| 研究概要 |
次世代シークエンサー(Roche社454FLX Titanium)を用いたヒ素超蓄積植物の転写産物の網羅的解析行った。ヒ酸暴露有無条件下でインキュベートした後、羽片(葉)、根よりTotalRNAを調製した。Roche社454FLX Titaniumより263Mbのシークエンシングが行われた。アセンブル解析の結果10,000以上のlarge contigが得られた。Blast等の解析を行い、ヒ素を液胞輸送、または細胞外へ排出する輸送体遺伝子の候補遺伝子の情報を得た。さらに、3'フラグメントライブラリ解析により、シダ暴露有無における羽片・根各部における全発現遺伝子の定量発現解析を行った。その結果いくつかの遺伝子にヒ素暴露による、大きな発現の差異を見出した。現在発現結果の網羅的解析と輸送体候補遺伝子の詳細な解析を行っている。
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