ヘリコバクターピロリ菌感染を背景とした胃癌症例の化生上皮と非化生上皮を用いて、1腺管単位で1サンプルとしたDNA用の検体と、複数腺管をまとめたDNA/RNA用検体とを作成した。それぞれから抽出したDNA,RNAをもとに次世代シーケンサーを使用してDNA配列およびRNA発現量を解析し、得られたゲノムデータをもとにコピー数変化を算出した。腸上皮化生腺管は非化生腺管と比較して遺伝子変異数が非常に多く、腸上皮化生腺管は分裂を繰り返すことによりそのクローン領域を拡大していることがわかり、また腸上皮化生はおなじ症例においても非化生腺管と比較して遺伝子修復酵素の発現が低下していることが分かった。
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