• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2022 年度 実施状況報告書

Epigenome readerによる環境記憶形成機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K19513
研究機関熊本大学

研究代表者

日野 信次朗  熊本大学, 発生医学研究所, 准教授 (00448523)

研究期間 (年度) 2021-07-09 – 2024-03-31
キーワードクロマチン / 環境応答 / 細胞記憶
研究実績の概要

環境摂動によって表現型が決定される現象は、自然界ではしばしば見られる。近年、同様の現象がヒトの体質形成や疾患発症にも関係すると考えられている。本研究は、このような現象の基盤となる環境応答性エピゲノム記憶形成機構の解明を目的として実施している。
本年度は、筋芽細胞を用いて一過性ストレスに対するクロマチン構造変換をATAC-seq法により検討した。この結果を元に、細胞記憶形成に関わるクロマチン制御因子の候補を同定し、これらの機能解析を実施した。
また、ミトコンドリアストレスに応答してクロマチン構造変換を誘導する分子機序を解明した。その仕組みは、代謝ストレス応答転写因子c-Junと物理ストレス応答転写因子TEAD/YAPとヒストン修飾因子群の共役により成り立っていた。
これらの成果は、環境ストレスが細胞レベルで記憶される仕組みの一端を明らかにするものであり、代謝疾患等様々な慢性疾患の病態解明に貢献する。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の計画通り、本年度までに環境ストレスに対するクロマチン構造の長期変化の全体像を解明することができ、制御因子の候補を同定することができた。また、ミトコンドリアストレスを感知してクロマチン構造変換を行う分子機構を解明することができた。これらの成果は当初の研究目的に大きく貢献するものであるため、本課題は順調に進捗していると判断した。

今後の研究の推進方策

本年度までの進捗を踏まえて、環境応答性エピゲノム記憶形成の詳細な分子機序の解明と生体内における実態解明を目指して研究を実施する。
1. 環境応答性エピゲノム記憶形成の分子機序
これまでに同定しているエピゲノム形成因子の機能解析を行う。エピゲノム形成における役割の解明や相互作用タンパク質の同定等を試みる。さらに、新たな制御因子の同定を機能スクリーニングにより実施する。
2. 環境応答エピゲノム記憶の生体内における実態
これまで培養細胞を用いた実験により見出したエピゲノム・クロマチン構造変化が実際に生体内で検出できるかを検討する。また、環境応答エピゲノムの生体維持における役割を検証する。

次年度使用額が生じた理由

本年度までの結果を踏まえて、大規模なNGS解析やスクリーニングを実施するため、相応の資金を要すると判断した。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 備考 (3件)

  • [国際共同研究] コーンケン大学(タイ)

    • 国名
      タイ
    • 外国機関名
      コーンケン大学
  • [国際共同研究] ケルン大学(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      ケルン大学
  • [雑誌論文] LSD1 defines the fiber type-selective responsiveness to environmental stress in skeletal muscle2023

    • 著者名/発表者名
      Araki Hirotaka、Hino Shinjiro、Anan Kotaro、Kuribayashi Kanji、Etoh Kan、Seko Daiki、Takase Ryuta、Kohrogi Kensaku、Hino Yuko、Ono Yusuke、Araki Eiichi、Nakao Mitsuyoshi
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 12 ページ: e84618

    • DOI

      10.7554/eLife.84618

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Lactic acidosis induces metabolic and phenotypic reprogramming in cholangiocarcinoma cells via the upregulation of thrombospondin‐12023

    • 著者名/発表者名
      Thamrongwaranggoon Ubonrat、Kuribayashi Kanji、Araki Hirotaka、Hino Yuko、Koga Tomoaki、Seubwai Wunchana、Wongkham Sopit、Nakao Mitsuyoshi、Hino Shinjiro
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 114 ページ: 1541~1555

    • DOI

      10.1111/cas.15699

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq) for Detecting Histone Modifications and Modifiers2023

    • 著者名/発表者名
      Hino Shinjiro、Sato Tetsuya、Nakao Mitsuyoshi
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2577 ページ: 55~64

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2724-2_4

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mitochondrial stress induces AREG expression and epigenomic remodeling through c-JUN and YAP-mediated enhancer activation2022

    • 著者名/発表者名
      Hino Yuko、Nagaoka Katsuya、Oki Shinya、Etoh Kan、Hino Shinjiro、Nakao Mitsuyoshi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 50 ページ: 9765~9779

    • DOI

      10.1093/nar/gkac735

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Lactic acidosis promotes aggressive features of cholangiocarcinoma cells via upregulating ALDH1A3 expression through EGFR axis2022

    • 著者名/発表者名
      Thamrongwaranggoon Ubonrat、Detarya Marutpong、Seubwai Wunchana、Saengboonmee Charupong、Hino Shinjiro、Koga Tomoaki、Nakao Mitsuyoshi、Wongkham Sopit
    • 雑誌名

      Life Sciences

      巻: 302 ページ: 120648~120648

    • DOI

      10.1016/j.lfs.2022.120648

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Biosynthesis of S-adenosyl-methionine enhances aging-related defects in Drosophila oogenesis2022

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Yoshiki、Kashio Soshiro、Murotomi Kazutoshi、Hino Shinjiro、Kang Woojin、Miyado Kenji、Nakao Mitsuyoshi、Miura Masayuki、Kobayashi Satoru、Namihira Masakazu
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 ページ: 5593

    • DOI

      10.1038/s41598-022-09424-1

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] リボフラビンとフラボタンパク質による細胞制御2022

    • 著者名/発表者名
      日野信次朗
    • 雑誌名

      実験医学増刊(栄養・代謝物シグナルと食品機能)

      巻: 40 ページ: 1161-1167

  • [学会発表] 環境因子とエピジェネティクス因子の相互作用による骨格筋の「質」と「量」の調節2022

    • 著者名/発表者名
      日野信次朗
    • 学会等名
      日本基礎老化学会第43回シンポジウム
    • 招待講演
  • [学会発表] Epigenetic regulation of energy metabolism in health and diseases2022

    • 著者名/発表者名
      Shinjiro Hino
    • 学会等名
      Center of Translational Medicine Seminar, Khon Kaen University
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 熊本大学発生医学研究所HP

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp

  • [備考] プレスリリース「筋肉の過剰な環境適応を抑える仕組みを解明」

    • URL

      https://www.kumamoto-u.ac.jp/whatsnew/seimei-sentankenkyu/20230209

  • [備考] プレスリリース「ミトコンドリアから細胞核への逆行性シグナリングと標的遺伝子の解明」

    • URL

      https://www.kumamoto-u.ac.jp/whatsnew/seimei-sentankenkyu/20220913

URL: 

公開日: 2023-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi