、7グループに分かれた。一方、マガレイではSNPs分析で微弱な遺伝的分化が検出されはしたもののほぼ均質であった。これらの結果は、卵形質の差異が集団構造に影響するという予測を支持するものであり、両種の資源管理に関して有用な情報を提示する。また、両種の参照ゲノム配列を構築中であり、卵形質の多様化に関する遺伝的基盤を探索する準備が整えられつつある。
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