天然変性タンパク質の動的構造と機能制御機構の解明

2010 年度 自己評価報告書

• 研究課題/領域番号: 20227009
• 研究種目: 基盤研究(S)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 西村 善文 横浜市立大学, 大学院・生命ナノシステム科学研究科, 教授 (70107390)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• キーワード: NMR / 転写因子 / クロマチン / 動的構造 / 天然変性状態

研究概要

本研究においては天然変性タンパク質の動的構造と機能制御機構の解明を行う。真核生物の特に核内タンパク質を標的に、単独では天然変性状態部位を持ち複合体形成に伴って全体としてフォールデイングするテロメア関連因子、ヒストンタンパク質、ヒストンシャペロン、クロマチン関連因子、基本転写因子を対象に、NMRを用いて、単独の時の動的構造、中間体の動的構造、特異的複合体の動的構造を解析し、天然変性タンパク質の認識機構の普遍性を解明する。

研究成果

• [雑誌論文] Structural and bioche mical analyses of thehuman PAD4 var iant encoded by a functional haplot ype gene. (2011)
  • 著者名/発表者名: Horikoshi, N., Tachiwana, H., Saito, K., Osakabe, A., Sato, M., Yamada, M., Akashi, S., Nishimura, Y., Kagawa, W., Kurumizaka, H.
  • 雑誌名: Acta Crystal.D 67 ページ: 112-118
• [雑誌論文] Deiminatio nstabilizes histone H2A/H2B dimers as revealed byelectrospray ionizati on mass spectrometry. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimoyama, S.Nagadoi, A., Tachiwana, H., Yamada, M., Sato, M., Kurumizaka, H., Nishimura, Y., Akashi, S.
  • 雑誌名: J.Mass.Spectrom 45 ページ: 900-908
• [雑誌論文] Novel Structural and Functional Mode of a Knot Essential for RNA Binding Activity of the Esa1 Presumed Chromodomain. (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimojo, H., Sano, N., Moriwaki, Y., Okuda, M., Horikoshi, M., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 378 ページ: 987-1001
• [雑誌論文] Structural insight into the TFIIE/TFIIH interaction : TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH. (2008)
  • 著者名/発表者名: Okuda, M., Tanaka, A., Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y
  • 雑誌名: EMBO J. 27 ページ: 1161-1171
• [雑誌論文] Structural characterization of human general transcription factor TFIIF in solution. (2008)
  • 著者名/発表者名: Akashi, S., Nagakura, S., Yamamoto, S., Okuda, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: Protein Sci. 17 ページ: 389-400
• [学会発表] NMR studies on gene regulation-related proteins : intrinsic disordered states and drug screening
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: Korean Magnetic Resonance Society Meeting開会講演
• [備考] ホームページ
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/stbiol/index.html
• [備考]
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/ynmr/
• [備考]
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/segc/