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本研究はエピゲノムの重要性を膵癌幹細胞マーカー陽性細胞に焦点を当て、その細胞群に重要な役割を示す細胞内シグナルおよび遺伝子発現との関連性とともに解析するものである。
膵癌細胞株を用いた過去の研究でヒストン脱メチル化酵素KDM6Bの発現低下が癌抑制遺伝子CEBPAの発現を直接抑制し膵癌の悪性度増加に寄与することを明らかにしたが、その後の検討でKDM6B/CEBPA axis制御の異常に伴って出現する高い腫瘍形成能を有する細胞集団とその特異的な表面マーカー群を同定した。これらの知見は膵癌における幹細胞性などの悪性形質の獲得にエピゲノム制御が関与する可能性を示唆していた。一方で癌細胞も癌細胞同士や間質細胞などから構成される独自の微小環境から慢性的な刺激を受ける過程で、その外部刺激を生存・増殖に適応させ、癌細胞がaddictする特異的なエピゲノム変化を誘導している可能性がある。つまり癌幹細胞を含めてエピゲノムの多様性とその細胞群への影響を理解することが生体組織内での癌腫瘍組織の不均一性の包括的理解につながると考えられる。
本研究では癌患者の臨床検体から樹立されたオルガノイドを用いて、既存の癌幹細胞マーカー、および新たに見いだした癌幹細胞マーカー候補の遺伝子発現およびその陽性細胞の分布を検討する。さらに幹細胞マーカー発現細胞をその抗体を用いたフローサイトメトリーで単離し、その細胞群を用いた生物学的解析のみならずエピゲノムのオミックス解析を行っている。
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