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2020 年度 実績報告書

流域におけるノロウイルスの動態把握と流行予測

研究課題

研究課題/領域番号 20H00632
研究機関山口大学

研究代表者

赤松 良久  山口大学, 大学院創成科学研究科, 教授 (30448584)

研究分担者 中尾 遼平  山口大学, 大学院創成科学研究科, 准教授(特命) (10814618)
嶋寺 光  大阪大学, 工学研究科, 准教授 (20647367)
乾 隆帝  福岡工業大学, 社会環境学部, 准教授 (20723844)
栗田 喜久  九州大学, 農学研究院, 准教授 (40725058)
鬼倉 徳雄  九州大学, 農学研究院, 教授 (50403936)
源 利文  神戸大学, 人間発達環境学研究科, 教授 (50450656)
間普 真吾  山口大学, 大学院創成科学研究科, 教授 (70434321)
水上 洋一  山口大学, 大学研究推進機構, 教授 (80274158)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
キーワードノロウイルス / DNA/RNA / 二枚貝 / 流域 / 流行予測 / 環境DNA
研究実績の概要

ノロウイルスをはじめとした腸管系ウイルスの感染流行の予知・予防を目的とした,河川流域のウイルス動態の解明において,河川水中のノロウイルスの存在量,および,その季節変動を把握することは重要である.これまでにノロウイルスの流行期に合わせた河川水中のウイルス濃度の定量が行われてきたが,通年の流域広範囲の定期調査データは乏しい.そこで2020年度の河川調査では,椹野川流域の下水処理場を起点とした上流,および下流の複数地点を対象とした定期的な試料採取を行った.また,採取した河川水試料のノロウイルス検出・定量の予備調査として,魚類などの環境DNA調査で用いられている手法(GF/Fフィルターによる濃縮法)により河川水試料を濃縮し,定量PCRを用いてノロウイルス GI (HuNoV GI)の検出・定量を行った.
その結果,HuNoV GIはいずれの試料からも検出されず,魚類DNAに比べ非常に低濃度で存在していることが確認された.このことから,河川水中のノロウイルスの検出・定量のための河川試料の濃縮手法として,より高感度・高効率な手法の適用・開発する必要があることが確認された.河川水中のノロウイルス濃度の定量値を蓄積する必要性を鑑み,河川水試料採取を継続し,適用可能な濃縮手法が検討されるまでの期間,-80℃で保存した.既報を含めた適切なウイルス濃縮手法の検討・開発を行い,河川水中のノロウイルスの定量を行う予定である.
また,空気中のノロウイルスの検出・定量法の開発に向けて,動物園内において鳥類等の環境DNAのエアーサンプラーを用いた採取を施行した.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

令和2年度は水中・水産物中のノロウイルスの高精度分析法の開発を大目標として実施してきた.特に河川中のノロウイルスの定量には採取時に適切な濃縮が必要となることが明らかとなった.当初,企業と共同で多段階分離回収システムを開発することを予定してたが,新型コロナの影響で十分な連携が取れないことからシステムの開発が遅れた.

今後の研究の推進方策

令和3年度は河川水中のノロウイルスの検出・定量のための高感度・高効率な河川試料の濃縮手法を開発する.また,山口県の椹野川を対象として河川水中のノロウイルスモニタリングを実施する.さらに,引き続き空気中のノロウイルスを検出・定量する方法についても検討する.

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2020

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] COMPARISONS OF FISH DETECTION AMONG ENVIRONMENTAL DNA METABARCODING FROM THREE DIFFERENT GLASS-FIBER FILTER PORE SIZES AND CONVENTIONAL COLLECTION SURVEYS2020

    • 著者名/発表者名
      INUI Ryutei、NAKAO Ryohei、MIYAZONO Seiji、SAITO Minoru、AKAMATSU Yoshihisa、KONO Takanori、KOBAYASHI Kanta
    • 雑誌名

      Journal of Japan Society of Civil Engineers, Ser. B1 (Hydraulic Engineering)

      巻: 76 ページ: I_1297~I_1302

    • DOI

      10.2208/jscejhe.76.2_I_1297

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 環境DNAメタバーコーディングの空間解像度調整に関する検討~フィルターの粒子保持径に着目して~2020

    • 著者名/発表者名
      乾 隆帝
    • 学会等名
      応用生態工学会福岡 2020九州地区事例・研究発表会
  • [学会発表] エアーサンプラーを用いた空気中の環境DNA分析の可能性検討2020

    • 著者名/発表者名
      中尾遼平
    • 学会等名
      第3回環境DNA学会大会・第36回個体群生態学会大会合同大会

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公開日: 2022-12-28  

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