自律的な光駆動型DNA分子計算系の開発と応用

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22655051
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 北陸先端科学技術大学院大学
• 研究代表者: 藤本 健造 北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 教授 (90293894)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: DNA / 光ライゲーション / 光クロスリンク

研究概要

光駆動型DNA分子計算システムを用いて、標的遺伝子としてコドン12の点変異(GGT→GTT)によりガン原性を獲得するKras遺伝子の転写反応をリアルタイムPCRにより評価し、変異型遺伝子のみを選択的に増幅できることが示された。自律的な光駆動型DNA分子計算による高選択的かつ高感度な遺伝子増幅・検出が可能であることが示された。

研究成果

• [雑誌論文] Stabilization of DNA nanostructures by photo-cross-linking (2011)
  • 著者名/発表者名: Miho Tagawa, Koh-ichiroh Shohda, Kenzo Fujimoto and Akira Suyama
  • 雑誌名: Soft Matter 巻: 7 ページ: 10931-10934
  • 査読あり
• [雑誌論文] Construction of branched DNA for SNP determination on glass-chip using photochemical ligation (2011)
  • 著者名/発表者名: Minhaz Uddin Ahmed, Yoshinaga Yoshimura, M. Mosharraf Hossain, Eiichi Tamiya and Kenzo Fujimoto
  • 雑誌名: Bio Chip J. 巻: 5 ページ: 206-221
  • 査読あり
• [雑誌論文] Signal turn-on probe for nucleic acid detection based on 19F nuclear magnetic resonance (2011)
  • 著者名/発表者名: Takashi Sakamoto, Yu-ki Shimizu, Jun Sasaki, Hikaru Hayakawa and Kenzo Fujimoto
  • 雑誌名: Bioorg Med. Chem. Lett 巻: 21 ページ: 303-206
  • 査読あり
• [雑誌論文] Site-Specific Photochemical RNA Editing (2010)
  • 著者名/発表者名: Kenzo Fujimoto, Kaoru Konishi-Hiratsuka, Takashi Sakamoto and Yoshinaga Yoshimura
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 46 ページ: 7545-7548
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Site-Specific Cytosineto the Uracil Transition Using Reversible DNA Photocrosslinking (2010)
  • 著者名/発表者名: Kenzo Fujimoto, Takashi Sakamoto, Kaoru Konishi-Hiratsuka and Yoshinaga Yoshimura
  • 雑誌名: Chem Bio Chem 巻: 11 ページ: 1661-1664
  • 査読あり
• [学会発表] D Development of Photochemical DNA and RNA Manipulation (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto Kenzo
  • 学会等名: 34th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
  • 発表場所: Pacifico YOKOHAMA(神奈川県)
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 酵素を使わずに化学の力でDNAを操る (2011)
  • 著者名/発表者名: 藤本健造
  • 学会等名: 日本化学会東北支部主催会員増強のための講演会
  • 発表場所: 東北大学(宮城県)
  • 年月日: 2011-11-25
• [学会発表] Development of Photo triggered DNA and RNA Manipulation (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto Kenzo
  • 学会等名: 5th Pacific Symposium on Radical Chemistry
  • 発表場所: Shirahama,(和歌山県)
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] Photochemical DNA manipulation toward for DNA computing (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakamura Shigetaka, Ogasakawa Shinzi and Fujimoto Kenzo
  • 学会等名: 17th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming
  • 発表場所: LA, USA
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] 光化学的な新規遺伝子操作法の開発とその応用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 藤本健造
  • 学会等名: 日本化学会中国四国支部愛媛地区化学講演会
  • 発表場所: 愛媛大学(愛媛県)
  • 年月日: 2011-09-14