癌の医療方針決定統合システムの開発に関する研究

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21700336
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体生命情報学
• 研究機関: 大島商船高等専門学校
• 研究代表者: 北風 裕教 大島商船高等専門学校, 商船学科, 講師 (70342558)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• キーワード: ニューロインフォマティクス / バイオインフォマティクス / システム生物学

研究概要

セルアレイから取得される遺伝子産物の細胞内分布情報を、可視化アルゴリズムを用いることで、がんを分子レベルで特徴化・分類できる情報処理システムの開発を行った。システムは分類データベース部、可視化部、分類比較部から構成される。医師が直感的に細胞内分布情報を把握できる模式化を行ったことが情報圧縮につながった。また、この情報を利用することで各がん細胞とタンパク質の比較表を作成でき、この比較表から分類を可能にした。

研究成果

• [雑誌論文] Cell Illustratorを用いた細胞システム維持に影響する生命パスウェイ重要部位の推定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 北風裕教
  • 雑誌名: Informatics World No.17 ページ: 4-7
• [学会発表] がん細胞内のタンパク質情報を用いた可視化による分析支援法 (2010)
  • 著者名/発表者名: 北風裕教、井川翔平、伊藤剛、池田信彦、松野浩嗣
  • 学会等名: 電気・情報関連学会中国支部第61回連合大会、p.117
  • 年月日: 20100000
• [学会発表] タンパク質の量と凝集度に基づくSOMによるがん細胞分類システムの動作検証 (2009)
  • 著者名/発表者名: 下村佳史、池田信彦、北風裕教、松野浩嗣
  • 学会等名: 電気・情報関連学会中国支部第60回連合大会、pp.561-562
  • 年月日: 20090000
• [学会発表] タンパク質情報を用いたSOMによるがん細胞分類の実験と評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 立花麻耶、北風裕教、池田信彦、松野浩嗣
  • 学会等名: 電気・情報関連学会中国支部第60回連合大会、pp.563-564
  • 年月日: 20090000
• [学会発表] Prediction Method of Essential Points in a Biological Pathway for Cell System Stability by using Recurrent Neural Network (2009)
  • 著者名/発表者名: Hironori Kitakaze
  • 学会等名: The 2009 International Workshop in "Computational and Integrative Biology"(CIB)、p.90
  • 年月日: 20090000
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.oshima-k.ac.jp/kitakaze/index.php