NETCAGEによる婦人科癌のエンハンサーに特化した転写制御領域地図の作成

2021 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19K16842
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
• 研究機関: 順天堂大学
• 研究代表者: 吉田 惠美子 順天堂大学, 大学院医学研究科, 助教 (90825788)
• 研究期間 (年度): 2019-04-01 – 2022-03-31
• キーワード: 卵巣癌 / エンハンサー / NETCAGE / プロモーター

研究成果の概要

従来NET- CAGE法には核内RNAの抽出精製を要するが、検体必要量が多いという欠点があった。そこで簡易型のNET-CAGEを開発し、従来より少量かつ簡便な手法での実施が可能となった。 さらに簡易型ではenhancer RNAがより濃縮しており、enhancer解析としても優位であり、19,297のenhancerを検出した。その半分以上(13,035)は新規enhancerであった。さらに明細胞癌ではプロモーター発現レベルでクラスタリングすると、大きく二つのクラスターに分離され、同一の病理組織型でも異なる遺伝子発現分布があり、臨床的サブタイプと相関する遺伝子発現分布の可能性が示唆された。

自由記述の分野

婦人科腫瘍

研究成果の学術的意義や社会的意義

婦人科癌でも様々な大規模な統合的ゲノム解析は実施されてきたが、エンハンサーによる遺伝子の転写制御が婦人科癌の腫瘍形成およびその特性の細分化に中心的な役割を果たしている可能性は未だ十分に検証されていない。本研究では、 臨床データ、ゲノム情報、RNA発現、そして活性化エンハンサー領域を含む統合解析により、エンハンサーに特化した転写制御領域地図の作成を試みた。 活性情報の充実した転写制御領域地図は、発生・維持の根源的な分子メカニズムを解明や、 臨床応用を考慮した新規の治療標的や診断バイオマーカーの同定に発展する可能性だけでなく、今後のヒトゲノムの機能を更に考えるうえで重要な基盤になると期待される。