| 研究課題/領域番号 |
22K15093
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| 研究機関 | 早稲田大学 |
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研究代表者 |
曽 超 早稲田大学, 理工学術院総合研究所(理工学研究所), 次席研究員(研究院講師) (80822460)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| キーワード | R-loop |
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| 研究実績の概要 |
今年度、数十の生物種から約2,000個のR-loopのシーケンシングデータセットを収集し、一部のデータセットのリードマッピングとピークコーリング解析を完了しました。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
R-loopのシーケンシングデータの解析パイプラインを作成し、約600個のデータを解析できた。
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| 今後の研究の推進方策 |
今年度の解析結果をR-loopデータベースに統合した上、リピートエレメントとR-loop形成の関連を解析します。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
当初、令和4年度計画では、Rloopの同定を行うにあたり、大規模な実験データの解析を行う予定であった。しかし、研究過程で公開された実験データの取得と整理は予想以上の時間がかかるため、データ解析用の計算機購入費用を計上する。また，国内外の学会参加費も支出予定である。
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