ハテナ・アレニコラの次世代シーケンスを用いた核ゲノム解析

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22657024
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 井上 勲 筑波大学, 生命環境系, 教授 (70168433)
• 研究分担者: 中山 剛 筑波大学, 生命環境系, 講師 (40302369)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: ゲノム / 細胞内共生 / 進化

研究概要

カタブレファリス類に属するハテナ・アレニコラは細胞内に一時的に共生藻を保持し、二次共生の中間段階にあると考えられている。しかし、本生物は培養ができないため、核ゲノム解析に十分なDNA量を確保することが困難である。そこで、本生物の1.数細胞を全ゲノム増幅試薬に供し、どの程度その核ゲノムが解読できるか確かめることを目的とし、研究を行った。結果、ハテナ複数細胞を用いた場合、ハテナ由来の配列を得ることに成功したが、得られた配列のうちの約9割が2.4塩基の繰り返し配列であった。残りの約1割の配列に対し、BLASTxを行った結果、ハテナ由来と思われる配列が得られたが、この情報量ではハテナの核ゲノム全体をカバーするには非常に難しく、さらなる条件検討が必要であると判断した。

研究成果

• [雑誌論文] Symbiotic Chlorella vulgaris of the ciliate Paramecium bursaria plays an important role in maintaining perialgal vacuole membrane functions (2011)
  • 著者名/発表者名: Y Kodama, I Inouye & M Fujishima
  • 雑誌名: Protist 巻: 162 ページ: 288-303
  • DOI: DOI:10.1016/j.protis.2010.06.005
  • 査読あり
• [雑誌論文] Speroid bodies in rhopalodiacean diatoms were derived from a single endosymbiotic cyanobacterium (2011)
  • 著者名/発表者名: T Nakayama, Y Ikegami, T Nakayama, K Ishida, Y Inagaki & I Inouye
  • 雑誌名: J. Plant. Res 巻: 124 ページ: 93-97
  • DOI: DOI:10.1007/s10265-010-0355-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Green-colored plastids in the dinoflagellate genus Lepidodinium are of core chlorophyte origin (2011)
  • 著者名/発表者名: T Matsumoto, F Shinozaki, T Chikuni, A Yabuki, K Takishita, M Kawachi, T Nakayama, I Inouye, T Hashimoto & Y Inagaki
  • 雑誌名: Protist 巻: 162 ページ: 268-276
  • DOI: DOI:10.1016/j.protis.2010.07.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Taxonomy and phylogeny of a new kleptoplastidal dinoflagellate, Gymnodinium myriopyrenoides sp. nov. (Gymnodiniales, Dinophyceae), and its cryptophyte symbiont (2011)
  • 著者名/発表者名: H Yamaguchi, T Nakayama, A Kai & I Inouye
  • 雑誌名: Protist 巻: 162 ページ: 650-667
  • DOI: DOI:10.1016/j.protis.2011.01.002
  • 査読あり
• [雑誌論文] Taxonomy of Nephroselmis viridis sp. nov. (Nephroselmidophyceae, Chlorophyta), a sister marine species to freshwater (2010)
  • 著者名/発表者名: H Yamaguchi, S Suda, T Nakayama, RN Pienaar & I Inouye
  • 雑誌名: N. olivacea. J. Plant Res 巻: 124 ページ: 49-62
  • DOI: DOI:10.1007/s10265-010-0349-y
  • 査読あり
• [学会発表] 渦鞭毛藻に見られる現在進行中の共生現象 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山口晴代, 井上勲
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2011年度連合大会
  • 発表場所: 幕張メッセ
  • 年月日: 2011-05-26
• [学会発表] 藻類から見た地球進化と地球環境 (2011)
  • 著者名/発表者名: 井上勲
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合大会2011年度連合大会
  • 発表場所: 幕張メッセ
  • 年月日: 2011-05-26
• [学会発表] NBRP「藻類」:未来を支える藻類リソース (2010)
  • 著者名/発表者名: 笠井文絵, 川井浩史, 井上勲, 中山剛, 河地正伸, 中山卓郎, 石渡邉信, 山岸隆博, 石田健一郎, 渡邉信
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸国際会議場
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] NBRP「藻類」:日本における藻類の収集・保存・提供.ナショナルバイオリソースプロジェクトの活動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 河地正伸, 川井浩史, 井上勲, 中山剛, 石田健一郎, 渡邉信, 羽生田岳昭, 山岸隆博, 甲斐厚, 中山卓郎, 笠井文絵
  • 学会等名: 第62回日本工学会大会
  • 発表場所: 宮崎市シーガイヤ
  • 年月日: 20101027-29
• [学会発表] Hatena arenicolaは近縁な複数種のNephroselmisを共生体とする (2010)
  • 著者名/発表者名: 山口晴代, 中山剛, 井上勲
  • 学会等名: 第74回日本植物学会
  • 発表場所: 中部大学
  • 年月日: 2010-09-11