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2021 年度 実績報告書

がんの多因子遺伝的なリスクスコアの開発とがん罹患リスク予測モデルの改善

研究課題

研究課題/領域番号 19K10655
研究機関国立研究開発法人国立がん研究センター

研究代表者

山地 太樹  国立研究開発法人国立がん研究センター, がん対策研究所, 室長 (10466203)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
キーワードPolygenic Risk Score / Risk Prediction Model
研究実績の概要

本研究は、ゲノム網羅的な遺伝情報からがんの多因子遺伝的なリスクスコア(genome-wide polygenic risk score)を開発し、現在の「日本人のためのがんリスクチェックツール < https://epi.ncc.go.jp/riskcheck/>」のアルゴリズムとなっている環境要因だけで構成されたがん罹患リスク予測モデルの改善を図ることを目的としている。ゲノム網羅的な解析をもとに遺伝的リスクスコアの開発を行う際、有意な関連を示す遺伝子多型だけを用いる手法は比較的良く用いられているが、関連が示唆される遺伝子多型まで含めて、より多因子遺伝的なリスクスコアを開発しようとする点が、本研究の学術的特徴である。具体的には、がんのゲノム網羅的な解析で、有意な関連とする基準を P< 5.0×10-8 から段階的に緩め、がんとの関連が示唆される遺伝子多型数を増加させながら、複数の多因子遺伝的なリスクスコアを構築する。2021年度の研究により、がんの持つ多因子遺伝性を最もよく反映すると考えられるP値を定め、前年度までに開発した複数のリスクスコアの中から一つの多因子遺伝的なリスクスコアを選択した。続いて、選択した多因子遺伝的なリスクスコアを環境要因だけで構成されたがん罹患リスク予測モデルに追加し、その予測能の改善を評価している。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 6件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Polygenic risk scores for prediction of breast cancer risk in Asian populations2022

    • 著者名/発表者名
      Ho Weang-Kee、Tai Mei-Chee、Dennis Joe、Shu Xiang、Li Jingmei、Ho Peh Joo、Millwood Iona Y.、Lin Kuang、Jee Yon-Ho、Lee Su-Hyun、他共著者多数
    • 雑誌名

      Genetics in Medicine

      巻: 24 ページ: 586~600

    • DOI

      10.1016/j.gim.2021.11.008

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Public Access to Summary Statistics for Genome-wide Association Studies of Body Mass Index, Weight, and Height Among Healthy Japanese Individuals: The Japanese Consortium of Genetic Epidemiology Studies2022

    • 著者名/発表者名
      Goto Atsushi、Suzuki Shiori、Katagiri Ryoko、Yamaji Taiki、Sawada Norie、Nakatochi Masahiro、Wakai Kenji、Hozawa Atsushi、Kinoshita Kengo、Tanno Kozo、Shimizu Atsushi、Ito Hidemi、Matsuo Keitaro、Iwasaki Motoki
    • 雑誌名

      Journal of Epidemiology

      巻: 32 ページ: 115~116

    • DOI

      10.2188/jea.JE20210459

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Low MICA Gene Expression Confers an Increased Risk of Graves' Disease: A Mendelian Randomization Study2022

    • 著者名/発表者名
      Sutoh Yoichi、Komaki Shohei、Yamaji Taiki、Suzuki Shiori、Katagiri Ryoko、Sawada Norie、Ono Kanako、Ohmomo Hideki、Hachiya Tsuyoshi、Otsuka-Yamasaki Yayoi、Takashima Akira、Umekage So、Iwasaki Motoki、Shimizu Atsushi
    • 雑誌名

      Thyroid

      巻: 32 ページ: 188~195

    • DOI

      10.1089/thy.2021.0417

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A Personal Breast Cancer Risk Stratification Model Using Common Variants and Environmental Risk Factors in Japanese Females2021

    • 著者名/発表者名
      Oze Isao、Ito Hidemi、Kasugai Yumiko、Yamaji Taiki、Kijima Yuko、Ugai Tomotaka、Kasuga Yoshio、Ouellette Tomoyo K.、Taniyama Yukari、Koyanagi Yuriko N.、Imoto Issei、Tsugane Shoichiro、Koriyama Chihaya、Iwasaki Motoki、Matsuo Keitaro
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 13 ページ: 3796~3796

    • DOI

      10.3390/cancers13153796

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Functional annotation of the 2q35 breast cancer risk locus implicates a structural variant in influencing activity of a long-range enhancer element2021

    • 著者名/発表者名
      Baxter Joseph S.、Johnson Nichola、Tomczyk Katarzyna、Gillespie Andrea、Maguire Sarah、Brough Rachel、Fachal Laura、Michailidou Kyriaki、Bolla Manjeet K.、Wang Qin、他共著者多数
    • 雑誌名

      The American Journal of Human Genetics

      巻: 108 ページ: 1190~1203

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2021.05.013

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Body mass index and colorectal cancer risk: A Mendelian randomization study2021

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Shiori、Goto Atsushi、Nakatochi Masahiro、Narita Akira、Yamaji Taiki、Sawada Norie、Katagiri Ryoko、Iwagami Masao、Hanyuda Akiko、Hachiya Tsuyoshi、他共著者多数
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 112 ページ: 1579~1588

    • DOI

      10.1111/cas.14824

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [備考] 国立がん研究センター 予防研究グループ 多目的コホート研究

    • URL

      http://epi.ncc.go.jp/jphc/index.html

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公開日: 2022-12-28  

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