| 研究成果の概要 |
細胞分化や疾患発症における各細胞の状態は, 多くの遺伝子を含む相互作用により制御されて異なっているため, 各細胞種での遺伝子間相互作用を推定することは重要となる。本研究では, 1細胞の遺伝子発現データから, 細胞の擬似時系列を推定し, 各細胞種での遺伝子ネットワークを推定する手法を開発した。造血幹細胞分化の発現量データに適用し計算機実験を行なったところ, 数種の細胞種については分化点を推定することが可能であり, また細胞数が多いデータに対しても, 全計算過程の並列化を行うことによって, 計算速度が大幅に向上することを確認した。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究では, 細胞状態が動的に変化する仕組みに着目し, 複数の細胞種への分化に対応した時変遺伝子ネットワーク推定手法を開発する。1細胞の遺伝子発現データを適用することで, 細胞分化や疾患発症において, 細胞状態の遷移を引き起こす遺伝子間相互作用を解明することが期待される。
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