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ファイトプラズマは昆虫により媒介され、世界各地で農業生産に重大な被害をもたらしている難培養性植物病原細菌の一群である。ファイトプラズマは植物-昆虫間におけるホストスイッチングに伴い自身の遺伝子発現を大きく変動させるが、ファイトプラズマの遺伝子発現制御の詳細は未だ不明である。本研究ではホストスイッチングに伴うファイトプラズマの遺伝子発現制御因子として、主に非コードRNAに着目し、RNAシーケンス解析およびin vitro転写系を用いた解析により、非コードRNAによるファイトプラズマの遺伝子発現制御機構解明を目的としている。
本年度は次世代シーケンサーを用いたRNAシーケンス解析により、OYファイトプラズマ感染宿主における転写産物の網羅的解析を行い、得られたデータから非コードRNAを探索しリスト化した。本解析により、これまでの研究では見いだされていなかった新たな転写産物の存在が確認され、ファイトプラズマの遺伝子発現制御機構解明に向けた大きな足がかりとなった。
加えて、様々なファイトプラズマ種・系統において遺伝子発現制御機構を明らかにするために、ファイトプラズマ由来の核酸を効率的に濃縮・精製可能な系を構築し、本系を用いることでゲノム未解読であったHPファイトプラズマのゲノム解読を実施した。本系を用いることで、ファイトプラズマゲノムを効率的に解析することができるようになるとともに、種・系統間でのゲノム比較によりファイトプラズマ属における遺伝子発現制御機構の保存性の比較が可能となった。
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