人工廃水を用いて嫌気消化バイオリアクターを467日間運転した。微生物の環境応答をみるため、運転条件の変更を一時的に行った。消化汚泥に13C酢酸または13Cプロピオン酸を添加し、未知微生物の機能同定技術・高感度SIPを適用し、新規な酢酸、プロピオン酸の共生細菌およびメタン生成菌を同定した。リアクター運転期間を通して、同定した微生物の動態を追跡した結果、有機酸が蓄積したイベント時に、メタン生成菌の存在量は減少した。この時、ほとんどの酢酸酸化共生細菌の存在量は減少したが、プロピオン酸酸化細菌は必ずしも減少しなかった。これらの結果は、それぞれの共生細菌でメタン生成菌への依存度が異なることを示唆する。
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