グリオーマ遺伝子パネルによる日本人グリオーマ患者での網羅的ゲノム・エピゲノム解析

2022 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 21K16636
• 研究機関: 鹿児島大学
• 研究代表者: 比嘉 那優大 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (90792200)
• 研究期間 (年度): 2021-04-01 – 2023-03-31
• キーワード: EGFR / PDGFRA / TERTp / ARID1A / 遺伝子パネル

研究実績の概要

カスタム遺伝子パネル検査を用いてグリオーマの遺伝子解析を行い、膠芽腫ではEGFR遺伝子変化が予後良好因子であることを見出した。また欧米と比較して日本人ではEGFR遺伝子変異の頻度は低いが、EGFRキナーゼドメインに変異をもつ割合が高いことを見出した。
また膠芽腫ではPDGFRA gain/ampが予後不良因子であり、MGMTpメチル化とPDGFRA gain/ampを組み合わせることで予後の層別化が可能であることを見出した。
300例以上のグリオーマの解析において、日本人グリオーマ患者の遺伝子プロファイルを明らかにした。日本人においては、膠芽腫ではTERTp変異、EGFR遺伝子変化の割合が海外と比較すると低いが、PDGFRA遺伝子変化の割合が高いことを報告し、人種差があることを明らかにした。WHO2021脳腫瘍分類では分類不能であるNECが相当数存在することを見出し、さらなる分子マーカーの創出が必要であることを提起した。Oligodendroglial tumorではARID1A変異が予後不良因子であることを見出した。
以上のように、当該研究により日本人グリオーマ患者の遺伝子プロファイルを明らかにし、いくつかの予後バイオマーカーを発見することに成功した。今後、これらの知見をもとに個別化医療につながる可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Distribution and favorable prognostic implication of genomic EGFR alterations in IDH-wildtype glioblastoma. (2022)
  • 著者名/発表者名: Higa N, Akahane T, Hamada T, Yonezawa H, Uchida H, Makino R, Watanabe S, Takajo T, Yokoyama S, Kirishima M, Matsuo K, Fujio S, Hanaya R, Tanimoto A, Yoshimoto K
  • 雑誌名: Cancer Medicine 巻: 12 ページ: 49～60
  • DOI: 10.1002/cam4.4939
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Prognostic impact of PDGFRA gain/amplification and MGMT promoter methylation status in patients with IDH wild-type glioblastoma (2022)
  • 著者名/発表者名: Higa N, Akahane T, Yokoyama S, Yonezawa H, Uchida H, Takajo T, Otsuji R, Hamada T, Matsuo K, Kirishima M, Hata N, Hanaya R, Tanimoto A, Yoshimoto K
  • 雑誌名: Neuro-Oncology Advances 巻: 4 ページ: -
  • DOI: 10.1093/noajnl/vdac097
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Molecular Genetic Profile of 300 Japanese Patients with Diffuse Gliomas Using a Glioma-tailored Gene Panel (2022)
  • 著者名/発表者名: Higa N, Akahane T, Yokoyama S, Yonezawa H, Uchida H, Fujio S, Kirishima M, Takigawa K, Hata N, Toh K, Yamamoto J, Hanaya R, Tanimoto A, Yoshimoto K
  • 雑誌名: Neurologia medico-chirurgica 巻: 62 ページ: 391～399
  • DOI: 10.2176/jns-nmc.2022-0103
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] IDH wild-type GBMにおけるPDGFRA amplificationの予後への影響 (2022)
  • 著者名/発表者名: 比嘉 那優大
  • 学会等名: 日本分子脳外科学会
• [学会発表] IDH wild-type GBMにおけるPDGFRA amplificationおよびMGMTpメチル化の予後への影響 (2022)
  • 著者名/発表者名: 比嘉 那優大
  • 学会等名: 日本脳腫瘍病理学会
• [学会発表] カスタム遺伝子パネルを用いて解析したグリオーマ300例の遺伝子プロファイルとWHO2021分類に基づく再分類 (2022)
  • 著者名/発表者名: 比嘉 那優大
  • 学会等名: 日本脳神経外科学会総会
• [学会発表] カスタムNGSパネルを用いたグリオーマ300例の解析-分子プロファイルの特徴と予後バイオマーカー- (2022)
  • 著者名/発表者名: 比嘉 那優大
  • 学会等名: 日本脳腫瘍学会