ゲノムデータに対して有効性が高い多重検定法の開発

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22500269
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 統計科学
• 研究機関: 統計数理研究所
• 研究代表者: 藤澤 洋徳 統計数理研究所, 数理・推論研究系, 准教授 (00301177)
• 連携研究者: 二宮 嘉行 九州大学, 数理学研究院, 准教授 (50343330) ; 坂口 隆之 大分県立看護科学大学, 看護学部, 助教 (10436496) ; 高田 豊行 国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 助教 (20356257)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: 遺伝子発現差解析 / 有意性検定 / P値

研究概要

P値を推定する際に,標本数の少なさをカバーするために,他の遺伝子のデータを加えることがしばしば行われている.しかしながら,その妥当性は,必ずしも検証されていなかった.本申請研究では,その妥当性が保証されるP値推定の条件を数理的に整理できた.その条件のもとでの最適な検定も導出できた.数値実験でも実データ解析でも,劇的に優れていることが検証できた.平均の同等性だけでなく分散の同等性についても検討した.

研究成果

• [雑誌論文] Optimal significance analysis of microarray data in a class of tests whose null statistic can be constructed (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujisawa, H. and Sakaguchi, T.
  • 雑誌名: TEST 巻: Vol.21 ページ: 280-300
  • DOI: DOI 10.1007/s11749-011-0243-5
  • 査読あり
• [学会発表] ゲノムデータのための統計的手法の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 藤澤洋徳
  • 学会等名: 新領域融合プロジェクト外部レビュー
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-10-31
• [学会発表] ゲノムデータ解析のプロジェクトに携わって (2012)
  • 著者名/発表者名: 藤澤洋徳
  • 学会等名: 統計サマーセミナー
  • 発表場所: 熱海
  • 年月日: 2012-08-05
• [学会発表] 遺伝子発現差解析におけるP値推定と最適な有意性検定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 藤澤洋徳
  • 学会等名: 統計科学セミナー
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-01-13
• [学会発表] Optimal significance analysis of microarray data in a class of tests whose null statistic can be constructed (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujisawa, H.
  • 学会等名: International Conference on Advances in Probability and Statistics
  • 発表場所: Hong Kong, China
  • 年月日: 2011-12-30
• [学会発表] Optimal significance analysis of microarray data in a class of tests whose null statistic can be constructed (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujisawa, H.
  • 学会等名: 7th IASC-ARS Joint 2011 Taipei Symposium
  • 発表場所: Taipei, Taiwan,
  • 年月日: 2011-12-17
• [学会発表] 遺伝子発現差解析における並べ替え技法によるP値推定,融合 (2011)
  • 著者名/発表者名: 藤澤 洋徳
  • 学会等名: 「遺伝機能」プロジェクト会議
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 2011-10-20
• [学会発表] マイクロアレイデータを利用した遺伝子発現差解析において帰無統計量が構成できる検定の中で最適な有意性検定 (2011)
  • 著者名/発表者名: 藤澤洋徳
  • 学会等名: 名古屋統計セミナー
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2011-05-20
• [学会発表] 遺伝子発現差解析における並べ替え技法によるP 値推定と最適な有意性検定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 藤澤洋徳,坂口隆之
  • 学会等名: 科研費研究集会「生物情報解析の理論的基礎とその応用」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 遺伝子発現差解析における並べ替え技法によるP値の推定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 藤澤洋徳,坂口隆之
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-09-07