研究課題/領域番号 |
20K06024
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研究機関 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 |
研究代表者 |
住友 克彦 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 野菜花き研究部門, 上級研究員 (70391406)
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研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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キーワード | QTL mapping / flowering time / chrysanthemum |
研究実績の概要 |
解析集団の両親系統の全ゲノム配列を取得した。これらの配列について、公開されたキクタニギク染色体情報をリファレンスとして比較し、両親間で遺伝子機能に影響を及ぼすと想定される塩基変異のリストを得た。その中から、以下の条件で絞り込みを行った。 ・解析集団において見いだされた自然開花期に関する3か所のQTL領域に座乗する ・キクタニギクおよびシロイヌナズナの花成および光周性に関連する その結果、第2染色体のQTL領域には13個、第6染色体のQTL領域には2個の花成および光周性関連遺伝子が見いだされた。いずれの遺伝子も早生親側の配列に変異が入っていた。第4染色体のQTL領域には、塩基変異を有する遺伝子は見いだされなかった。これらの遺伝子がキクタニギクの自然開花期の多様性に影響を与えている可能性が考えられた。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
キクタニギクの染色体情報が公開され,QTL領域に含まれる開花関連遺伝子を探索することによって,原因遺伝子の候補を同定できた.開花特性の遺伝学的解析は順調に実施できていると考えている.
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今後の研究の推進方策 |
QTL候補遺伝子のアノテーション解析、発現解析を実施する。本研究で得られた知見を取りまとめて論文投稿する。
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次年度使用額が生じた理由 |
開花期関連遺伝子の候補を絞り込み、同定できたので、次年度使用額を支出して遺伝子発現解析実験を追加で実施する。また得られた結果をとりまとめ、論文投稿に要する費用に用いる。
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