食道癌におけるマイクロRNA発現とエピジェネティクスの統合解析

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20591569
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 消化器外科学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 佐藤 史顕 京都大学, 薬学研究科, 准教授 (20467426)
• 研究分担者: 土屋 創健 京都大学, 薬学研究科, 助教 (80423002)
• 連携研究者: 嶋田 裕 富山大学, 医学部, 准教授 (30216072)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• キーワード: 食道癌 / エピジェネティクス / マイクロRNA

研究概要

この研究では食道癌をエピゲノムとマイクロRNAの両面から解析した。食道癌細胞の網羅的DNAメチル化情報を得るとともに、マイクロRNA、miR106bクラスターがp21とBim、miR210がEGFRL1、miR141がYAP1、miR593*がPLK1の発現を制御することで食道癌の増殖、細胞周期、抗癌剤感受性に関与していることを明らかにした。これらの成果は食道癌の腫瘍生物学のより深い理解に重要な知見をもたらした。

研究成果

• [雑誌論文] microRNA発現解析技術の最近の進歩 (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐藤史顕、戸井雅和
  • 雑誌名: 血管医学 8月号in press
• [雑誌論文] MicroRNA and Epigenetics. (2011)
  • 著者名/発表者名: Sato F, Tsuchiya S, Meltzer SJ, 清水一治
  • 雑誌名: FEBS Journal, FEBS J. 278(10) ページ: 1598-609
  • 査読あり
• [雑誌論文] MicroRNA-141 confers resistance to cisplatin-induced apoptosis by targeting YAP1 in human esophageal squamous cell carcinoma. (2011)
  • 著者名/発表者名: Imanaka Y, Tsuchiya S, Sato F, Shimada Y, Shimizu K, Tsujimoto G
  • 雑誌名: J Hum Genet. 56 ページ: 270-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] MicroRNA-210 regulates cancer cell proliferation through targeting fibroblast growth factor receptor-like 1 (FGFRL1). (2011)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya S, Fujiwara T, Sato F, Shimada Y, Tanaka E, Sakai Y, Shimizu K, Tsujimoto G
  • 雑誌名: J Biol Chem. 286 ページ: 420-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polo-like kinase 1 regulates cell proliferation and is targeted by miR-593* in esophageal cancer. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Sato F, Kan T, Cheng Y, David S, Agarwal R, Paun BC, Jin Z, Olaru AV, Hamilton JP, Selaru FM, Yang J, Matsumura N, Shimizu K, Abraham JM, Shimada Y, Mori Y, Meltzer SJ.
  • 雑誌名: Int J Cancer.(* : equally contributed)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of aberrant methylation in human breast cancer cells using methyl-DNA immunoprecipitation combined with high-throughput sequencing. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ruike Y, Imanaka Y, Sato F, Shimizu K, Tsujimoto G
  • 雑誌名: BMC Genomics. 11 ページ: 137
  • 査読あり
• [雑誌論文] TOPICS「がんにおけるマイクロRNAとエピジェネティクスの相互制御回路」 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤史顕
  • 雑誌名: 医学の歩み(週刊) 235巻8号 ページ: 884-5
• [雑誌論文] A multicenter, double-blinded validation study of methylation biomarkers for progression prediction in Barrett's esophagus. (2009)
  • 著者名/発表者名: Jin Z, Cheng Y, Gu W, Zheng Y, Sato F, Mori Y, Olaru AV, Paun BC, Yang J, Kan T, Ito T, Hamilton JP, Selaru FM, Agarwal R, David S, Abraham JM, Wolfsen HC, Wallace MB, Shaheen NJ, Washington K, Wang J, Canto MI, Bhattacharyya A, Nelson MA, Wagner PD, Romero Y, Wang KK, Feng Z, Sampliner RE, Meltzer SJ.
  • 雑誌名: Cancer Res. 69 ページ: 4112-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] The miR-106b-25 polycistron, activated by genomic amplification, functions as an oncogene by suppressing p21 and Bim. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kan T, Sato F, Ito T, Matsumura N, David S, Cheng Y, Agarwal R, Paun BC, Jin Z, Olaru AV, Selaru FM, Hamilton JP, Yang J, Abraham JM, Mori Y, Meltzer SJ.
  • 雑誌名: Gastroenterology. 136 ページ: 1689-700
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intra-platform repeatability and interplatform comparability of microRNA microarraytechnology. (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato F, Tsuchiya S, Terasawa K, Tsujimoto G
  • 雑誌名: PLoS One. 4 ページ: e5540
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sustained activation of ERK1/2 by NGF induces microRNA-221 and 222 in PC12 cells. (2009)
  • 著者名/発表者名: Terasawa K, Ichimura A, Sato F, Shimizu K, Tsujimoto G
  • 雑誌名: FEBS J. 276 ページ: 3269-76
  • 査読あり
• [雑誌論文] MicroRNA-338-3p and microRNA-451 contribute to the formation of basolateral polarity in epithelial cells. (2009)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya S, Oku M, Imanaka Y, Kunimoto R, Okuno Y, Terasawa K, Sato F, Tsujimoto G, Shimizu K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37 ページ: 3821-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pituitary tumor-transforming 1 increases cell motility and promotes lymph node metastasis in esophageal squamous cell carcinoma. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Shimada Y, Kan T, David S, Cheng Y, Mori Y, Agarwal R, Paun B, Jin Z, Olaru A, Hamilton JP, Yang J, Abraham JM, Meltzer SJ, Sato F
  • 雑誌名: Cancer Res. 68 ページ: 3214-24
  • 査読あり
• [雑誌論文] Promoter hypermethylation of CDH13 is a common, early event in human esophageal adenocarcinogenesis and correlates with clinical risk factors. (2008)
  • 著者名/発表者名: Jin Z, Cheng Y, Olaru A, Kan T, Yang J, Paun B, Ito T, Hamilton JP, David S, Agarwal R, Selaru FM, Sato F, Abraham JM, Beer DG, Mori Y, Shimada Y, Meltzer SJ.
  • 雑誌名: Int J Cancer. 123 ページ: 2331-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hypermethylation of the AKAP12 promoter is a biomarker of Barrett's-associated esophageal neoplastic progression. (2008)
  • 著者名/発表者名: Jin Z, Hamilton JP, Yang J, Mori Y, Olaru A, Sato F, Ito T, Kan T, Cheng Y, Paun B, David S, Beer DG, Agarwal R, Abraham JM, Meltzer SJ.
  • 雑誌名: Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 17 ページ: 111-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hypermethylation of the somatostatin promoter is a common, early event in human esophageal carcinogenesis. (2008)
  • 著者名/発表者名: Jin Z, Mori Y, Hamilton JP, Olaru A, Sato F, Yang J, Ito T, Kan T, Agarwal R, Meltzer SJ.
  • 雑誌名: Cancer. 112 ページ: 43-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Three-tiered risk stratification model to predict progression in Barrett's esophagus using epigenetic and clinical features. (2008)
  • 著者名/発表者名: Sato F, Jin Z, Schulmann K, Wang J, Greenwald BD, Ito T, Kan T, Hamilton JP, Yang J, Paun B, David S, Olaru A, Cheng Y, Mori Y, Abraham JM, Yfantis HG, Wu TT, Fredericksen MB, Wang KK, Canto M, Romero Y, Feng Z, Meltzer SJ.
  • 雑誌名: PLoS One. 3 ページ: e1890
  • 査読あり
• [雑誌論文] 特集・がん化学療法個別化の現状と展望、トランスクリプトーム解析に基づくがん化学療法の最適化とゲノム創薬。 (2008)
  • 著者名/発表者名: 佐藤史顕、清水一治、辻本豪三
  • 雑誌名: 医薬ジャーナル Vol.44, No.12 ページ: 104-108
• [学会発表] 乳癌におけるmiR-200b/a/429 clusterのEpigenetics発現調節と上皮間葉形質転換への関与 (2011)
  • 著者名/発表者名: 伊藤考晃、佐藤史顕、清水一治、辻本豪三
  • 学会等名: 日本薬学会
  • 発表場所: 静岡、東西日本大震災のため誌上開催
  • 年月日: 2011-03-29
• [学会発表] Trastuzumabによる細胞増殖抑制に関与するmicroRNAの同定及び機能解析市川雄大 (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐藤史顕、寺澤和哉、清水一治、辻本豪三
  • 学会等名: 日本薬学会
  • 発表場所: 静岡、東西日本大震災のため誌上開催
  • 年月日: 2011-03-29
• [学会発表] 3P-0748,4T12-8, miR-210 regulates cancer cell proliferation through targeting FGFRL1. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya S, Fujiwara T, Sato F, Tsujimoto G, Shimizu K.
  • 学会等名: 日本分子生物学会、日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20101209-20101210
• [学会発表] 4P-1187, Bioinformatic identification of tissue specific microRNA targets by mRNA expression profile. (2010)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara T, Tsuchiya S, Sato F, Shimada Y, Tsujimoto G, Shimizu K
  • 学会等名: 日本分子生物学会、日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] Topic 12「microRNAと循環器疾患」Overview and Latest Technologies of microRNAs (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumiaki Sato
  • 学会等名: 日本循環器病学会第74回総会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2010-03-06
• [学会発表] miR-X Contributes to Cisplatin Resistance of Esophageal Cancer cells. (2009)
  • 著者名/発表者名: 今中由花子、土屋創健、佐藤史顕、嶋田裕、清水一治、辻本豪三
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20091200
• [学会発表] Repe atability and compa r ability of microRNA microarray. (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato F, Tsuchiya S, Terasawa K, Tsujimoto G, Shimizu K
  • 学会等名: アメリカ癌学会第100大会
  • 発表場所: Denver
  • 年月日: 20090400
• [学会発表] Symposium 4, "Key-technology in ADMETox Next-generation High-throughput Sequencer and DNA Microarray as ADME Research Tools (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumiaki Sato, Kazuharu Shimizu
  • 学会等名: 日本薬物動態学会第24回年会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2009-11-28
• [学会発表] 日本人類遺伝学会第54回大会 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤史顕、清水一治、辻本豪三
  • 学会等名: Education Program 2、「ゲノム薬理学と個別化医療」EP2-2「発現プロファイルによるがんの個別化医療」
  • 発表場所: 品川
  • 年月日: 2009-09-25
• [学会発表] #PA032、microRNA-210の発現低下による細胞周期停止機能の破綻を介した食道扁平上皮癌細胞の細胞増殖抑制メカニズムの解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 土屋創健、佐藤史顕、藤原大、嶋田裕、辻本豪三、清水一治
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第54回大会
  • 発表場所: 品川
  • 年月日: 2009-09-23
• [学会発表] #PA118、乳癌におけるエピジェネティクス調節されるマイクロRNAのゲノムワイド探索 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤史顕、類家慶直、伊藤考晃、辻本豪三、清水一治
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第54回大会
  • 発表場所: 品川
  • 年月日: 2009-09-23
• [学会発表] シンポジウム11「がんの診断と治療:分子生物学の貢献」演題S11-4「癌におけるマイクロRNA発現のエピジェネティック制御」 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤史顕
  • 学会等名: 第41回日本臨床分子形態学会総会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-09-05
• [学会発表] #P-83 乳がんにおけるエピジェネティクス調節を受けるマイクロRNAの探索 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤史顕、類家慶直、辻本豪三、清水一治
  • 学会等名: 日本エピジェネティクス研究会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-05-23
• [学会発表] #M1600 Upregulation of the Mir-25-93-106b Cluster in Barrett's-Associated Neoplastic Progression.(Gastroenterology) (2008)
  • 著者名/発表者名: Kwisa Kang, Fumiaki Sato, Tetsuo Ito, Stefan David, Yulan Cheng, Yuriko Mori, Rachana Agarwal, Bogdan C. Paun, Zhe Jin, Alexandru Olaru, Florin Selaru, James P. Hamilton, Jian Yang, John M. Abraham, Stephen J. Meltzer.
  • 学会等名: DDW 2008(134(4))(A379-80)
  • 発表場所: San Diego.
  • 年月日: 20080517-20080522
• [学会発表] #M2005 Down-Regulation of PTTG1 By siRNA Suppresses Tumorigenesis and Lymph Node Metastasis of Esophageal Squamous Cell Carcinoma In Vivo.(Gastroenterology) (2008)
  • 著者名/発表者名: Tetsuo Ito, Fumiaki Sato, Kwisa Kang, Stefan David, Yulan Cheng, Yuriko Mori, Rachana Agarwal, Bogdan C. Paun, Zhe Jin, Alexandru Olaru, James P. Hamilton, Florin M. Selaru, Jian Yang, Yutaka Shimada, John M. Abraham, Stephen J. Meltzer.
  • 学会等名: DDW 2008(134(4))(A-449)
  • 発表場所: San Diego.
  • 年月日: 20080517-20080522
• [学会発表] Late-Breaking Abstract, #4P-1510 Reproducibility and Quantitivity of microRNA microarray (2008)
  • 著者名/発表者名: Fumiaki Sato, Soken Tsuchiya, Kazuya Terasawa, Gozoh Tsujimoto, Kazuharu Shimizu
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-12
• [学会発表] #2P-0793 MicroRNA-338 and microRNA-451 regulate localization of betal integrin into basolateral membrane (2008)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya S, Oku M, Imanaka Y, Okuno Y, Terasawa K, Sato F, Shimizu K, Tsujimoto G
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] シンポジウムX「いよいよ本格稼働のファーマコゲノミクス」「食道癌に対するテーラーメイド医療に向けてのバイオマーカーの探索」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 佐藤史顕、土屋創健、辻本豪三、清水一治、嶋田裕
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第53回大会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2008-09-30
• [学会発表] #5012 The mir-106b cluster in Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kan T, Sato F, Ito T, Jin Z, Olaru AV, Paun BC, David S, Selaru FM, Hamilton JP, Cheng Y, Yang J, Mori Y, Abraham JM, Meltzer SJ.
  • 学会等名: AACR 2008
  • 発表場所: San Diego.
  • 年月日: 2008-04-16
• [学会発表] #3456 Down-regulation of Polo-like Kinase 1 by siRNA drastically suppresses proliferation of esophageal cancer cells. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Sato F, Kan T, David S, Cheng Y, Mori Y, Agarwal R, Paun B, Jin Z, Olaru AV, Hamilton JP, Selaru FM, Yang J, Shimada Y, Abraham JM, Meltzer SJ.
  • 学会等名: AACR 2008
  • 発表場所: San Diego.
  • 年月日: 2008-04-15