全ゲノム解析を用いたHPV16関連中咽頭癌におけるHPVの亜系統の分布解明と予後との相関

2023 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 23K08962
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 岸川 敏博 大阪大学, 大学院医学系研究科, 招へい教員 (20756944)
• 研究分担者: 佐々 暢亜 大阪大学, 医学部附属病院, 医員 (90882241)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• キーワード: HPV16関連中咽頭癌

研究実績の概要

2023年4月までに研究に参加している多施設よりHuman papillomavirus（HPV）16関連中咽頭癌296例、延べ341の腫瘍検体を収集した。各検体からDNAを抽出し、それらを用いてHPV16 マルチプレックスPCRを実施した。得られたHPV16ゲノムを増幅したPCR産物を用いて次世代シーケンサーによるHPV全ゲノム解析を実施した。引き続き多施設で集積したHPV16関連中咽頭癌127例127検体を用いて同様にHPV全ゲノム解析を実施した。クオリティの保たれた465検体のシークエンスデータを用いて系統解析を実施し、日本における中咽頭癌関連HPVの系統分布を明らかにした。また、メタデータが集積可能な約380例を用いた予後解析を実施している。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

予定より早く、目標とした300例以上のHPV16関連中咽頭癌のHPV16ゲノムDNAを集積し、解析を開始できている。

今後の研究の推進方策

現段階で集積したシークエンスデータについて解析を行うことで2024年度中の論文投稿、学会発表を目指す。