2023 年度研究成果報告書

新規乾癬病因候補遺伝子PTRF/CAvon-1の細胞機能解析と乾癬病態への関与

研究課題

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研究課題/領域番号	20K08678
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	基金
応募区分	一般
審査区分	小区分53050:皮膚科学関連
研究機関	自治医科大学
研究代表者	津田英利自治医科大学, 医学部, 助教 (30414923)
研究期間 (年度)	2020-04-01 – 2024-03-31
キーワード	乾癬 / Psoriasis / SNP / GWAS / PTRF / Cavin1 / 遺伝子発現
研究成果の概要	最近、GWAS解析により、乾癬と強く関連するSNPが新たに報告され、PTRF/Cavin1という遺伝子のSNPが乾癬病態と深い関連があるという報告がされた。しかしこのSNPは遺伝子のintron上に存在しており、遺伝子機能に対する影響は解らない。そこで、HaCaT細胞に、ゲノム編集にてSNPを導入し、PTRF遺伝子の発現や機能に影響するのか否か、検討することにした。いくつかゲノムが欠損したクローンを得られたが、目的のSNPを導入出来たクローンの取得は出来なかった。いくつかSNP付近で欠損が起こったクローンにて、遺伝子発現解析を行ったが、コントロール細胞と比べて違いを見出すことは出来なかった。
自由記述の分野	分子細胞生物学、遺伝子工学
研究成果の学術的意義や社会的意義	疾患における遺伝的背景にはまだまだ不明なことが多い。また、GWAS解析にて病態との関連が指摘されるSNPは数多く報告されているが、多くの場合はintronに報告されている。exon上にSNPがあり、アミノ酸変異を伴う変異であれば比較的容易に判断できるが、intron上にある場合、一見して遺伝子機能に影響するか否か判断は出来ない。今回この問題に対して研究を行ったが、明らかな違いを示すことは出来なかった。今後更にゲノム編集技術が進歩し、より簡便にゲノム編集を行えるようになれば、新たな遺伝子機能への影響を明らかにすることが可能となると考えている。