高精度時系列プロテオミクスによるシグナル伝達攪乱機構のシステム解析

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23510254
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 尾山 大明 東京大学, 医科学研究所, 准教授 (30422398)
• 研究分担者: 秦 裕子 東京大学, 医科学研究所, 技術専門職員 (80401256)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• キーワード: プロテオミクス / シグナル伝達 / システムバイオロジー / リン酸化 / 定量生物学

研究概要

シグナル伝達系は細胞の増殖・分化等の基本的な生命活動を制御しており、その破綻は癌をはじめとする種々の疾患の発症と密接に関連することが知られている。本研究課題において、我々はタンパク質安定同位体標識（SILAC）法と高精度nanoLC-MS/MS型質量分析システムを用いてピロリ菌感染応答における胃癌細胞内シグナル伝達系のシステム解析を行い、感染応答によるリン酸化プロテオームの時系列動態情報、並びに病原因子CagAの包括的結合蛋白質情報を取得した。

研究成果

• [雑誌論文] Rice-based oral antibody fragment prophylaxis and therapy against rotavirus infection (2013)
  • 著者名/発表者名: Tokuhara D, Alvarez B, Mejima M, Hiroiwa T, Takahashi Y, Kurokawa S, Kuroda M, Oyama M, Kozuka-Hata H, Nochi T, Sagara H, Aladin F, Marcotte H, Frenken LG, Iturriza-Gomara M, Kiyono H, Hammarstrom L, and Yuki Y
  • 雑誌名: J. Clin. Invest 巻: 123 ページ: 3829-3838
  • DOI: 10.1172/JCI70266
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphoproteomics-based characterization of cancer cell signaling networks (2013)
  • 著者名/発表者名: Kozuka-Hata H, Goto Y, and Oyama M
  • 雑誌名: In Oncogenomics and Cancer Proteomics - Novel Approaches in Biomarkers Discovery and Therapeutic Targets in Cancer (ed. Cesar Lopez-Camarillo and Elena Arechaga-Ocampo), InTech ページ: 185-206
  • DOI: 10.5772/52915
  • 査読あり
• [雑誌論文] FBXL21 regulates oscillation of the circadian clock through ubiquitination and stabilization of cryptochromes (2013)
  • 著者名/発表者名: Hirano A, Yumimoto K, Tsunematsu R, Matsumoto M, Oyama M, Kozuka-Hata H, Nakagawa T, Lanjakornsiripan D, Nakayama KI, and Fukada Y
  • 雑誌名: Cell 巻: 152 ページ: 1106-1118
  • DOI: 10.1016/j.cell.2013.01.054
  • 査読あり
• [雑誌論文] p47 negatively regulates IKK activation by inducing the lysosomal degradation of polyubiquitinated NEMO (2012)
  • 著者名/発表者名: Shibata Y, Oyama M, Kozuka-Hata H, Han X, Tanaka Y, Gohda J, and Inoue J
  • 雑誌名: Nat. Commun 巻: 3 ページ: 1061
  • DOI: 10.1038/ncomms2068
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphoproteome of human glioblastoma initiating cells reveals novel signaling regulators encoded by the transcriptome (2012)
  • 著者名/発表者名: Kozuka-Hata H, Nasu-Nishimura Y, Koyama-Nasu R, Ao-Kondo H, Tsumoto K, Akiyama T, and Oyama M
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7 ページ: e43398
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0043398
  • 査読あり
• [雑誌論文] Global proteome analysis of glioblastoma stem cells by high-resolution mass spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Kozuka-Hata H, Nasu-Nishimura Y, Koyama-Nasu R, Ao-Kondo H, Tsumoto K, Akiyama T, and Oyama M
  • 雑誌名: Current Topics in Peptide & Protein Research 巻: 13 ページ: 1-47
  • URL: http://www.researchtrends.net/tia/abstract.asp?in=0&vn=13&tid=26&aid=3579&pub=2012&type=3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tks5-dependent formation of circumferential podosomes/invadopodia mediates cell-cell fusion (2012)
  • 著者名/発表者名: Oikawa T, Oyama M, Kozuka-Hata H, Uehara S, Udagawa N, Saya H, and Matsuo K
  • 雑誌名: J. Cell Biol 巻: 197 ページ: 553-568
  • DOI: 10.1083/jcb.201111116
  • 査読あり
• [雑誌論文] F-type proton-translocating ATPase, at the plasma membrane is critical for efficient influenza virus budding (2012)
  • 著者名/発表者名: Gorai T, Goto H, Noda T, Watanabe T, Kozuka-Hata H, Oyama M, Takano R, Neumann G, Watanabe S, and Kawaoka Y. F1Fo-ATPase
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 巻: 109 ページ: 4615-4620
  • DOI: 10.1073/pnas.1114728109
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphoproteomics-based systems analysis of signal transduction networks (2011)
  • 著者名/発表者名: Kozuka-Hata H, Tasaki S, and Oyama M
  • 雑誌名: Front. Physiol 巻: 2 ページ: 113
  • DOI: 10.3389/fphys.2011.00113
  • 査読あり
• [雑誌論文] Attenuated CagA oncoprotein in Helicobacter pylori from Amerindians in Peruvian Amazon (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki M, Kiga K, Kersulyte D, Cok J, Hooper CC, Mimuro H, Sanada T, Suzuki S, Oyama M, Kozuka-Hata H, Kamiya S, Zou QM, Gilman RH, Berg DE, and Sasakawa C
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 286 ページ: 29964-29972
  • DOI: 10.1074/jbc.M111.263715
  • 査読あり
• [学会発表] Global Characterization of the Proteome and Phosphoproteome in Human Glioblastoma Initiating Cells by High-Resolution Mass Spectrometry (2013)
  • 著者名/発表者名: Hiroko Kozuka-Hata, Ryo Koyama-Nasu, Yumi Goto, Yukiko Nasu-Nishimura, Hiroko Ao-Kondo, Kouhei Tsumoto, Tetsu Akiyama, Masaaki Oyama
  • 学会等名: HUPO 12th Annual World Congress
  • 発表場所: Pacifico Yokohama, Japan
  • 年月日: 2013-09-16
• [学会発表] SILAC-Based Quantitative Phosphoproteome Analysis of Glioblastoma Stem Cell Differentiation by High-Resolution nanoLC-MS/MS (2013)
  • 著者名/発表者名: Yuta Narushima, Hiroko Kozuka-Hata, Yumi Goto, Tomoko Hiroki, Ryo Koyama-Nasu, Kouhei Tsumoto, Tetsu Akiyama, Masaaki Oyama
  • 学会等名: HUPO 12th Annual World Congress
  • 発表場所: Pacifico Yokohama, Japan
  • 年月日: 2013-09-16
• [学会発表] ショットガンプロテオミクスが解き明かす高解像度シグナル伝達ダイナミクス (2013)
  • 著者名/発表者名: 尾山 大明、秦 裕子
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2013-09-12
• [学会発表] ショットガンリン酸化プロテオーム解析によるグリオブラストーマ幹細胞新規制御因子の同定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 秦 裕子、那須 亮、後藤 友美、西村 教子、近藤 裕子、津本 浩平、秋山 徹、尾山 大明
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] 定量プロテオミクスによるリン酸化シグナルネットワークの統合システム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 尾山 大明
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館
  • 年月日: 2011-09-24
• [学会発表] 生命システム解析を指向したプロテオミクス研究の新展開 (2011)
  • 著者名/発表者名: 尾山 大明
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ
  • 年月日: 2011-07-28
• [学会発表] ピロリ菌感染応答における宿主シグナル伝達系のシステム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 秦 裕子、鈴木 仁人、氣駕 恒太朗、田崎真哉、津本 浩平、井上 純一郎、山本 雅、笹川 千尋、尾山 大明
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ
  • 年月日: 2011-07-28