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2023 年度 実績報告書

回転分子モーターのイオン輸送メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 21H02409
研究機関千葉大学

研究代表者

村田 武士  千葉大学, 大学院理学研究院, 教授 (80415322)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワードV-ATPase / 分子モーター / 構造解析 / イオン輸送 / 分子メカニズム
研究実績の概要

V-ATPaseは、ATPの加水分解エネルギーを回転運動に変換するV1部分と、その回転運動をH+(またはNa+)の濃度勾配エネルギーに変換するVo部分から構成される回転分子モータータンパク質/イオンポンプである。最近我々はクライオ電子顕微鏡を用いて、抗菌剤が結合した腸球菌V-ATPase全複合体の密度マップを得ることに成功した。本研究では、得られた構造・機能解析情報を統合することにより、①本酵素のNa+輸送メカニズム、②抗菌剤によるNa+輸送阻害メカニズム、③Na+輸送とH+輸送の分子メカニズムの違いを解明する。以下に本年度得られた研究成果の概要を記載する。
<1> 腸球菌V-ATPaseの構造解析---昨年度の研究により抗菌剤結合型V-ATPase膜部分の立体構造を分解能2.2Aで決定した。本年度は得られた構造を用いてMDシミュレーションを行い、aサブユニットに存在する細胞外へと続くNa+輸送路を明らかにした。
<2> 腸球菌V-ATPase変異体の機能解析と構造解析---得られた構造情報からNa+輸送に重要と示唆された残基の変異体を作製した。これらの変異体についてATPase活性測定と1分子回転実験を行ない、aサブユニットに存在する細胞内からのNa+輸送路を決定した。
<3> イオン輸送メカニズムの解明---上記で得られた構造・機能解析情報を統合することにより、①本酵素のNa+輸送メカニズム、②抗菌剤によるNa+輸送阻害メカニズム、③Na+輸送とH+輸送の分子メカニズムの違いを明らかにした。これらの成果をまとめた論文を投稿した。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [国際共同研究] Arizona State University/University of Illinois(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Arizona State University/University of Illinois
  • [国際共同研究] University de Lorraine(フランス)

    • 国名
      フランス
    • 外国機関名
      University de Lorraine
  • [雑誌論文] Six states of Enterococcus hirae V-type ATPase reveals non-uniform rotor rotation during turnover2023

    • 著者名/発表者名
      Burton-Smith Raymond N.、Song Chihong、Ueno Hiroshi、Murata Takeshi、Iino Ryota、Murata Kazuyoshi
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 6 ページ: 755

    • DOI

      10.1038/s42003-023-05110-8

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Physical pictures of rotation mechanisms of F1- and V1-ATPases: Leading roles of translational, configurational entropy of water2023

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Satoshi、Hayashi Tomohiko、Murata Takeshi、Kinoshita Masahiro
    • 雑誌名

      Frontiers in Molecular Biosciences

      巻: 10 ページ: 1159603

    • DOI

      10.3389/fmolb.2023.1159603

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Discovery of a novel inhibitor for Na+-transporting V-ATPase enables suppression of VRE colonization in mice and reveals high-resolution structure of the Na+ transport pathway2023

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Murata
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Bioenergetics
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Na+-Transporting V-ATPase Inhibitor Suppresses VRE Growth in Mice and Unveils Na+ Pathway Structure2023

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Murata
    • 学会等名
      21th IPR Retreat
    • 招待講演
  • [学会発表] Physical pictures of rotation mechanisms of F1- and V1-ATPases: Leading roles of translational, configurational entropy of water2023

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Takeshi Murata and Masahiro Kinoshita
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
  • [産業財産権] 抗菌組成物及び医薬並びに抗菌方法2024

    • 発明者名
      村田武士、阿部晶平、鈴木花野、後藤義幸
    • 権利者名
      村田武士、阿部晶平、鈴木花野、後藤義幸
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      PCT/JP2024/914
    • 外国

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公開日: 2024-12-25  

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