植物の遠縁交雑後の世代で進むエピジェネティックな遺伝子発現変化

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23780011
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 独立行政法人農業生物資源研究所
• 研究代表者: 深井 英吾 独立行政法人農業生物資源研究所, 植物科学研究領域・植物共生機構研究ユニット, 特別研究員 (00570657)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• キーワード: 遠縁交雑 / エピジェネティクス / トランスポゾン / 次世代シークエンサー / トランスクリプトーム / ゲノム / ミヤコグサ

研究概要

遺伝的に遠い両親間の交雑後代では、通常のメンデル遺伝では説明できないような、エピジェネティックな遺伝子発現変動が生じると考えられている。本研究ではミヤコグサの遠縁交雑集団において、両親と比較して発現変動した転写産物を複数同定した。またその一つであるレトロトランスポゾンについて、エピジェネティックマークの1つであるDNAメチル化の変動を解析した。

研究成果

• [雑誌論文] Activation of an endogenous retrotransposon associated with epigenetic changes in Lotus japonicus: A tool for functional genomics in legumes (2013)
  • 著者名/発表者名: Eigo Fukai, Jens Stougaard, Makoto Hayashi
  • 雑誌名: The Plant Genome 巻: (Accepted)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Establishment of a Lotus japonicus gene tagging population using the exon-targeting endogenous retrotransposon LORE1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Eigo Fukai, Takashi Soyano, Yosuke Umehara, Shinobu Nakayama, Hideki Hirakawa, Satoshi Tabata, Shusei Sato, Makoto Hayashi
  • 雑誌名: The Plant Journal 巻: 69 ページ: 720-730
  • DOI: DOI:10.1111/j.1365-313X.2011.04826.x.
  • 査読あり
• [学会発表] ミヤコグサの種間交雑RIL集団におけるレトロトランスポゾンの活性化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 深井英吾, Niels Sandal, 吉川学, 平川英樹, 梅原洋佐, 河内宏, 佐藤修正, Jens Stougaard, 廣近洋彦, 林誠
  • 学会等名: 日本育種学会第123回講演会
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 2013-03-27
• [学会発表] ミヤコグサの種間交雑RIL集団におけるレトロトランスポゾンの活性化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 深井英吾, Niels Sandal, 吉川学, 平川英樹, 梅原洋佐, 河内宏, 佐藤修正, Jens Stougaard, 廣近洋彦, 林誠
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会 第54回
  • 発表場所: 岡山大学
  • 年月日: 2013-03-22
• [学会発表] Establishment of a Lotus japonicus gene tagging population using the endogenous retrotransposon LORE1. (2012)
  • 著者名/発表者名: Eigo Fukai, Takashi Soyano, Yosuke Umehara, Shinobu Nakayama, Satoshi Tabata, Shusei Sato, Makoto Hayashi
  • 学会等名: VI International conference on Legume Genomics and Genetics
  • 発表場所: Hyderabad, India
  • 年月日: 2012-10-10
• [学会発表] 内在性レトロトランスポゾンLORE1によるマメ科モデル植物ミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 深井英吾, 征矢野敬, 梅原洋佐, 中山しのぶ, 平川英樹, 田畑哲之, 佐藤修正, 林誠
  • 学会等名: 日本育種学会第121回講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学
  • 年月日: 2012-03-29
• [学会発表] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 深井英吾, 征矢野敬, 梅原洋佐, 中山しのぶ, 平川英樹, 田畑哲之, 佐藤修正, 林誠
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会 第53回
  • 発表場所: 京都産業大学
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系 (2011)
  • 著者名/発表者名: 深井英吾, 征矢野敬, 梅原洋佐, 中山しのぶ, 岸田佳恵、平川英樹, 田畑哲之, 佐藤修正, 林誠
  • 学会等名: 植物微生物研究会第21回研究交流会
  • 発表場所: 岡山大学
  • 年月日: 2011-09-20
• [備考] 所属研究室のウェブサイト
  • URL: http://www.nias.affrc.go.jp/org/DivPlant/Symbiosis/