ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援

2014 年度 実績報告書

• 研究領域: ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援
• 研究課題/領域番号: 221S0002
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 小原 雄治 国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 特任教授 (70135292)
• 研究分担者: 久原 哲 九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (00153320) ; 井ノ上 逸朗 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 教授 (00192500) ; 林 哲也 宮崎大学, フォロンティア科学実験総合センター, 教授 (10173014) ; 加藤 和人 大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (10202011) ; 豊田 敦 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 特任准教授 (10267495) ; 榊原 康文 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (10287427) ; 矢田 哲士 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (10322728) ; 黒木 陽子 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 准教授 (10344037) ; 桑野 良三 新潟大学, 脳研究所, フェロー (20111734) ; 黒川 顕 東京工業大学, 地球生命研究所, 教授 (20343246) ; 浅井 潔 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (30356357) ; 徳永 勝士 東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (40163977) ; 鈴木 穣 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (40323646) ; 菅野 純夫 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (60162848) ; 山本 健 久留米大学, 医学部, 教授 (60274528) ; 中村 保一 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授 (60370920) ; 笠原 雅弘 東京大学, 新領域創成科学研究科, 講師 (60376605) ; 辻 省次 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (70150612) ; 田畑 哲之 公益財団法人かずさDNA研究所, その他部局等, 所長 (70197549) ; 森下 真一 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (90292854) ; 岩崎 渉 東京大学, 大学院理学系研究科, 准教授 (50545019)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: 次世代DNAシーケンサ / RNA-seq / ChIP-seq / de novo配列決定 / 個人ゲノム / リシーケンシング / GWAS / インフォームドコンセント

研究実績の概要

支援課題公募では161件の応募があり、90件を選定し支援した。ゲノム関係は論文発表まで時間がかかるが、支援成果も加えて、本年度は112報が発表され、今後のさらなる増加が見込まれる。
多細胞生物支援では、大型ゲノムの新たな配列決定は本年度12課題に上った。シロオビアゲハのゲノム解読支援は擬態に関するスーパージーンの構造解明につながり、論文化に至った（藤原ら）。スンクス、ポリプテルスゲノム解読は論文化進行中である。また、様々な角度からトランスクリプトーム、エピゲノム解析を行い、RIP Seq/RNA Seq/ChIP Seq法を駆使して免疫担当細胞におけるRegnase1の作用機序の詳細の解明（竹内ら）等の成果を得た。微生物支援では、環境中の窒素・硫黄循環を担う微生物共生系の解析（淡水性のものとしては世界初であり、２種類の難培養細菌のドラフト配列、代謝中心菌のメタゲノム配列から完全配列再構成に成功、福井ら）等の論文発表につながった。ゲノム医科学支援では、レット症候群、変形性関節症、痛風、小児交互性片麻痺等の遺伝子解析、PAR-CLIP法による神経変性機構解明等で成果が得られた。ゲノム解析技術開発においては、1分子シーケンシング手法（PacBio、ナノポア）、1細胞解析技術の開発整備を進めた。情報解析支援では、MetaVelvet-SLやSprai等のアッセンブラー、GPGPUによる超高速相同性検索ソフトウェア、エピゲノムデータからクロマチン状態を推定する手法、ChIP-Seqデータからタンパク質配列解析手法等の開発改良を進めるとともに、ゲノム支援講習会を開催した。ゲノムELSIユニットでは個人ゲノム解読の倫理問題への実務的支援について効率的なシステムを構築し、昨年度に引き続き医科学支援を推進した。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

医科学分野は，研究倫理審査委員会の承諾を得ることに時間を要することも含め、研究開始から論文発表まで長期間を要するが、論文発表が実現した研究が増えてきており，支援の達成度は高まっている。
多細胞生物支援については、当初懸念された多くの困難にも関わらず、ほとんどの課題について一定の成果が得られている。
微生物支援については、一部を除くと全て希望した支援ができている。
情報解析支援については、PacBioに特化したアセンブラの開発や、メタゲノムデータに対するアセンブラの開発、またGPUを利用した超高速相同性検索ソフトウェアの開発、解析パイプラインの整備も進んでおり、論文化も進んだ。多様な支援課題に柔軟に対応する体制の構築ができたが、一方で、解析を担当する研究員が不足しており、OJT形式による教育を含めたさらなる人材育成の推進が課題である。
ELSI、実務的支援については、相当な経験が蓄積し、活動の流れが確立した。

今後の研究の推進方策

1年間の延長となったことにより、改めて最終年度としてのとりまとめのために論文化を推進する。このために情報解析支援班の更なる強化を図る。また、1分子解析、１細胞解析などの最新技術開発整備を推進する。
このような課題への対策とともに、次期体制の構築を進める。

研究成果

• [雑誌論文] Analysis of RNA decay factor mediated RNA stability contributions on RNA abundance. (2015)
  • 著者名/発表者名: Maekawa S., Imamachi N., Irie T., Tani H., Matsumoto K., Mizutani R., Imamura K., Kakeda M., Yada T., Sugano S., Suzuki Y. and Akimitsu N.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 16 ページ: 154
  • DOI: 10.1186/s12864-015-1358-y
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ecophysiology of Thioploca ingrica as revealed by the complete genome sequence supplemented with proteomic evidence. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hisaya Kojima, Yoshitoshi Ogura, Nozomi Yamamoto, Tomoaki Togashi, Hiroshi Mori, Tomohiro Watanabe, Fumiko Nemoto, Ken Kurokawa, Tetsuya Hayashi and Manabu Fukui
  • 雑誌名: The ISME Journal 巻: 9 ページ: 1166-1176
  • DOI: 10.1038/ismej.2014.209
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] How should the legal framework for the protection of human genomic data be formulated?―Implications from the revision processes of the Act on the Protection of Personal Information (PPI Act). (2015)
  • 著者名/発表者名: Natsuko Yamamoto, Minae Kawashima, Takanori Fujita, Masatomo Suzuki and Kazuto Kato.
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 60 ページ: 225-226
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.121
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] DomSign: a top-down annotation pipeline to enlarge enzyme space in the protein universe. (2015)
  • 著者名/発表者名: Wang T, Mori H, Zhang C, Kurokawa K, Xing XH, Yamada T
  • 雑誌名: BMC Bioinfo. 巻: 16 ページ: 96
  • DOI: 10.1186/s12859-015-0499-y
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A genetic mechanism for female-limited Batesian mimicry in Papilio butterfly (2015)
  • 著者名/発表者名: Hideki Nishikawa, Takuro iijima, Rei Kajitani, Junichi Yamaguchi, Toshiya Ando, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Asao Fujiyama, Shunichi Kosugi, Hideki Hirakawa, Satoshi Tabata, Katsuhisa Ozaki, Hiroya Morimoto, Kunio Ihara, Madoka Obara, Hiroshi Hori, Takehiko Ito & Haruhiko Fujiwara
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 47（4） ページ: 405-409
  • DOI: doi:10.1038/ng.3241
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete genome sequence of Methylobacterium aquaticum strain 22A isolated from a moss, Racomitrium japonicum. (2015)
  • 著者名/発表者名: Akio Tani Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Kazuhide Kimbara.
  • 雑誌名: Genome Announcements 巻: 3（2） ページ: e00266-15
  • DOI: doi:10.1128/genomeA.00266-15.
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Colony Multiplex Quantitative PCR-Based 3S3DBC Method and Variations of It for Screening DNA Libraries (2015)
  • 著者名/発表者名: Yang An, Atsushi Toyoda, Chen Zhaom, Asao Fujiyama, Kiyokazu Agata
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 ページ: e0116997
  • DOI: DOI: 10.1371/journal.pone.0116997
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene activation-associated long noncoding RNAs function in mouse preimplantation development. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nobuhiko Hamazaki, Masahiro Uesaka, Kinichi Nakashima, Kiyokazu Agata, and Takuya Imamura.
  • 雑誌名: Development 巻: 142 ページ: 910-920
  • DOI: doi: 10.1242/dev.116996
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of long noncoding RNA turnover (2015)
  • 著者名/発表者名: Tani H., Imamachi N., Mizutani R., Imamura K., Kwon Y., Miyazaki S., Maekawa S., Suzuki Y. and Akimitsu N.
  • 雑誌名: Methods in Mol. Biol. 巻: 1262 ページ: 305-320
  • DOI: DOI10.1007/978-1-4939-2253-6_19
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene activation-associated long noncoding RNAs function in mouse preimplantation development (2015)
  • 著者名/発表者名: Hamazaki N, Uesaka M, Nakashima K, Agata K, Imamura T
  • 雑誌名: Development 巻: 142(5) ページ: 910-920
  • DOI: doi: 10.1242/dev.116996
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Novel mitochondria-targeted heat-soluble proteins identified in the anhydrobiotic Tardigrade improve osmotic tolerance of human cells. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tanaka S, Tanaka J, Miwa Y, Horikawa DD, Katayama T, Arakawa K, Toyoda A, Kubo T, Kunieda T
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 10(2) ページ: e0118272
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0118272.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Draft genome sequence of the archiascomycetous yeast Saitoella complicata. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kenta Yamauchi, Shinji Kondo, Makiko Hamamoto, Yurika Takahashi, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Hiromi Nishida
  • 雑誌名: Genome Announc. 巻: in press ページ: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study identifies a PSMD3 variant associated with neutropenia in interferon-based therapy for chronic hepatitis C. (2015)
  • 著者名/発表者名: Iio E, Matsuura K, Nishida N, Maekawa S, Yatsuhashi H, Kurosaki M, Izumi N, Hiasa Y, Masaki N, Ide T, Hino K, Tamori A, Honda M, Kaneko S, Mochida S, Nomura H, Nishiguchi S, Okuse C, Itoh Y, Yoshiji H, Sakaida I, Yamamoto K, Watanabe H, Hige S, Matsumoto A, Tanaka E, Tokunaga K, and Tanaka Y.
  • 雑誌名: Hum. Genet. 巻: 134 ページ: 279-289
  • DOI: 10,1007/s00439-014-1520-7.
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Polymorphism in CCR1/CCR3 Is Associated with Narcolepsy (2015)
  • 著者名/発表者名: Toyoda H, Miyagawa T, Koike A, Kanbayashi T, Kawamura Y, Otowa T, Miyashita A, Kashiwase K, Khor SS, Yamasaki M, Kuwano R, Sasaki T, Ishigooka J, Kuroda K, Kume K, Chiba S, Yamada N, Okawa M, Hirata K, Mizuki N, Uchimura N, Shimizu T, Inoue Y, Honda Y, Mishima K, Honda M, Tokunaga K
  • 雑誌名: Brain Behav. Immun. 巻: in press ページ: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid detection of expanded short tandem repeats in personal genomics using hybrid sequencing (2015)
  • 著者名/発表者名: Koichiro Doi, Taku Monjo, Pham H Hoang, Jun Yoshimura, Hideaki Yurino, Jun Mitsui, Hiroyuki Ishiura, Yuji Takahashi, Yaeko Ichikawa, Jun Goto, Shoji Tsuji, Shinichi Morishita
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 30 ページ: 815-822
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btt647
  • 査読あり
• [雑誌論文] A linear time algorithm for detecting long genomic regions enriched with a specific combination of epigenetic states (2015)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Ichikawa, Shinichi Morishita
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 16 ページ: S8
  • DOI: 10.1186/1471-2164-16-S2-S8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tepidicaulis marinus gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium reducing nitrate to nitrous oxide strictly under microaerobic conditions. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mio Takeuchi, Takao Yamagishi, Yoichi Kamagata, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Taiki Katayama, Satoshi Hanada, Hideyuki Tamaki, Katsumi Marumo, Hiroto Maeda, Munetomo Nedachi, Wataru Iwasaki, Yuichi Suwa, and Susumu Sakata.
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: in press ページ: in press
  • DOI: 10.1099/ijs.0.000167
  • 査読あり
• [雑誌論文] A machine learning based approach to de novo sequencing of glycans from tandem mass spectrometry spectrum. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kumozaki, S., Sato, K., and Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform, 巻: in press ページ: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] MetaVelvet-SL: An extension of the Velvet assembler to a de novo metagenomic assembler utilizing supervised learning. (2015)
  • 著者名/発表者名: Afiahayati, Sato, K., and Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 22(1) ページ: 69-77
  • DOI: 10.1093/dnares/dsu041.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Learning chromatin states with factorized information criteria (2015)
  • 著者名/発表者名: Michiaki Hamada, Yukiteru Ono, Ryohei Fujimaki and Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: in press ページ: in press
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btv163
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of RNA decay factor mediated RNA stability contributions on RNA abundance (2015)
  • 著者名/発表者名: Sho Maekawa, Naoto Imamachi, Takuma Irie, Hidenori Tani, Kyoko Matsumoto, Rena Mizutani, Katsutoshi Imamura, Miho Kakeda, Tetsushi Yada, Sumio Sugano, Yutaka Suzuki and Nobuyoshi Akimitsu
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 16 ページ: 154
  • DOI: 10.1186/s12864-015-1358-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] 医療情報の共有・利用における現状と課題―医療情報共有における一般市民の意識調査 (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋本泰成
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12 ページ: 67-87
• [雑誌論文] 「全ゲノム解析研究に関する一般市民を対象とした意識調査」の結果報告 (2015)
  • 著者名/発表者名: 大橋範子・大北全俊
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12 ページ: 88-104
• [雑誌論文] パーソナルゲノム時代の解析データの共有―データ公開・共有方針と倫理的対応 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三成寿作
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12 ページ: 105-114
• [雑誌論文] 個人の遺伝情報の保護における国レベルでのルール形成に向けた試論―個人情報保護法とその改正法を中心に (2015)
  • 著者名/発表者名: 山本奈津子・鈴木正朝・川嶋実苗・藤田卓仙
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12 ページ: 115-123
• [雑誌論文] 社会とともに進めるゲノム医学研究―国際ワークショップ開催報告 (2015)
  • 著者名/発表者名: 吉澤剛
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12 ページ: 131-145
• [雑誌論文] Single-cell analysis of lung adenocarcinoma cell lines reveals diverse expression patterns of individual cells invoked by a molecular target drug treatment. (2015)
  • 著者名/発表者名: Suzuki A, Matsushima K, Makinoshima H, Sugano S, Kohno T, Tsuchihara K, Suzuki Y
  • 雑誌名: Genome Biology 巻: 16 ページ: 66-66
  • DOI: doi:10.1186/s13059-015-0636-y
• [雑誌論文] DBTSS as an integrative platform for transcriptome, epigenome and genome sequence variation data. DNA methylation patterns. (2015)
  • 著者名/発表者名: Suzuki A, Wakaguri H, Yamashita R, Kawano S, Tsuchihara K, Sugano S, Suzuki Y, Nakai K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 43 ページ: D87-91
  • DOI: 10.1093/nar/gku1080
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regnase-1 and Roquin regulate common inflammation-related mRNAs in translation-dependent and independent manners. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takashi Mino, Yasuhiro Murakawa, Akira Fukao, Alexis Vandenbon, Hans-Hermann Wessels, Daisuke Ori, Takuya Uehata, Sarang Tartey, Shizuo Akira, Yutaka Suzuki, Carola G. Vinuesa, Uwe Ohler, Daron M. Standley, Markus Landthaler, Toshinobu Fujiwara, Osamu Takeuchi
  • 雑誌名: Cell 巻: in press ページ: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discovery of osmotic sensitive transcription factors in fish intestine via a transcriptomic approach. (2014)
  • 著者名/発表者名: Marty KS Wong, Haruka Ozaki, Yutaka Suzuki, Wataru Iwasaki and Yoshio Takei
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 ページ: 1134
  • DOI: doi:10.1186/1471-2164-15-1134
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Light and pheromone-sensing neurons regulates cold habituation through insulin signalling in Caenorhabditis elegans (2014)
  • 著者名/発表者名: Akane Ohta, Tomoyo Ujisawa, Satoru Sonoda & Atsushi Kuhara
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 5 ページ: 4412
  • DOI: DOI: 10.1038/ncomms5412
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The newt reprograms mature RPE cells into a unique multipotent state for retinal regeneration. (2014)
  • 著者名/発表者名: Islam, M.R., Nakamura, K., Casco-Robles, M.M., Kunahong, A., Inami, W., Toyama, F., Maruo, F. and Chiba, C
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 4 ページ: 6043
  • DOI: doi:10.1038/srep06043
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Sperm proteases that may be involved in the initiation of sperm motility in the newt, Cynops pyrrhogaster. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yokoe M., Sano, M., Shibata, H., Shibata, D., Takayama-Watanabe, E., Inaba, K. and Watanabe, A
  • 雑誌名: Int. J. Mol. Sci. 巻: 15 ページ: 15210-15224
  • DOI: doi:10.3390/ijms150915210
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A transcriptome for the study of early processes of retinal regeneration in the adult newt, Cynops pyrrhogaster. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, K., Islam, M.R., Takayanagi, M., Yasumuro, H., Inami, W., Kunahong, A., Casco-Robles, R.M., Toyama, F*. and Chiba, C
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9(10) ページ: e109831
  • DOI: DOI: 10.1371/journal.pone.0109831
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] HAP2/GCS1 is involved in the sexual reproduction system of the marine macroalga Ulva compressa (Ulvales, Chlorophyta). (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki, T., Endo, M., Ito, Kan., Suzuki, R., Ota, S., Kuwano K., Miyamura, S., Toyoda, A., Kawano, S.
  • 雑誌名: Cytologia 巻: 79(4) ページ: 575-584
  • DOI: DOI: 10.1508/cytologia.79.575
  • 査読あり
• [雑誌論文] Technical Note: A transformation system using rbcS N-terminal region fused with GFP demonstrates pyrenoid targeting of the small subunit of RubisCO in Ulva compress (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, R., Yamazaki, T., Toyoda, A. and Kawano, S.
  • 雑誌名: Cytologia 巻: 79(4) ページ: 427-428
  • DOI: DOI: 10.1508/cytologia.79.427
  • 査読あり
• [雑誌論文] Long noncoding RNA NEAT1-dependent SFPQ relocation between nuclear body paraspeckle and promoter mediates IL8 expression in response to immune stimuli. (2014)
  • 著者名/発表者名: Imamura K., Imamachi N., Akizuki G., Kumakura M., Kawaguchi A., Nagata K., Kato A., Kawaguchi Y., Sato H., Yoneda M., Kai C., Yada T., Suzuki Y., Yamada T., Ozawa T., Kaneki K., Inoue T., Kobayashi M., Kodama T., Wada Y., Sekimizu K. and Akimitsu N.
  • 雑誌名: Mol. Cell 巻: 53 ページ: 393-406
  • DOI: doi.org/10.1016/j.molcel.2014.01.009
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification of the Carotenoid Modifying Gene PALE YELLOW PETAL 1 as an Essential Factor in Xanhtophyll Esterification and Yellow Flower Pigmentation in Tomato (Solanum lycopersicum). (2014)
  • 著者名/発表者名: Tohru Ariizumi, Sanae Kishimoto, Ryo Kakami, Takashi Maoka, Hideki Hirakawa, Yutaka Suzuki, Yuko Ozeki, Kenta Shirasawa, Stephane Bernillon, Yoshihiro Okabe, Annick Moing, Erika Asamizu, Christophe Rothan, Akemi Ohmiya and Hiroshi Ezura
  • 雑誌名: The Plant Journal 巻: 79 ページ: 453-465
  • DOI: DOI: 10.1111/tpj.12570
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inermediate Form Between Alternating Hemiplegia of Childhood and Rapid-Onset Dystonia-Parkinsonism. (2014)
  • 著者名/発表者名: Sasaki M., Ishii A., Saito Y. and Hirose S.
  • 雑誌名: Movement Disorders 巻: 29(1) ページ: 153-154
  • DOI: DOI: 10.1002/mds.25659
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Distinct neurologocal disorders with ATP1A3 mutations. (2014)
  • 著者名/発表者名: Erin L. Heinzen, Alexis Arzimanoglou, Allison Brashear, Steven J. Clapcote, Fiorella Gurrieri, David B. Goldstein, Sigurour H. Johannesson, Mohamad A. Mikati, M.D., Brian Neville, FRCPCH, Sophie Nicole, Laurie J. Ozelius,
  • 雑誌名: Lancent Neurol. 巻: 13 ページ: 503-514
  • DOI: doi: 10.1016/S1474-4422(14)70011-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genotype-Phenotype Correlations in Alternating Hemiplegia of Childhood. (2014)
  • 著者名/発表者名: Masayuki Sasaki, Atsushi Ishii, Yoshiaki Saito, Naoya Morisada, Kazumoto Iijima, Satoshi Takada, Atsushi Araki, Yuko Tanabe, Hidee Arai, Sumimasa Yamashita, Tsukasa Ohashi, Yoichiro Oda, Hiroshi Ichiseki, Shininchi Hirabayashi, Akihiro Yasuhara, Hisashi Kawawaki,and Shinichi Hirose
  • 雑誌名: NEUROLOGY 巻: 82(6) ページ: 482-490
  • DOI: doi: 10.1212/WNL.0000000000000102
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene Content Evolution in Discobid Mitochondria Deduced from Phylogenic Position and Complete Mitochondrial Genome of Tsukubamonas globosa. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa, Martin Kolisko, Yuki Nishimura, Akinori Yabuki, Matthew W. Brown, Sohta A. Ishikawa, Ken-ichiro Ishida, Andrew J. Roger, Tetsuo Hashimoto and Yuji Inagaki
  • 雑誌名: Genome Biol. Evol. 巻: 6(2) ページ: 306-315
  • DOI: doi: 10.1093/gbe/evu015
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Bead-based Normalization for Uniform Sequencing depth (BeNUS) protocol for multi-samples sequencing exemplified by HLA-B. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuyoshi Hosomichi, Shigeki Mitsunaga, Hideki Nagasaki and Ituro Inoue
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 ページ: 645
  • DOI: doi:10.1186/1471-2164-15-645
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Bidirectional promoters are the major source of gene activation-associated non-coding RNAs in mammals. (2014)
  • 著者名/発表者名: Masahiro Uesaka, Osamu Nishimura, Yasuhiro Go, Kinichi Nakashima, Kiyokazu Agata and Takuya Imamura
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 ページ: 35
  • DOI: doi:10.1186/1471-2164-15-35
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The Tif1β-Hp1 system maintains transcriptional integrity of hematopoietic stem cells. (2014)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyagi, Shuhei Koide, Atsunori Saraya, George R. Wendt, Motohiko Oshima, Takaaki Konuma, Satoshi Yamazaki, Makiko Mochizuki-Kashio, Yaeko Nakajima-Takagi, Changshan Wang, Tetsuhiro Chiba, Issay Kitabayashi, Hiromitsu Nakauchi, Atsushi Iwama
  • 雑誌名: Stem Cell Reports 巻: 2 ページ: 145-152
  • DOI: doi.org/10.1016/j.stemcr.2013.12.008.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] An evolutionarily conserved protein CHORD regulates scaling of dendritic arbors with body size. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kohei Shimono, Kazuto Fujishima, Takafumi Nomura, Masayoshi Ohashi, Tadao Usui, Mineko Kengaku, Atsushi Toyoda & Tadashi Uemura
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 4 ページ: 4415
  • DOI: DOI: 10.1038/srep04415
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Defects in the synthetic pathway prevent DIF-1 mediated stalk lineage specification cascade in the non-differentiating social amoeba, Acytostelium subglobosum. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kurato Mohri, Takashi Hata, Haruhisa Kikuchi, Yoshiteru Oshima and Hideko Urushihara
  • 雑誌名: Biol Open 巻: 3 ページ: 553-560
  • DOI: doi:10.1242/bio.20148359
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular evidence that the genes for dioecism and monoecism in Spinacia oleracea L. are located at different loci in a chromosomal region. (2014)
  • 著者名/発表者名: K Yamamoto, Y Oda, A Haseda, S Fujito, T Mikami and Y Onodera
  • 雑誌名: Heredity 巻: 112(3) ページ: 317-324
  • DOI: doi:10.1038/hdy.2013.112
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Methyloceanibacter caenitepidi gen. nov., sp. nov., a novel facultatively methylotrophic bacterium isolated from marine sediments near the hydrothermal vent area. (2014)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi M. et al, Mio Takeuchi, Taiki Katayama, Takao Yamagishi, Satoshi Hanada, Hideyuki Tamaki, Yoichi Kamagata, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Katsumi Marumo, Munetomo Nedachi, Hiroto Maeda Yuichi Suwa and Susumu Sakata
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 巻: 64 ページ: 462-468
  • DOI: doi:10.1099/ijs.0.053397-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methylocaldum marinum sp. nov., a thermotolerant methane-oxidizing bacterium isolated from marine sediments, and emended description of the genus Methylocaldum. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mio Takeuchi, Yoichi Kamagata, Kenshiro Oshima, Satoshi Hanada, Hideyuki Tamaki, Katsumi Marumo, Hiroto Maeda, Munetomo Nedachi, Masahira Hattori, Wataru Iwasaki and Susumu Sakata
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 巻: 64 ページ: 462-468
  • DOI: doi:10.1099/ijs.0.053397-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Direct binding of Ataxin-2 to distinct elements in 3’UTRs promotes mRNA stability and protein expression. (2014)
  • 著者名/発表者名: Moe Yokoshi, Quan Li, Munetaka Yamamoto, Hitomi Okada, Yutaka Suzuki, Yukio Kawahara
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 55 ページ: 186-198
  • DOI: doi.org/10.1016/j.molcel.2014.05.022.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Divergent selection for opsin gene variation in guppy (Poecilia reticulata) populations of Trinidad and Tobago. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tezuka, A., Kasagi, S., van Oosterhout, C., McMullan, M., Iwasaki, W. M., Kasai, D., Yamamichi, M., Innan, H., Kawamura, S. and Kawata, M.
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 55 ページ: 186-198
  • DOI: doi.org/10.1016/j.molcel.2014.05.022.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Evolutionary renovation of L/M opsin polymorphism confers a fruit discrimination advantage to ateline New World monkeys. (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto, Y., Hiramatsu, C., Matsushita, Y., Ozawa, N., Ashino, R., Nakata, M., Kasagi, S., Di Fiore, A. Schaffner, C. M., Aureli, F., Melin, A. D. and Kawamura, S.
  • 雑誌名: Molecular Ecology 巻: 23 (7) ページ: 1799-1812
  • DOI: DOI: 10.1111/mec.12703
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The heterozygote superiority hypothesis for polymorphic color vision is not supported by long-term fitness data from wild Neotropical monkeys. (2014)
  • 著者名/発表者名: Fedigan, L. M., Melin, A. D., Addicott, J. F. and Kawamura, S.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9 (1) ページ: e84872.
  • DOI: DOI: 10.1371/journal.pone.0084872
  • 査読あり
• [雑誌論文] The behavioral ecology of color vision: considering fruit conspicuity, detection distance and dietary importance. (2014)
  • 著者名/発表者名: Melin, A. D., Hiramatsu, C., Parr, N. A., Matsushita, Y., Kawamura, S. and Fedigan, L. M.
  • 雑誌名: International Journal of Primatology 巻: 35 (1): ページ: 258-287
  • DOI: DOI 10.1007/s10764-013-9730-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Color vision variation as evidenced by hybrid L/M opsin genes in wild populations of trichromatic Alouatta New World monkeys. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuka Matsushita, Hiroki Oota, Barbara J. Welker, Mary S. Pavelka and Shoji Kawamura
  • 雑誌名: International Journal of Primatology, 巻: 35（1） ページ: 71-87
  • DOI: DOI 10.1007/s10764-013-9705-9
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genome-Wide SNP Analysis Reveals Population Structure and Demographic History of the Ryukyu Islanders in the Southern Part of the Japanese Archipelago (2014)
  • 著者名/発表者名: Sato T, Nakagome S, Watanabe C, Yamaguchi K, Kawaguchi A, Koganebuchi K, Haneji K, Yamaguchi T, Hanihara T, Yamamoto K, Ishida H, Mano S, Kimura R, Oota H
  • 雑誌名: Mol Biol Evol. 巻: 31(11) ページ: 2929-2940
  • DOI: doi:10.1093/molbev/msu230
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Epigenetics as a basis for diagnosis of neurodevelopmental disorders: challenges and opportunities. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, Miyake K, Hariya M, Mochizuki K.
  • 雑誌名: Expert Rev Mol Diagn 巻: 14(6) ページ: 685-697
  • DOI: doi: 10.1586/14737159.2014.925805
  • 査読あり
• [雑誌論文] Breakpoint analysis of the recurrent constitutional t(8;22)(q24.13;q11.21) translocation. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mishra D, Kato T, Inagaki H, Kosho T, Wakui K, Kido Y, Sakazume S, Taniguchi-Ikeda M, Morisada N, Iijima K, Fukushima Y, Emanuel BS, Kurahashi H.
  • 雑誌名: Mol Cytogenet, 巻: 7 ページ: 55
  • DOI: doi:10.1186/s13039-014-0055-x
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Co-option of a photoperiodic growth-phase transition system during land plant evolution (2014)
  • 著者名/発表者名: Akane Kubota, Shogo Kita, Kimitsune Ishizaki, Ryuichi Nishihama, Katsuyuki T. Yamato & Takayuki Kohchi
  • 雑誌名: Nature Communication 巻: 5 ページ: 3668
  • DOI: DOI: 10.1038/ncomms4668
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phototropin encoded by a single-copy gene mediates chloroplast photorelocation movement in the liverwort Marchantia polymorpha L. (2014)
  • 著者名/発表者名: Aino Komatsu, Mika Terai, Kimitsune Ishizaki, Noriyuki Suetsugu, Hidenori Tsuboi, Ryuichi Nishihama, Katsuyuki T. Yamato, Masamitsu Wada, and Takayuki Kohchi
  • 雑誌名: Plant Physiol. 巻: 166 ページ: 411-427
  • DOI: doi/10.1104/pp.114.245100
  • 査読あり
• [雑誌論文] The polycomb component Ring 1B regulates the timed termination of subcerebral projection neuron production during neocortical development. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nao Morimoto-Suzki, Yusuke Hirabayashi, Kelsey Tyssowski, Jun Shinga, Miguel Vidal, Haruhiko Koseki and Yukiko Gotoh
  • 雑誌名: Development. 巻: 141 ページ: 4343-4353
  • DOI: doi:10.1242/dev.112276
  • 査読あり
• [雑誌論文] Study of MHC class II region polymorphism in the Filipino cynomolgus macaque population. (2014)
  • 著者名/発表者名: Blancher A, Aarnink A, Yamada Y, Tanaka K, Yamanaka H, Shiina T.
  • 雑誌名: Immunogenetics 巻: 66 ページ: 219-230
  • DOI: DOI 10.1007/s00251-014-0764-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Massive Gene Transfer and Extensive RNA Editing of a Symbiotic Dinoflagellate Plastid Genome (2014)
  • 著者名/発表者名: Sutada Mungpakdee, Chuya Shinzato, Takeshi Takeuchi, Takeshi Kawashima, Ryo Koyanagi,
  • 雑誌名: Genome Biol. Evol. 巻: 6(6): ページ: 1408-1422
  • DOI: doi:10.1093/gbe/evu109
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Occupancy of Tissue-Specific cis-Regulatory Modules by Otx2 and TLE/Groucho for Embryonic Head Specification (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuuri Yasuoka, Yutaka Suzuki, Shuji Takahashi, Haruka Someya, Norihiro Sudou, Yoshikazu Haramoto, Ken W. Cho, Makoto Asashima, Sumio Sugano & Masanori Taira
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 5 ページ: 4322
  • DOI: doi: 10.1038/ncomms5322
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Large hypomethylated domains serve as strong repressive machinery for key developmental genes in vertebrates (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakamura R, Tsukahara T, Qu W, Ichikawa K, Otsuka T, Ogoshi K, Saito TL, Matsushima K, Sugano S, Hashimoto S, Suzuki Y, Morishita S and Takeda H,
  • 雑誌名: Development 巻: 141 ページ: 2568-1580
  • DOI: doi:10.1242/dev.108548
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Occurence of the endangered species Nitellopsis obtusa (Charales, Charophyceae) in western Japan and the genetic differences within and among Japanese populations. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kato, S., Kawai, H., Takimoto, M., Suga, H., Yohda, K., Horiya, K., Higuchi, S., & Sakayama, H.
  • 雑誌名: Phycological Research 巻: 62 ページ: 222-227
  • DOI: DOI: 10.1111/pre.12057
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of sexual reproductive processes in Chara braunii (Charales, Charophyceae). (2014)
  • 著者名/発表者名: Sato, M., Sakayama, H., Sato, M., Ito, M. & Sekimoto, H.
  • 雑誌名: Phycological Research 巻: 62 ページ: 214-221
  • DOI: DOI: 10.1111/pre.12056
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Heterotrimeric G proteins control stem cell proliferation through CLAVATA signaling in Arabidopsis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ishida, T., Tabata, R., Yamada, M., Aida, M., Mitsumasu, K., Fujiwara, M., Yamaguchi, K., Shigenobu, S., Higuchi, M., Tsuji, H., Shimamoto, K., Hasebe, M., Fukuda, H., and Sawa, S.
  • 雑誌名: EMBO rep. 巻: 15(11) ページ: 1202-1209
  • DOI: DOI 10.15252/embr.201438660
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Maturation processes and structures of secreted peptides in plants. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tabata, R. and Sawa, S.
  • 雑誌名: Frontiers in Plant Science 巻: 5 ページ: 311
  • DOI: doi: 10.3389/fpls.2014.00311
  • 査読あり
• [雑誌論文] CLE6 expression recovers gibberellin deficiency to promote shoot growth in Arabidopsis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Bidadi, H., Matsuoka, K., Sage-Ono, K., Fukushima, J., Pitaksaringkarn, W., Asahina, M., Yamaguchi, S., Sawa, S., Fukuda, H, Matsubayashi, Y., Ono, M., Satoh, S.
  • 雑誌名: Plant J. 巻: 78 ページ: 241-252.
  • DOI: DOI: 10.1111/tpj.12475
  • 査読あり
• [雑誌論文] CLE-CLAVATA1 peptide-receptor signaling module regulates the expansion of plant root systems in a nitrogen-dependent manner. (2014)
  • 著者名/発表者名: Araya, T., Miyamoto, M., Mibowo, J., Suzuki, A., Kojima, S., Tsuchiya, Y. N., Sawa, S., Fukuda, H., Wiren, N., Takahashi, H.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. 巻: 111 ページ: 2029-2034
  • DOI: doi:10.1073/pnas.1319953111
  • 査読あり
• [雑誌論文] Light-dependent green gall formation induced by Meloidogyne incognita. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nishiyama, H., Nakagami, S., Todaka, A., Arita, T., Ishida, T., and Sawa, S.
  • 雑誌名: Nematology 巻: 16(8) ページ: 889-893
  • DOI: DOI: 10.1163/15685411-00002814
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic Aspects of Sporadic Neurodegenerative Diseases. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Tsuji S.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 巻: 452 ページ: 221-225
  • DOI: doi.org/10.1016/j.bbrc.2014.07.098
  • 査読あり
• [雑誌論文] Design and experimental application of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda and Ken Kurokawa
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 21(2) ページ: 217-227
  • DOI: doi:10.1093/dnares/dst052
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Nuclear dynamics of topoisomerase Ⅱβ reflects its catalytic activity that is regulated by binding of RNA to the C-terminal domain. (2014)
  • 著者名/発表者名: Akihisa Onoda, Osamu Hosoya, Kuniaki Sano, Kazuko Kiyama, Hiroshi Kimura, Shinji Kawano, Ryohei Furuta, Mary Miyaji, Ken Tsutsui, and Kimiko M. Tsutsui
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 42 ページ: 9005-9020
  • DOI: doi:10.1093/nar/gku640
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complete genome sequence of Pseudomonas sp.strain TKP isolated from a γ-hexachlorocyclohexane-degrading mixed culture. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohtsubo Y, Kishida K, Sato T, Tabata M, Kawasumi T, Ogura Y, Hayashi T, Tsuda M, Nagata Y.
  • 雑誌名: Genome Announcements 巻: 2 ページ: e01241-13
  • DOI: doi:10.1128/genomeA.01241-13
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa MTB-1 isolated from a microbial community enriched by the technical formulation of hexachlorocyclohexane (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohtsubo Y, Sato T, Kishida K, Tabata M, Ogura Y, Hayashi T, Tsuda M, Nagata Y.
  • 雑誌名: Genome Announcements 巻: 2 ページ: e01130-13
  • DOI: doi:10.1128/genomeA.01130-13
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Sall1 maintains nephron progenitors and nascent nephrons by acting as both an activator and a repressor. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shoichiro Kanda, Shunsuke Tanigawa, Tomoko Ohmori, Atsuhiro Taguchi, Kuniko Kudo, Yutaka Suzuki, Yuki Sato, Shinjiro Hino, Maike Sander, Alan O. Perantoni, Sumio Sugano, Mitsuyoshi Nakao, and Ryuichi Nishinakamura
  • 雑誌名: J Am Soc Nephrol 巻: 25 ページ: 2584-2595
  • DOI: doi:10.1681/ASN.2013080896
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Sex-specific posttranslational regulation of the gamete fusogen GCS1 in the isogamous volvocine alga Gonium pectorale. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroko Kawai-Toyooka, Toshiyuki Mori, Takashi Hamaji, Masahiro Suzuki, Bradley J. S. C. Olson, Tomohiro Uemura, Takashi Ueda, Akihiko Nakano, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, and Hisayoshi Nozaki
  • 雑誌名: Eukaryotic Cell 巻: 13 ページ: 648-656
  • DOI: doi:10.1128/EC.00330-13
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Induction of Virulence Gene Expression in Staphylococcus aureus by Pulmonary Surfactant (2014)
  • 著者名/発表者名: Kenichi Ishii, Tatsuo Adachi, Jyunichiro Yasukawa, Yutaka Suzuki, Hiroshi Hamamoto, and Kazuhisa Sekimizu
  • 雑誌名: Infect. Immun. 巻: 82(4) ページ: 1500-1510
  • DOI: doi:10.1128/IAI.01635-13
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CLOCK-controlled polyphonic regulations of circadian rhythms through canonical and non-canonical E-boxes. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hikari Yoshitane, Haruka Ozaki, Hideki Terajima, Ngoc-Hien Du, Yutaka Suzuki, Taihei Fujimori, Naoki Kosaka, Shigeki Shimba, Sumio Sugano, Toshihisa Takagi, Wataru Iwasaki, and Yoshitaka Fukada
  • 雑誌名: Molecular and Cellular Biology 巻: 34(10) ページ: 1776-1787
  • DOI: doi:10.1128/MCB.01465-13
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Methylome diversification through changes in DNA methyltransferase sequence specificity. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshikazu Furuta, Hiroe Namba-Fukuyo, Tomoko F. Shibata, Tomoaki Nishiyama, Shuji Shigenobu, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Mitsuyasu Hasebe, and Ichizo Kobayashi
  • 雑誌名: PloS Genetics 巻: 10(4) ページ: e1004272
  • DOI: DOI: 10.1371/journal.pgen.1004272
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Bead-based Normalization for Uniform Sequnecing depth (BeNUS) protocol for multi-samples seqencing exemplified by HLA-B. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuyoshi Hosomichi, Shigeki Mitsunaga, Hideki Nagasaki and Ituro Inoue
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 ページ: 645
  • DOI: doi:10.1186/1471-2164-15-645
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Novel calmodulin (CALM2) mutations associated with congenital arrhythmia susceptibility. (2014)
  • 著者名/発表者名: Naomasa Makita, Nobue Yagihara, Lia Crotti, Christopher N. Johnson, Britt-Maria Beckmann, Michelle S. Roh, Daichi Shigemizu, Peter Lichtner, Taisuke Ishikawa, Takeshi Aiba, Tessa Homfray, Elijah R. Behr, Didier Klug, Isabelle Denjoy, Elisa Mastantuono, Daniel and Alfred L. George, Jr
  • 雑誌名: Circ Cardiovasc Genet 巻: 7 ページ: 466-474
  • DOI: doi:10.1161/CIRCGENETICS.113.000459
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phytochrome controls alternative splicing to mediate light responses in Arabidopsis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiromasa Shikata, Kousuke Hanada, Tomokazu Ushijima, Moeko Nakashima, Yutaka Suzuki, and Tomonao Matsushita
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 111(52) ページ: 18781-18786
  • DOI: doi:10.1073/pnas.1407147112
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] ABCG2 dysfunction causes hyperuricemia due to both renal urate underexcretion and renal urate overload. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirotaka Matsuo, Akiyoshi Nakayama, Masayuki Sakiyama, Toshinori Chiba, Seiko Shimizu, Yusuke Kawamura, Hiroshi Nakashima, Takahiro Nakamura, Yuzo Takada, Yuji Oikawa, Tappei Takada, Hirofumi Nakaoka, Junko Abe, Hiroki Inoue, Kenji Wakai, Sayo Kawai, & Nariyoshi Shinomiya
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 4 ページ: 3755
  • DOI: doi:10.1038/srep03755
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Common dysfunctional variants of ABCG2 have strong impact on hyperuricemia progression than typical environmental risk factors. (2014)
  • 著者名/発表者名: Akiyoshi Nakayama, Hirotaka Matsuo, Hirofumi Nakaoka, Takahiro Nakamura, Hiroshi Nakashima, Yuzo Takada, Yuji Oikawa, Tappei Takada, Masayuki Sakiyama, Seiko Shimizu, Yusuke Kawamura, & Nariyoshi Shinomiya
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 4 ページ: 5227
  • DOI: doi:10.1038/srep05227
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ethnic differences in ATP-binding cassette tansporter, sub-family G, member 2: Genotype combinations and estimated functions. (2014)
  • 著者名/発表者名: Masayuki SAKIYAMA, Hirotaka MATSUO, Yuzo TAKADA, Takahiro NAKAMURA, Akiyoshi NAKAYAMA, Tappei TAKADA, Shin-ichiro KITAJIRI, Kenji WAKAI, Hiroshi SUZUKI, Nariyoshi SHINOMIYA
  • 雑誌名: DMPK 巻: 29(6) ページ: 490-492
  • DOI: doi.org/10.2133/dmpk.DMPK-14-SC-041
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Efficient de novo assembly of highly heterozygous genomes from whole-genome shotgun short reads (2014)
  • 著者名/発表者名: Rei Kajitani, Kouta Toshimoto, Hideki Noguchi, Atsushi Toyoda, Yoshitoshi Ogura, Miki Okuno, Mitsuru Yabana, Masayuki Harada, Eiji Nagayasu, Haruhiko Maruyama, Yuji Kohara, Asao Fujiyama, Tetsuya Hayashi, and Takehiko Itoh
  • 雑誌名: Genome Research 巻: 24 ページ: 1384-1395
  • DOI: doi:10.1101/gr.170720.113
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Assessment of helminth biodiversity in wild rats using 18S rDNA based metagenomics. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ryusei Tanaka, Akina Hino, Isheng J. Tsai, Juan Emilio Palomares-Rius, Ayako Yoshida, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Haruhiko Maruyama, Taisei Kikuchi
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 9 ページ: e110769
  • DOI: DOI: 10.1371/journal.pone.0110769
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Karyotype and reproduction mode of the rodent parasite Strongyloides venezuelensis. (2014)
  • 著者名/発表者名: AKINA HINO, TERUHISA TANAKA, MAHO TAKAISHI, YUMIKO FUJII, JUAN E. PALOMARES-RIUS, KOICHI HASEGAWA, HARUHIKO MARUYAMA and TAISEI KIKUCHI
  • 雑誌名: Parasitology 巻: 141 ページ: 1736-1745
  • DOI: doi:10.1017/S0031182014001036
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study of degenerative bony changes of temporomandibular joint in East Asian populations. (2014)
  • 著者名/発表者名: T Yamaguchi, H Nakaoka, K Yamamoto, T Fujikawa, Y-I Kim, K Yano, S Haga, K Katayama, T Shibusawa, SB Park, K Maki, R Kimura and I Inoue
  • 雑誌名: Oral Dis. 巻: 20(4) ページ: 409-415
  • DOI: DOI: 10.1111/odi.12141
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional characterization of flavobacteria thodopsins reveals a unique class of light-driven chloride pump in bacteria. (2014)
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Yohei Kumagai, Hana Kim, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Wataru Iwasaki, Edward F. DeLong and Kazuhiro Kogure
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 巻: 111(18) ページ: 6732-6737
  • DOI: doi:10.1073/pnas.1403051111
  • 査読あり
• [雑誌論文] 遺伝子から見た根寄生植物の生存戦略 (2014)
  • 著者名/発表者名: 吉田聡子、若竹崇雅、白須賢
  • 雑誌名: 植物の生長調節 巻: 49(1) ページ: 66
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of CNV (copy number variation) and their associations with narcolepsy in a Japanese population. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamasaki M, Miyagawa T, Toyoda H, Khor SS, Koike A, Nitta A, Akiyama K, Sasaki T, Honda M, Tokunaga K.
  • 雑誌名: J. Hum. Genet. 巻: 59 ページ: 235-240
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.13.
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genome-wide association study for diabetic retinopathy in a Japanese population: potential association with a long intergenic non-coding RNA. (2014)
  • 著者名/発表者名: Awata T, Yamashita H, Kurihara S, Morita-Ohkubo T, Miyashita Y, Katayama S, Mori K, Yoneya S, Kohda M, Okazaki Y, Maruyama T, Shimada A, Yasuda K, Nishida N, Tokunaga K, and Koike A.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9 ページ: e111715
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0111715.
  • 査読あり
• [雑誌論文] CLAST: CUDA implemented large-scale alignment search tool. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yano M, Mori H, Akiyama Y, Yamada T, Kurokawa K
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 15(1) ページ: 406
  • DOI: doi:10.1186/s12859-014-0406-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in ERBB4 That Disrupt The NRG-ErbB4 Pathway Cause Autosomal Dominant Familial ALS Type 19 (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuji Takahashi, Yoko Fukuda, Jun Yoshimura, Atsushi Toyoda, Kari Kurppa, Hiroyoko Moritoyo, Veronique Belzil, Klaus Elenius, Guy Rouleau, Asao Fujiyama, Shinichi Morishita, Jun Goto, Shoji Tsuji
  • 雑誌名: Neurology 巻: 82 ページ: 83
  • 査読あり
• [雑誌論文] A simple but powerful heuristic method for accelerating k-means clustering of large-scale data in life science (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Ichikawa, Shinichi Morishita
  • 雑誌名: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB) 巻: 11 ページ: 681-692
  • DOI: 10.1109/TCBB.2014.2306200
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole genome complete resequencing of Bacillus subtilis natto by combining long reads with high-quality short reads. (2014)
  • 著者名/発表者名: –Kamada, M., Hase, S., Sato, K., Toyoda, A., Fujiyama, A., and Sakakibara, Y
  • 雑誌名: PLOS ONE, 巻: 9(10): ページ: e109999,
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0109999.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient calculation of exact probability distributions of integer features on RNA secondary structures (2014)
  • 著者名/発表者名: ：Ryota Mori, Michiaki Hamada, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: BMC genomics 巻: ：15 suppl. 10 ページ: S6
  • DOI: doi:10.1186/1471-2164-15-S10-S6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reference-free prediction of rearrangement breakpoint reads (2014)
  • 著者名/発表者名: Edward Wijaya, Kana Shimizu, Kiyoshi Asai and Michiaki Hamada
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 30 (18) ページ: 2559-2567
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btu360
  • 査読あり
• [雑誌論文] Performance comparison of second- and third-generation sequencers using a bacterial genome with two chromosomes (2014)
  • 著者名/発表者名: Mari Miyamoto, Daisuke Motooka, Kazuyoshi Gotoh, Takamasa Imai, Kazutoshi Yoshitake, Naohisa Goto, Tetsuya Iida, Teruo Yasunaga, Toshihiro Horii, Kazuharu Arakawa, Masahiro Kasahara and Shota Nakamura
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 ページ: -
  • DOI: doi:10.1186/1471-2164-15-699
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] ELSI practices in genomic research in East Asia: implications for research collaboration and public participation (2014)
  • 著者名/発表者名: Go Yoshizawa, Calvin Wai-Loon Ho, Wei Zhu, Chingli Hu, Yoni Syukriani, Ilhak Lee, Hannah Kim, Daniel Fu Chang Tsai, Jusaku Minari, and Kazuto Kato.
  • 雑誌名: Genome Medicine. 巻: 6(5) ページ: 39
  • DOI: doi: 10.1186/gm556
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ethical considerations of research policy for personal genome analysis: the approach of the Genome Science Project in Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari, Tetsuya Shirai and Kazuto Kato.
  • 雑誌名: Life Sciences, Society and Policy 巻: 10 ページ: 4
  • DOI: doi:10.1186/s40504-014-0004-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Return of genetic research results: the Japanese experience and its implications for the international debate. (2014)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari, Donald Chalmers and Kazuto Kato.
  • 雑誌名: SCRIPTed 巻: 11 ページ: 180-192
  • DOI: doi:10.2966/scrip.110214.180
  • 査読あり
• [雑誌論文] The emerging need for family-centric initiatives for obtaining consent in personal genome research. (2014)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari, Harriet Teare, Colin Mitchell, Jane Kaye and Kazuto Kato.
  • 雑誌名: Genome Medicine 巻: 6: ページ: 118
  • DOI: doi:10.1186/s13073-014-0118-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] パーソナルゲノム時代の研究ガバナンス (2014)
  • 著者名/発表者名: 三成寿作, 加藤和人
  • 雑誌名: 医薬ジャーナル 巻: 50 ページ: 55-58
• [雑誌論文] 医療情報の利用に関する政策の20年 (2014)
  • 著者名/発表者名: 吉澤剛
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 251(3) ページ: 213-218
• [雑誌論文] ヒトゲノム情報は２１世紀の新しい石油となるか？―パーソナルゲノム時代の倫理的・法的・社会的課題 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山本奈津子
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 251(3) ページ: 207-212
• [雑誌論文] Aberrant transcriptional regulations in cancers: genome, transcriptome and epigenome analysis of lung adenocarcinoma cell lines. (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki A, Makinoshima H, Wakaguri H, Esumi H, Sugano S, Kohno T, Tsuchihara K, Suzuki Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 42 ページ: 13557-13572
  • DOI: 10.1093/nar/gku885
  • 査読あり
• [学会発表] HLA解析ツール (2015)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹
  • 学会等名: Galaxy Workshop Tokyo 2015
  • 発表場所: 東京大学 先端科学技術研究センター
  • 年月日: 2015-04-28 – 2015-04-28
  • 招待講演
• [学会発表] アオサ藻綱ヒラアオノリのゲノム解読と雌雄ゲノムの比較による性決定領域の探索 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山﨑誠和, 鈴木亮吾, 市原健介, 豊田敦, 桑野和可, 鈴木穣, 河野重行
  • 学会等名: 日本藻類学会第39回大会
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 2015-03-20 – 2015-03-25
• [学会発表] 全ゲノム変異解析のためのパイプラインの構築 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石井 公太郎，平野 智也，風間 裕介，浜田 道昭，小野 幸輝，阿部 知子
  • 学会等名: 日本育種学会 第127回講演会
  • 発表場所: 玉川大学
  • 年月日: 2015-03-20 – 2015-03-20
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for Liverwort Marchantia polymorpha (2015)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹、石崎公庸、大和勝幸、河内孝之、中村保一
  • 学会等名: 第56回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 2015-03-16 – 2015-03-18
• [学会発表] 納豆菌ゲノムのPacBioシークエンシングと高精度配列の再決定． (2015)
  • 著者名/発表者名: 鎌田真由美，長谷純崇，木村啓太郎，佐藤健吾，豊田敦，藤山秋佐夫，榊原康文
  • 学会等名: 第８回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 2015-03-07 – 2015-03-07
• [学会発表] 「Gef-seqに対応したマッピングプログラムおよびGUIの開発」 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本秀太・中村建介
  • 学会等名: 第９回 日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 神戸大学
  • 年月日: 2015-03-06 – 2015-03-06
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for Liverwort Marchantia polymorpha (2015)
  • 著者名/発表者名: Yasukazu Nakamura, Hideki Nagasaki, Naoko Iida
  • 学会等名: Expanding Frontiers of Genome Science II
  • 発表場所: 一橋講堂
  • 年月日: 2015-01-20 – 2015-01-21
• [学会発表] Pipeline for whole-genome analysis of heavy-ion-induced mutants (2015)
  • 著者名/発表者名: Kotaro Ishii, Tomonari Hirano, Yusuke Kazama, Michiaki Hamada, Yukiteru Ono, Tomoko Abe
  • 学会等名: International Symposium on Genome Science
  • 発表場所: 東京 一橋講堂
  • 年月日: 2015-01-20 – 2015-01-21
• [学会発表] Next generation sequencing data and its bioinformatics analysis dissect genomic regulatory elements (2015)
  • 著者名/発表者名: Tetsushi Yada, Takuma Irie, Takeaki Taniguchi, Yutaka Suzuki
  • 学会等名: International Symposium on Genome Science
  • 発表場所: 東京 一橋講堂
  • 年月日: 2015-01-20 – 2015-01-21
• [学会発表] 定量生物学と情報生物学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 定量生物学の会第七回年会
  • 発表場所: 九州大学筑紫キャンパス（春日）
  • 年月日: 2015-01-11 – 2015-01-11
  • 招待講演
• [学会発表] The Chara braunii Genome (2015)
  • 著者名/発表者名: Tomoaki Nishiyama, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Asao Fujiyama, Stefan A. Rensing, Hidetoshi Sakayama
  • 学会等名: Plant and Animal Genome XXIII Conference, 2015
  • 発表場所: San Diego, CA
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-14
• [学会発表] The Chara braunii Genome Sheds Light on the Origin of Land Plants (2015)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Sakayama, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Asao Fujiyama, Stefan A. Rensing, Tomoaki Nishiyama
  • 学会等名: Plant and Animal Genome XXIII Conference, 2015
  • 発表場所: San Diego, CA
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-14
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for Liverwort Marchantia polymorpha (2015)
  • 著者名/発表者名: Hideki Nagasaki Kimitsune Ishizaki Katsuyuki T. Yamato Takayuki Kohchi Yasukazu Nakamura
  • 学会等名: International Plant & Animal Genome XXIII
  • 発表場所: San Diego, CA, USA
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-14
• [学会発表] DDBJ Read Annotation Pipeline の紹介と実習 (2014)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹
  • 学会等名: 第30回 DDBJing 講習会 in 東京
  • 発表場所: 独立行政法人 科学技術振興機構 東京本部
  • 年月日: 2014-12-18 – 2014-12-18
  • 招待講演
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for the Liverwort Marchantia polymorpha (2014)
  • 著者名/発表者名: Hideki Nagasaki, Naoko Iida, Yasukazu Nakamura
  • 学会等名: Marchantia Workshop 2014
  • 発表場所: 神戸大学
  • 年月日: 2014-12-08 – 2014-12-10
  • 招待講演
• [学会発表] Asian Microbiome Project: 次世代シーケンサーを用いたアジア人腸内細菌叢のプロファイル化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 東佳那子、百田理恵、山本麻寿紗、林 哲也、小椋義俊、黒川 顕、豊田敦、加藤和人、AMP study group、園元謙二、渡辺幸一、Lee Yuan Kun、中山二郎
  • 学会等名: 日本生物工学会 第21回九州支部熊本大会
  • 発表場所: 熊本大学
  • 年月日: 2014-12-06 – 2014-12-06
• [学会発表] マウス長期継代系統を用いた生殖系列突然変異率の閾値とその影響 (2014)
  • 著者名/発表者名: 内村有邦, 樋口真弓, 水口洋平, 西野穣, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 八木健
  • 学会等名: 日本環境変異原学会第43回大会
  • 発表場所: 一橋大学一橋講堂
  • 年月日: 2014-12-04 – 2014-12-05
• [学会発表] 放射線耐性を示すクマムシの新規タンパク質S261によるDNA損傷の抑制 (2014)
  • 著者名/発表者名: 橋本 拓磨, 斎藤 裕樹, 尾山 大明, 秦 裕子, 榎本 敦, 宮川 清, 桑原 宏和, 堀川 大樹, 豊田 敦, 片山 俊明, 荒川 和晴, 藤山 秋佐夫, 久保 健雄, 國枝 武和
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 有殻アメーバ Paulinella chromatophora のゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松尾 充啓, 潟端 篤, 水口 洋平, 野口 英樹, 豊田 敦, 藤山 秋佐夫, 鈴木 穣, 佐藤 壮一郎, 松崎 素道, 中山 卓郎, 神川 龍馬, 野村 真未, 壁谷 如洋, 宮城島 進也, 稲垣 祐司, 石田 健一郎, 小保方 潤一
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for Liverwort ゼニゴケゲノムアノテーションデータベースの構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹、石崎公庸、大和勝幸、河内孝之、中村保一
  • 学会等名: 第37回 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 次世代シークエンサーによる変異プロモーターの網羅的解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 入江拓磨, 門城拓, 劉エイ, 関真秀, 菅野純夫, 矢田哲士, 鈴木穰
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜, 日本
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] ゲノムおよび健康関連データの責任ある共有のためのフレームワークの作成 (2014)
  • 著者名/発表者名: 加藤和人
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第59回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-11-21 – 2014-11-21
• [学会発表] 個人ゲノム情報の取り扱いに関する倫理的、法的課題 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山本奈津子、川嶋実苗、藤田卓仙、鈴木正朝
  • 学会等名: 第59回日本人類遺伝学会 第21回日本遺伝子診療学会 合同大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-11-19 – 2014-11-22
• [学会発表] Roles of bacteriophages in the emergence and evolution of enterohemorrhagic Escherichia coli. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T.
  • 学会等名: 第62回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 横浜市
  • 年月日: 2014-11-10 – 2014-11-10
  • 招待講演
• [学会発表] ビッグデータ時代における医療等情報の取り扱い方針に関する検討 (2014)
  • 著者名/発表者名: 藤田卓仙、山本奈津子、川嶋実苗、鈴木正朝
  • 学会等名: 第34回医療情報学連合大会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2014-11-06 – 2014-11-08
• [学会発表] クリニカルシーケンス応用を目指したHLA領域のゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 細道一善
  • 学会等名: Roche Scientific Symposium 2014 先端医療研究におけるターゲットゲノム解析
  • 発表場所: JPタワー ホール＆カンファレンス(東京)
  • 年月日: 2014-11-05 – 2014-11-05
  • 招待講演
• [学会発表] 生殖補助医療規制の構築における「子どもを持ちたいという欲望」 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小門穂
  • 学会等名: 日本生命倫理学会
  • 発表場所: 浜松
  • 年月日: 2014-10-26 – 2014-10-26
• [学会発表] PCR-based method for complete HLA gene sequencing and capture-based method for entire HLA region sequencing (2014)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Inoue I.
  • 学会等名: 64th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics (ASHG 2014)
  • 発表場所: an Diego Convention Center (San Diego, California)
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] Analysis of ethical and social issues of large scale genome cohort/biobanking projects in Japan. (2014)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari, Yoshikazu Hanabusa, Soichiro Toda, Fuji Nagami and Kazuto Kato.
  • 学会等名: The 64th American Society of Human Genetics (ASHG) Annual Meeting.
  • 発表場所: サンディエゴ（アメリカ）
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] 病原細菌のゲノム解析. (2014)
  • 著者名/発表者名: 林哲也
  • 学会等名: Infection and Immunity Research Symposium V
  • 発表場所: 福岡市
  • 年月日: 2014-10-17 – 2014-10-17
  • 招待講演
• [学会発表] CLOCKによる古典的・非古典的E-boxを介した概日時計の"多声的"制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: Hikari Yoshitane, Haruka Ozaki, Hideki Terajima, Ngoc-Hien Du, Yutaka Suzuki, Taihei Fujimori, Naoki Kosaka, Shigeki Shimba, Sumio Sugano, Toshihisa Takagi, Wataru Iwasaki, and Yoshitaka Fukada.
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会2014年年会・第3回生命医薬情報学連合大会
  • 発表場所: 仙台国際センター（仙台）
  • 年月日: 2014-10-03 – 2014-10-03
• [学会発表] 微生物ゲノム研究、この13年間を振り返る（未来開拓、ゲノム特定、ゲノム支援を経験して） (2014)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊
  • 学会等名: 第8回日本ゲノム微生物学会若手の会研究会
  • 発表場所: 静岡市
  • 年月日: 2014-09-28 – 2014-09-28
  • 招待講演
• [学会発表] Fundamental bottlenecks in big-data biology (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（札幌）
  • 年月日: 2014-09-27 – 2014-09-27
  • 招待講演
• [学会発表] Local Package Manager―Database of genome analysis tools with installation procedures (2014)
  • 著者名/発表者名: Masahiro Kasahara
  • 学会等名: Genome Informatics
  • 発表場所: Churchill College, Cambridge, UK
  • 年月日: 2014-09-21 – 2014-09-21
• [学会発表] 長期継代マウス系統を用いた突然変異率の推定と新しい遺伝学 (2014)
  • 著者名/発表者名: 内村有邦, 樋口真弓, 水口洋平, 西野穣, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 三浦郁生, 若菜茂晴, 八木健
  • 学会等名: 日本遺伝学会第86回大会
  • 発表場所: 長浜バイオ大学
  • 年月日: 2014-09-17 – 2014-09-19
• [学会発表] ゲノム大規模データを解析する－転写制御領域の解読と設計－ (2014)
  • 著者名/発表者名: 矢田哲士
  • 学会等名: 新生命科学分野開拓とスーパーコンピューター「京」
  • 発表場所: 福岡, 日本
  • 年月日: 2014-09-16 – 2014-09-16
  • 招待講演
• [学会発表] シャジクモゲノムにみる陸上植物の制御因子ホモログ (2014)
  • 著者名/発表者名: 西山智明, 豊田敦, 鈴木穣, 藤山秋佐夫, 坂山英俊
  • 学会等名: 日本植物学会第78回大会
  • 発表場所: 明治大学
  • 年月日: 2014-09-12 – 2014-09-14
• [学会発表] DDBJ Read Annotation Pipeline の紹介と実習(RNA-Seq配列のde novoアセンブリを中心に) (2014)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹
  • 学会等名: AJACS十勝
  • 発表場所: 帯広畜産大学
  • 年月日: 2014-09-12 – 2014-09-12
  • 招待講演
• [学会発表] People's opinion toward informed consent/assent of children participating birth cohort study in Japan. (2014)
  • 著者名/発表者名: Izumi Ishiyama, Zentaro Yamagata, Jusaku Minari, Go Yoshizawa, Kaori Muto and Kazuto Kato
  • 学会等名: British Sociological Association Medical Sociology Group 46th Annual Conference 2014
  • 発表場所: バーミンガム (イギリス)
  • 年月日: 2014-09-10 – 2014-09-12
• [学会発表] バイオインフォマティクスから時空間解析へ (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 日本学術会議学術フォーラム「生命情報ビッグデータ時代における新しい生命科学」
  • 発表場所: 日本学術会議講堂（東京）
  • 年月日: 2014-08-29 – 2014-08-29
  • 招待講演
• [学会発表] Ethical, legal and social issues of genetic and genomic medicine: a focus on East Asian situations (2014)
  • 著者名/発表者名: Go Yoshizawa
  • 学会等名: Seminar on Biobanking and Ethical, Legal & Social Issues in Genetic and Genomic Medicine,
  • 発表場所: University Sains Malaysia
  • 年月日: 2014-08-27 – 2014-08-27
  • 招待講演
• [学会発表] Initiating a biobank infrastructures and regulations: Japan experiences (2014)
  • 著者名/発表者名: Go Yoshizawa
  • 学会等名: Seminar on Biobanking and Ethical, Legal & Social Issues in Genetic and Genomic Medicine
  • 発表場所: University Sains Malaysia
  • 年月日: 2014-08-26 – 2014-08-26
  • 招待講演
• [学会発表] （円卓会議で議論に参加） (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: Workshop on Data Sharing Between International Consortia
  • 発表場所: ジュネーブ（スイス）
  • 年月日: 2014-06-03 – 2014-06-05
  • 招待講演
• [学会発表] The research policy regarding disclosure of genetic research results: a historical perspective in Japan. (2014)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari and Kazuto Kato.
  • 学会等名: Europian Society of Human Genetics (ESHG) 2014 Annual Meeting
  • 発表場所: ミラノ（イタリア）
  • 年月日: 2014-05-31 – 2014-06-04
• [学会発表] Recent situation about rules of sharing, reuse and circulation of personal genome data in Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Natsuko Yamamoto
  • 学会等名: Europian Society of Human Genetics (ESHG) 2014 Annual Meeting
  • 発表場所: ミラノ（イタリア）
  • 年月日: 2014-05-31 – 2014-06-04
• [学会発表] Incorporation of Long-Read Technologies into Hybrid-de novo Genome Sequencing Strategy: An Assessment on PacBio and Moleculo Read (2014)
  • 著者名/発表者名: Asao Fujiyama, Masahiro Kasahara, Atsushi Toyoda
  • 学会等名: PLANT & ANIMAL GENOME ASIA 2014
  • 発表場所: SINGAPORE
  • 年月日: 2014-05-19 – 2014-05-21
• [学会発表] Comments for Panel#3: Big Data, Small Data, Shared Data (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: Ethics at the Crossroads: Where Public Health, Genomics, Data and Translational Science Meet
  • 発表場所: インディアナポリス（アメリカ）
  • 年月日: 2014-05-07 – 2014-05-07
  • 招待講演
• [学会発表] （円卓会議で議論に参加） (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: The Indianapolis ELSI 2.0 Meeting
  • 発表場所: インディアナポリス（アメリカ）
  • 年月日: 2014-05-06 – 2014-05-06
  • 招待講演
• [学会発表] （円卓会議で議論に参加） (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: International Code of Conduct for Genomic and Clinical Date Sharing
  • 発表場所: リ(フランス)
  • 年月日: 2014-04-02 – 2014-04-02
  • 招待講演
• [備考] シーラカンス
  • URL: http://coelacanth.nig.ac.jp
• [備考] アゲハ
  • URL: http://papilio.nig.ac.jp/
• [備考] アフリカツメガエル
  • URL: http://xenopus.lab.nig.ac.jp
• [備考] DDBJパイプライン
  • URL: http://p.ddbj.nig.ac.jp
• [備考] メタゲノムをアセンブリする改良型ソフトウエア MetaVelvet-SL
  • URL: http://metavelvet.dna.bio.keio.ac.jp/