イネにおいて遺伝子発現制御に関わるシス配列情報整備のための基盤研究

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20880041
• 研究種目: 若手研究(スタートアップ)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 独立行政法人農業生物資源研究所
• 研究代表者: 佐藤 豊 独立行政法人農業生物資源研究所, ゲノムリソースセンター, 任期付研究員 (90510694)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• キーワード: 遺伝子発現 / シス配列

研究概要

遺伝子発現制御に関わるシス配列探索ツール作成を目的とした基盤情報を整備するため、イネで予測された遺伝子の転写開始点より上流1kbと2kbの配列情報を抽出し、さらに同じ発現パターンを示す遺伝子群の情報を大規模な共発現解析によって得た。また、実験によって転写因子の結合配列を効率良く特定できる方法を検討するためProtein Binding Microarray用のプローブ配列を設計し、カスタムアレイを作成した。